Seznámení studentů se striktními i potenciálně patogenními humánními mikroby, patogenezou onemocnění, která vyvolávají, diagnostickými postupy k jejich průkazu, možnostmi léčby a prevence těchto infekcí. V praktické části je kladen důraz na poznání algoritmu práce mikrobiologické laboratoře při vyšetření.
Poslední úprava: Kolářová Jana (12.02.2020)
Literatura
Povinná:
Kolářová Libuše et al.. Obecná a klinická mikrobiologie. Praha: Galen, 2020, s. ISBN ISBN 978-80-7492-477.
Goering, Richard V., Dockrell, Hazel M., Zuckerman, Mark, Roitt, Ivan M, Chiodini, Peter L. Mimsova lékařská mikrobiologie. Praha: Stanislav Juhaňák - Triton, 2016, 568 s. ISBN 978-80-7387-928-0.
Votava, Miroslav. Lékařská mikrobiologie - vyšetřovací metody. Brno: Neptun, 2010, 495 s. ISBN 978-80-86850-04-7.
Doporučená:
Zima, Tomáš. Laboratorní diagnostika. Praha: Galén, 2013, 1146 s. ISBN 978-80-7492-062-2.
Carey, Roberta B. Schuster, Mindy Gail McGowan, Karin L.. Lékařská mikrobiologie v klinických případech. Praha: Triton, 2011, 321 s. ISBN 978-80-7387-480-3.
Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S. Pfaller, Michael A.. Medical microbiology. Philadelphia: Elsevier/Saunders, 2013, 874 s. ISBN 978-0-323-08692-9.
Goering, Richard V., Dockrell, Hazel M., Zuckerman, Mark A., ROITT, Ivan M, Chiodini, Peter L. (eds.). Mims' medical microbiology. : Elsevier Health Sciences, 2013, 565 s. ISBN 978-0-8089-2440-1.
Greenwood, David, (ed.). Medical microbiology : a guide to microbial infections: pathogenesis, immunity, laboratory diagnosis and control. Edinburgh: Elsevier, 2012, 778 s. ISBN 978-0-7020-4089-4.
Hurych J., Štícha R. et al. . Lékařská mikrobiologie - Repetitorium. Praha : Stanislav Juhaňák - TRITON, 2020, 621 s. ISBN 078-80-7553-844-4.
Julák, Jaroslav. Úvod do lékařské bakteriologie. Praha: Univerzita Karlova v Praze, nakladatelství Karolinum, 2015, 404 s. ISBN 978-80-246-3210-0.
Poslední úprava: PETRICKO/NATUR.CUNI.CZ (07.09.2022)
Metody výuky
A. Přednášky
Velká posluchárna Purkyňova ústavu (čtvrtek 14:30-16:00).
Účast na přednáškách je nepovinná. Dostatečná účast však osvobodí studenta od povinnosti psát závěrečný zápočtový test. Za tím účelem se účast registruje pomocí čteček ISIC karet (viz část Požadavky ke zkoušce / ZÁPOČET).
B. Praktika
Pro úspěšné absolvování praktik jsou nezbytné znalosti z praktik Mikrobiologie I. Tyto budou ověřovány před začátkem praktik formou vstupního on-line testu.
V týdnu před konáním praktik (pondělí 9:00 - neděle 23:59) je student povinen splnit vstupní test umístěn v Moodle pod názvem VSTUPNÍ TEST PRO PRAKTIKA MIKRO 2.
Předmětem testu budou pouze znalosti z praktik Mikrobiologie 1. Test obsahuje 15 otázek, pro splnění je nutná alespoň 85% úspěšnost, časový limit 20 minut.
Test student zpracovává v rámci přípravy doma. Počet opakování testu není omezen, vyžadujeme ale jeho úspěšné splnění právě v týdnu před praktikem. Cílem je efektivně zopakovat a upevnit znalosti nutné pro samostatné zpracování klinických vzorků v praktiku Mikrobiologie 2.
