PředmětyPředměty(verze: 945)
Předmět, akademický rok 2023/2024
   Přihlásit přes CAS
--:--
 
 Hledání ... Vyučující Katedry Třídy Klasifikace Prohlížení dle oborů/plánů Nastavení
 
 
 
 Detail
 
 
 
 
Mikrobiologie - GB194
Anglický název: Microbiology
Zajišťuje: Katedra biologických a lékařských věd (16-16150)
Fakulta: Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
Platnost: od 2021
Semestr: letní
Body: 0
E-Kredity: 6
Způsob provedení zkoušky: letní s.:ústní
Rozsah, examinace: letní s.:32/14, Z+Zk [HS]
Počet míst: neomezen / 75 (neurčen)
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Kompetence:  
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Způsob výuky: prezenční
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Vysvětlení: (ZB prez.1.r.)
Poznámka: odhlásit z termínu zkoušky při nesplněné rekvizitě
předmět je možno zapsat mimo plán
povolen pro zápis po webu
Garant: RNDr. Klára Konečná, Ph.D.
Korekvizity : GB275
Je prerekvizitou pro: GB067, GB197
Anotace -
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)
Předmět mikrobiologie je součástí biologických disciplín, poskytující základní poznatky o biologii, morfologii, metabolismu, genetice a patogenitě mikroorganismů. Důraz v tomto předmětu je primárně kladen na podstatné aspekty vztahu mikroorganismus - hostitel - prostředí a ovlivnění tohoto vztahu antimikrobními látkami. Student během studia tohoto předmětu získá přehled o různých mikrobiálních entitách. Dále bude obeznámen s problematikou antimikrobní terapie. Mimo jiné, bude obeznámen s klinicky nejdůležitějšími původci infekčních onemocnění a se základními technikami průkazu mikrobiálních činitelů v mikrobiologických laboratořích. Cílem výuky je připravit studenty rozvíjet získané poznatky při dalším studiu a aplikovat je ve zdravotnické praxi.
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)

Podmínky pro udělení zápočtu:

  • Žádná neomluvená absence na praktických cvičeních z mikrobiologie -blíže specifikováno ve složce Studijní materiály. 
  • Průměrná známka z protokolů méně/rovno 2.0. Protokoly odevzdané nejpozději do konce měsíce června.
  • Úspěšně absolvovaný zápočtový test.

Podmínky zkoušky z mikrobiologie:

  • Získaný zápočet z praktických cvičení.
  • Úspěšné absolvování zkouškového testu (20 otázek + esej/vypisovací otázky).
  • Ústní část zkoušky.
Literatura
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)

Povinná:

  • Buchta, Vladimír, Horáček, Jiří Horák, Vladimír, Jílek, Petr. Základy mikrobiologie a parazitologie pro farmaceuty. Praha: Karolinum, 1998, 192 s. ISBN 80-7184-565-5.

  • Jílek, Petr, Förstl, Miroslav, Buchta, Vladimír, Kubanová, Petra. Úvod do mikrobiologických vyšetřovacích metod ve zdravotnictví. Praha: Karolinum, 2002, 104 s. ISBN 80-246-0459-0.

  • Votava, Miroslav. Lékařská mikrobiologie obecná. Brno: Neptun, 2001, 247 s. ISBN 80-902896-2-2.

  • Goering, Richard V. Dockrell, Hazel M. Zuckerman, Mark A. Chiodini, Peter L.. Lékařská mikrobiologie. Praha: Stanislav Juhaňák - Triton, 2016, 568 s. ISBN 978-80-7387-928-0.

Doporučená:

  • Votava, Miroslav. Lékařská mikrobiologie. Brno: Masarykova univerzita, 2000, 309 s. ISBN 80-210-2272-8.

  • Votava, Miroslav. Lékařská mikrobiologie speciální. Brno: Neptun, 2003, 495 s. ISBN 80-902896-6-5.
Sylabus -
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)

Úvod do mikrobiologie, historické milníky, vztah člověka vs. mikrobi 

Základní rozdělení antimikrobních látek 

Antibiotika 

Rezistence k antibiotikům

Mikrobiální genetika

Mikrobiální fyziologie, morfologie a metabolismus prokaryot 

Úvod do farmaceutické mikrobiologie

Lékařsky významné grampozitivní bakterie 

Lékařsky významné gramnegativní bakterie 

Lékařsky významné acidorezistentní bakterie 

Sexuálně přenosné onemocnění 

Parazitologie- parazitičtí prvoci a červi 

Úvod do mykologie a virologie

Úvod do vyšetřovacích metod v mikrobiologické laboratoři

- dezinfekce, předsterilizační příprava, sterilizace, stěrové metody

- mikroskopické techniky, nativní a barvený preparát

- kultivace, podmínky kultivace, typy kultivačních půd, využití kultivačních půd

- testování citlivosti mikroorganismů vůči antimikrobním látkám

- laboratorní diagnostika gram-pozitivních, gram-negativních bakterií

- laboratorní diagnostika mykotických agens

- laboratorní diagnostika parazitárních agens

- metody identifikace mikrobiálních původců

 

