Elektronová mikroskopie sinic a řas - MB120C12

• Anglický název: Electron microscopy of algae and cyanobacteria
• Český název: Elektronová mikroskopie sinic a řas
• Zajišťuje: Katedra botaniky (31-120)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2025
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/1, Z [TS]
• Počet míst: 10
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu; předmět má cyklickou výuku
• Garant: doc. RNDr. Yvonne Němcová, Ph.D.
• Třída: SEM s vysokým rozlišením
• Prerekvizity : {jeden z předmětů MB120P183, MB120P184, MB120P10, MB120P89}

Anotace

čeština

Praktické seznámení s fixačními a zalévacími postupy vhodnými pro sinice a řasy, příprava ultratenkých řezů a metody jejich kontrastování, příprava preparátů pro skenovací elektronový mikroskop. Po domluvě lze zpracovat vlastní materiál posluchačů (kultury je nutné napěstovat s dostatečným předstihem - potřebujeme dostatek materiálu a zároveň kultury v exponenciální fázi růstu). Kurz probíhá ve 2 jednodenních a jedné dvoudenní části (ct pa 27-28.3.2025; pa 11.4.2025; pa 25.4.2025).
Letáček: https://drive.google.com/file/d/1gHNovV_Wv-7Mxav8wYt1d8PtvRT68uXw/view?usp=sharing

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (17.12.2024)

angličtina

Please note, the lectures are given in Czech language only. The aim of this course is to introduce fixation and embedding protocols used for algae and cyanobacteria. Preparation and contrasting of ultra-thin sections is demonstrated.

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (09.11.2018)

Literatura

Doporučená literatura:

Glauert, A. M. 1984: Fixation, Dehydratation and Embedding of Biological Speciments. North-Hollond Publishing Company, Amsterdam

Lewis, P. R. and Knight, D. P. 1992:Cytochemical Staining Methods for Electron Microscopy. Elsevier, London

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (21.05.2018)

Požadavky ke zkoušce

Podmínkou zápočtu je učast na všech částech praktického kurzu, příprava krátké prezentace a test (rozpoznání hlavních řasových skupin na základě ultrastruktury).

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (14.12.2022)

Sylabus

Způsoby kultivace sinic a řas; fixace glutaraldehydem, oxidem osmičelým, simultánní fixace, příklady fixačních postupů, odvodnění a převod do zalévacího média (Spurr), zalévací protokoly; příprava sítěk s formvarovou blankou, uhlíkování sítěk; příprava skleněných nožů, práce s ultramikrotomem Ultracut Reichert-Jung,zhotovení ultratenkých řezů, kontrastování řezů, prohlížení v EM, příprava vzorků pro SEM, prohlížení vzorků.

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (21.05.2018)

Výsledky učení

čeština

Po absolvování praktika je student schopen:

1. Vysvětlit princip TEM a SEM a základní kroky přípravy biologického materiálu pro elektronovou mikroskopii.
2. Dodržovat laboratorní a bezpečnostní pravidla při práci s fixačními a kontrastovacími činidly a přístroji.
3. Provést pod vedením základní postupy: fixaci, odvodnění, zalévání do pryskyřice, přípravu formvarových blanek, přípravu vzorků pro TEM/SEM a práci s mikrotomem.
4. Rozpoznat a popsat klíčové ultrastruktury hlavních skupin: Chlorophyta, fotosyntetizující Alveolata; sinice; Glaucophyta; skupiny s nukleomorfem; ruduchy a fotosyntetizující Stramenopiles.
5. Interpretovat získané snímky EM a porovnat ultrastrukturu skupin v evolučním a funkčním kontextu (primární vs. sekundární endosymbióza).
6. Zpracovat a prezentovat ve skupině odbornou prezentaci ultrastruktury přidělené skupiny organismů.

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (07.01.2026)

angličtina

After completing the practical course, the student is able to:

1. Explain the principles of TEM and SEM and the basic steps of biological sample preparation for electron microscopy.
2. Follow laboratory and safety rules when working with fixatives, contrast agents and instrumentation.
3. Carry out, under supervision, key laboratory procedures: fixation, dehydration, embedding in resin, preparation of formvar films, preparation of samples for TEM/SEM and operation of the microtome.
4. Recognize and describe key ultrastructures of the main groups: Chlorophyta;  photosynthetic Alveolata; cyanobacteria; Glaucophyta; lineages with a nucleomorph; red algae; photosynthetic Stramenopiles.
5. Interpret EM images and compare ultrastructure across groups in an evolutionary and functional context (primary vs. secondary endosymbiosis).
6. Prepare and present a group presentation on the ultrastructure of the assigned algal group.

Poslední úprava: Němcová Yvonne, doc. RNDr., Ph.D. (07.01.2026)