Detailní instrukce naleznete v SIS (dokument "PRAKTIKA - vstupní test instrukce 2026").
Prosím, naplánujte si na test dostatek času pro případ nutnosti jej opakovat. Bez úspěšného absolvování testu v určeném období nebude student přijat do praktik.
II. Náplň PRAKTICKÉ VÝUKY
Studenti obdrží sadu anamnéz pacientů, se kterými v průběhu týdne nacvičí základní diferenciálně-diagnostickou rozvahu, volbu vhodných postupů k identifikaci mikrobiálních původců popsaných obtíží, provedou mikrobiologická vyšetření dodaných klinických vzorků, zváží relevanci získaných výsledků z klinického pohledu a navrhnou vhodnou terapii. V průběhu týdne studenti postupují dle rutinního algoritmu mikrobiologické laboratoře s použitím kultivace, mikroskopie, základních diagnostických testů k průkazu virů, bakterií, mikromycét a parazitů, a testů na určení citlivosti mikroba k antimikrobiálním látkám.
III. Organizace PRAKTICKÉ VÝUKY
MÍSTO
Praktika probíhají v prostorech Ústavu lékařské mikrobiologie (Studničkova 7, zvýšené přízemí v zadní části budovy). Kvůli probíhajícím stavebním pracím v blízkosti budovy je vstup na praktika veden suterénem budovy, trasa je značena od hlavního vchodu do budovy (vstup ze společného dvora ÚLM a FÚ, ne přímo z ulice). K průchodu suterénem je potřebný průkaz studenta.
ČAS
Praktika probíhají blokově, 1 týden od pondělí do pátku v čase 14:30 - 18:15 h. První blok praktik probíhá ve druhém výukovém týdnu ZS, tj. od 5. 10. 2025.
Závazné rozdělení studentů do jednotlivých bloků a laboratoří je k dispozici v SIS (dokument "PRAKTIKA - rozpis studentu 2026"). Povinností studenta je zjistit a dodržet svůj přidělený termín výuky. Kapacita všech bloků je naplněna, případné přesuny k jiným blokům (jiný termín, jiná laboratoř) budou umožněny jen ze závažných a řádně doložených důvodů, zejm. zdravotních, za následujících podmínek:
Nepřítomnost na praktiku v přiděleném bloku bude s předstihem oznámena e-mailem a důvod doložen (před začátkem praktik, max. v pondělí do 13:00, praktika.mikro@lf1.cuni.cz, doloženo lékařským potvrzením, apod.).
Po individuálním posouzení důvodu a schválení přesunu bude přidělen náhradní termín praktik dle volných kapacit.
Nevyužití přiděleného náhradního termínu bude posuzováno jako neabsolvování praktické části výuky.
Důvodem k neúčasti na praktiku v přiděleném bloku nejsou kolize s terminy nepovinných a volitelných předmětů, osobní zájmy, dobrovolné aktivity, brigády, atd.; prosíme, nepožadujte výměnu z těchto důvodů, nedokážeme vám kvůli naplněné kapacitě vyhovět.
Tolerujeme předem oznámenou (viz. první podmínka) vzájemně domluvenou výměnu dvou studentů.
VSTUP DO LABORATOŘÍ
Pro práci v laboratoři je nutné mít vlastní laboratorní plášť a obuv, které po dobu trvání praktik nesmí být bez dekontaminace používány v jiných prostorech. K uskladnění osobních věcí jsou k dispozici šatní skřínky v suterénu budovy, uzamykatelné vlastním visacím zámkem.
Do prostoru laboratoří praktik je zakázané vnášet předměty nesouvisející s výukou (tašky, penály, šály, svetry, jídlo a pití). Je doporučeno nevnášet tablety, telefony - jejich používání je na vlastní riziko (kontaminace, ztráta, ev. i poškození při případné snaze očistit přístroj dezinfekčním prostředkem).