 

 
Studijní opory -
Metody výuky -
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)

přednášky, PPT prezentace

semináře - diskuse na dané téma

praktická cvičení - úvod do základních technik využívaných v mikrobiologické laboratoři 
Požadavky ke zkoušce -
Poslední úprava: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. (16.02.2024)

Znalosti oboru dané oporami uvedenými v rámci sylabu předmětu

 

Okruhy ke zkoušce z předmětu Mikrobiologie

Obecná mikrobiologie

1.       Obor mikrobiologie, disciplíny – speciální/aplikované mikrobiologické vědy.

2.       Role mikroorganismů v přírodě – ekologická role, role v lékařství.

3.       Využití mikroorganismů člověkem – potravinářství, biotechnologie, bioremediace.

4.       Mikrobi – metabolismus a vztah ke kyslíku - fotoautotrof, fotoheterotrof, chemoautotrof, chemoheterotrof, striktní aerob, anaerob, fakultativní anaerob, …, (zdroj energie, zdroj uhlíku, příklady).

5.       Růstová křivka a faktory ovlivňující růst.

6.       Role bakterií v ekosystémech – destruent, saprofyt, parazit, patogen. Vztahy mezi organismy – symbióza, komensalismus, mutualismus, parazitismus.

7.       Klasifikace mikroorganismů, klasifikační skupiny – sestupný/vzestupný přehled, binomická nomenklatura.

8.       Srovnání prokaryotické a eukaryotické buňky - bakterie, mykobakterie, mykotická agens (stavba buňky, buněčná stěna, cytoplazmatická membrána, genetika, rozmnožování).

9.       Archebakterie – jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus.

10.   Bakterie  - jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus, ekologická role.

11.   Eukaryota, eukaryotní mikro/organismy – jejich obecná charakteristika - velikost, stavba buňky, ekologická role.

12.   Mykotická agens – stavba buňky (cytoplazmatická membrána, buněčná stěna), metabolismus, růst hub – blastospora, mycelium, hyfa, dimorfismus; role v ekosystému, onemocnění (mycetismus, mykotoxikóza, mykoalergie, mykóza, dermatomykóza, endemické mykózy, oportunní mykózy).

13.   Viry – obecná charakteristika, struktura, reprodukce, klasifikace (DNA viry, RNA viry, symetrie kapsidy, obal), bakteriofág – charakterizace, využití pro genové inženýrství, fágová terapie, lyzogenní konverze.

14.   Patogeneze virových infekcí – lytický, lyzogenní cyklus, transformace.

15.   Priony – obecná charakteristika.

16.   Hypotéza spontánní generace, teorie biogeneze.

17.   A. van Leeuwenhoek, L. Pasteur, R. Koch, J. Lister, E. Jenner, A. Fleming a jejich přínos pro mikrobiologii.

18.   Genetika bakterií – chromozom, plazmid, transpozon, genotyp, fenotyp, DNA polymeráza, operon, mutace.

19.   Parasexuální procesy u bakterií – transformace, transdukce, konjugace.

20.   Obligátní vs. oportunní patogen/parazit, intracelulární parazit.

21.   Přenos infekčních agens – přímá cesta, nepřímá cesta, vektor, antropozoonóza, zoonóza.

22.   Infekce (inaparentní, latentní, manifestativní), anatomické lokalizace infekce, fáze infekce.

23.   Obrana hostitele před infekcí – mechanické, chemické, imunitní, ekologické bariéry.

24.   Patogeneze, faktory virulence  - adhesiny, enzymy, toxiny, dimorfismus.

25.   Rezistence – primární, sekundární, klinická rezistence, mikrobiologická rezistence, multirezistence, polyrezistence, zkřížená/sdružená rezistence, přenos genů kódujících rezistenci, molekulární mechanismy rezistence  - inaktivace, alterace cílové struktury, změna permeability.

26.   Určování citlivosti na antimikrobní látky in vitro  - diskový difúzní test, E-test, mikrodiluční bujónový test – MIC, MBC.

Klinická mikrobiologie

27.   Klinicky významné Gram pozitivní koky  - St. aureus, St. epidermidis, … (morfologie, kataláza, plazmakoaguláza, hemolýza, produkce toxinů, enzymů, infekce), MRSA, VRSA.

28.   Klinicky významné Gram pozitivní koky – streptokoky, enterokoky, dělení streptokoků do skupin dle hemolýzy, dle antigenní struktury, dle patofyziologie, Streptococcus pyogenes, Str. agalactiae, viridující streptokoky, Str. pneumoniae, E. faecium, E. faecalis, … (onemocnění, produkce toxinů, enzymů, léčba).

29.   Klinicky významné Gram negativní koky – meningokok, gonokok (Neisseria meningitidis, N. gonorrhoeae), onemocnění, cesta přenosu, klinický obraz, léčba, prevence, laboratorní diagnostika – oxidáza, kultivace.