Poslední úprava: Chanová Marta, Mgr., Ph.D. (18.09.2026)
Kontroly studia předmětu a podmínky pro jejich úspěšné vykonání, způsob hodnocení
ZÁPOČET - požadavky:
1. Úspěšné absolvování praktik
Účast na praktiku
·Podmíněna vstupním testem
·Bez pozdních příchodů:Může být tolerováno výjimečné zpoždění do 15 minut
·S dodržením podmínek absencí:
oV případě absence v první den praktik (pondělí) nebude umožněno praktikum absolvovat (v souladu s OD č. 10/2026, čl. II/3 - absolvování pondělního praktika je nezbytné k dosažení výsledků a nemůže být v případě absence nahrazeno samostudiem).
oAbsence je kvůli plánování navazujících experimentů možná po domluvě s vyučujícím, max. v jednom z následujících výukových dní z týdenního bloku praktik (úterý - pátek). Část výuky, které se student nezúčastnil, si doplňuje samostudiem v plném rozsahu a vyučující ji ověřuje - vč. případné absence v pátek.
·Aktivní: Student je v průběhu praktik orientován v řešené problematice, má přehled o postupu práce ve všech plněných úkolech, o dílčích výsledcích z předchozích dnů, umí na ně navázat v dalších úkolech, dokáže výsledky a zjištění popsat a vysvětlit ve společné diskusi, a v závěru týdenního bloku souhrnně reportuje o řešení zadaných úkolů (jaké klinické případy jste řešili, jak jste postupovali při identifikaci patogenních agens a k jakým závěrům, vč. doporučené terapie, jste došli).
Vypracování a používání protokolů: Slouží k zaznamenávání postupu práce jako podklad pro veškeré interpretace a diskuse na praktiku i pro přípravu k praktické části zkoušky, a budou průběžně kontrolované vyučujícím.
Domácí příprava dle zadání vyučujícího k probíraným tématům.
Posouzení splnění podmínek k udělení zápočtu je plně v kompetenci vyučujícího. V případě pondělní absence, absence v dalších dnech bez doplnění znalostí samostudiem, nebo při nesplnění jiných podmínek student absolvuje celé praktikum v závazně přiděleném náhradním termínu. Nevyužití přiděleného náhradního termínu bude posuzováno jako neabsolvování praktické části výuky.
2. Úspěšné absolvování zápočtového testu nebo splnění podmínek pro odpuštění zápočtového testu
Zápočtový test bude obsahovat pouze témata probíraná na přednáškách (PC místnost, Moodle prostředí, 30 otázek "single best", 30 minut, 60 % nutno pro splnění, možné jsou 3 pokusy, primárně v zápočtovém týdnu).
Pokud se zúčastníte alespoň 5 přednášek v období 1. 10. 26 - 12. 11. 26 a dalších 5 v období 19. 11. 26 - 21. 1. 27, nemusíte psát závěrečný zápočtový test.
Účast se registruje výhradně pomocí čtečky studentských čipových/ISIC karet v posluchárně, na začátku přednášky i při odchodu. Papírové seznamy ani žádosti zaslané emailem NEBUDOU brány v potaz. Doporučujeme zkontrolovat, jestli čtečka při načtení karty neblikne červeně – karta pak nemusí být správně načtena (není to časté, ale v tomto případě sdělte Vaše jméno v posluchárně vyučujícímu).
Pozn.:
Studentům, kteří mají zapsán předmět Mikrobiologie 2, ale již absolvovali praktika i zápočtový test a byl jim udělen zápočet v ak. roku 2025/2026 (ISP a jiné důvody), bude zápočet automaticky uznán (nemusí znovu absolvovat praktika, ani zápočtový test).
................................................
ZKOUŠKAse skládá po absolvování Integrovaného bloku mikrobiologie a patologie. Ověřuje znalosti získané absolvováním předmětů Mikrobiologie 1 a Mikrobiologie 2
Požadavky ke zkoušce: Student se může přihlásit ke zkoušce, pokud má zapsaný předmět Mikrobiologie 2, absolvoval praktická cvičení, má zápočet a splnil korekvizity.
Korekvizity: Biologie a genetika 2, Základy imunologie.
Místo a organizace zkoušky: Student se hlásí v Ústavu lékařské mikrobiologie, Studničkova 7, Praha 2, v pracovně přípravy praktik v prostoru laboratoří praktických cvičení. Po kontrole zápočtů a korekvizit budou přiděleni k jednotlivým zkoušejícím (výběr konkrétního zkoušejícího posluchačem není možný).
Náplň zkoušky: Skládá se z praktické (1 otázka) a teoretické části (3 otázky). K úspěšnému absolvování zkoušky nesmí být ani v jedné ze 4 otázek student hodnocen stupněm D.
OTÁZKY Z MIKROBIOLOGIE - od akademického roku 2025/26
Obsahuje následující okruhy témat z praktické výuky diagnostiky infekčních onemocnění:
1. Kultivace bakterií, mikromycetů a parazitů – Základní kultivační média, selektivní a selektivně-diagnostická média a jejich použití v identifikaci. Chromogenní média - princip a příklady aplikace. Kultivace vzorků moči. Hemokultura. Anaerobní kultivace.
2. Mikroskopie bakterií, mikromycetů a parazitů – Principy a zásady. Nejčastěji používané vzorky pro přímou mikroskopickou detekci agens. Základní barvicí techniky v mikrobiologii, mykologii a parazitologii. Typické příklady aplikace - mikrobní obraz poševní.
A1. Stavba bakteriální buňky: Buněčná stěna, vnější struktury, spory.
A2. Růst a množení bakteriální populace. Typy bakteriálního metabolismu a jeho produkty.
A3. Přirozená mikrobiota člověka a její regulace. Biofilm.
A4. Patogenita a faktory virulence bakterií. Bakteriální toxiny a superantigeny.
A5. Genetická informace u bakterií a její přenos.
A6. Mechanismy přirozené i získané rezistence na antibiotika u klinicky významných bakterií.
A7. Testy citlivosti k antibiotikům, interpretace výsledků. Základní farmakokinetické a farmakodynamické parametry antibiotik (MIC, MBC, AUC/MIC, T nad MIC…).
A8. Struktura virů a virových částic.
A9. Genetická informace virů a jejich klasifikace.
A10. Průběh virové infekce hostitelské buňky a její cytopatické efekty.
A11. Virus a hostitelský organismus: Patogeneze virových infekcí, interferony.
A12. Stavba buněk mikromycetů.
A13. Lékařsky významné mikromycety: Charakteristika, přenos, mykotoxikózy.
A14. Lékařsky významní prvoci: Charakteristika a jejich přenos.
A15. Lékařsky významní helminté: Charakteristika a jejich přenos.
A16. Zásady odběru klinických materiálů.
A17. Principy a mechanizmy specifické a nespecifické imunity.
A18. Přenos nákaz: způsoby a mechanismy šíření infekčních agens.
A19. Kultivace bakterií a diagnostika bakteriálních infekcí, jejich limitace a příklady využití. Průkaz toxinů.
A20. Diagnostika virových infekcí.
A21. Diagnostika mykotických infekcí.
A22. Diagnostika parazitárních infekcí.
A23. Sérologické vyšetření klinických materiálů: Principy základních metod, jejich výhody a limity.
A24. Metody přímého průkazu agens v diagnostice infekčních onemocnění.
A25. Beta-laktamová antibiotika: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A26. Makrolidy, linkosamidy, tetracykliny, chloramfenikol: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A27. Chinolony: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A28. Aminoglykosidy: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A29. Glykopeptidová antibiotika: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A30. Antivirotika. Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