30.   Klinicky významné Gram negativní bakterie  - obligátně patogenní/oportunně patogenní, rody: Salmonella, Shigella, Yersinia (onemocnění, přenos, diagnostika - sérotypizace), střevní fakultativně anaerobní bakterie – Escherichia (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC), Klebsiella, Citrobacter sp., Enterobacter sp. (onemocnění, diagnostika), aerobní Gram negativní bakterie – Pseudomonas sp., Vibrio sp. (onemocnění, diagnostika).

31.   Klinicky významné spirochety: Treponema pallidum, Borrelia burgdorferi (přenos, onemocnění, léčba).

32.   Mykobakterie – tuberkulóza (původce), mykobakteriózy (původci) – onemocnění, diagnostika, léčba.

33.   Pohlavně přenosná onemocnění – syfilis, kapavka, ulcus molle, lymphogranuloma venereum, AIDS, trichomoniáza, vulvovaginální kandidóza, herpes genitalis, condylomata accuminata, pediculosis pubis, chlamydiové infekce (původce, stádia onemocnění, příznaky, terapie).

34.   Klinicky významné viry - čeleď: Poxviridae, virus varioly, virus vakcinie (přenos, formy onemocnění, prevence).

35.   Klinicky významné viry - čeleď: Herpesviridae, HSV1, HSV2, herpes virus varicellae-zosteris, cytomegalovirus, virus Epstein-Barrové (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

36.   Klinicky významné viry -  viry chřipky (přenos, antigenní shift, antigenní drift, onemocnění, léčba, prevence).

37.   Virus příušnic, zarděnek, spalniček (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

38.   Retroviry – HIV (přenos, tropismus viru, stadia onemocnění, léčba, prevence).

39.   Viry hepatitid  -HAV, HBV, HCV, HDV (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

40.   Superficiální mykózy  - infekce (pityriasis versicolor, dermatomykózy – tinea, onychomykóza, bílá/černá piedra).

41.   Subkutánní mykózy  - chromoblastomykóza, subkutánní zygomykóza, mycetom.

42.   Dimorfní houby – výskyt, onemocnění, původci.

43.   Kvasinkové infekce – Candida albicans, dimorfismus, patogeneze, rizikové faktory, onemocnění (kožní, mukokutánní, systémové), Cryptococcus neoformans – faktor virulence, onemocnění, rizikové faktory.

44.   Vláknité houby – Aspergillus spp., Mucorales - onemocnění.

45.   Prvoci jako původci onemocnění – formy (trofozoit, cysta), améby – Entamoeba histolytica, Entamoeba gingivalis, přenos, onemocnění, terapie; bičíkovci – Giardia lamblia (intestinalis), Trichomonas vaginalis, Trypanosoma gamblinese, Leishmania sp. – výskyt, přenos, onemocnění; výtrusovci  -Toxoplasma gondii – přenos, onemocnění.

46.    Krevní prvoci – Plasmodium, výskyt onemocnění, přenos, malarický záchvat (maligní, benigní terciány), laboratorní diagnostika (tlustá kapka, tenký roztěr), prevence onemocnění, léčba onemocnění. 

47.   Parazitické hlístice – stavba těla, způsoby přenosu, zástupci: Trichinella spiralis, Trichuris trichura, Strongyloides sp., měchovci, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, filárie (výskyt, přenos, onemocnění, léčba).

48.   Parazitičtí ploštěnci – stavba těla, zástupci: Taenia saginata, Taenia solium, Echinococcus granulosus (výskyt, přenos, onemocnění, léčba), motolice – Schistosoma haematobium (výskyt, přenos, onemocnění, léčba).

49.   Typy biologického materiálu (přirozeně sterilní, nesterilní).

50.   Příprava preparátů pro světelnou mikroskopii (nativní, barvený – Gram, Ziehl-Neelsen, Burry, Giemsa).

51.   Kultivace mikroorganismů  - podmínky pro kultivaci, závislost na teplotě, závislost na kyslíku, typy kultivačních médií (diagnostická půda, selektivní půda, selektivně diagnostická půda, půda pro antibiotické zkoušky – krevní, Endův, Loewenstein-Jensen agar, Mueller-Hinton, McConkey, Sabouraudův agar).

52.   Mikrobiální flóra – její role, zastoupení.

Farmaceutická mikrobiologie

53.   Antimikrobní látky, pojmy: dezinficiencia, antiseptika, konzervancia, antibiotika.

54.   Dezinficiencia/dezinfekce- definice pojmu, kategorizace dezinfekce (fyzikální, chemická), účel, vlastnosti, mechanismus účinku, použití, volba dezinficiens, příklady.

55.   Antiseptika/antisepse – definice pojmu, vlastnosti, mechanismus účinku, příklady.

56.   Dekontaminace, sanace, asepse – definice pojmů.

57.   Konzervancia/konzervace – účel, efekt, vlastnosti, použití.

58.   Faktory ovlivňující efekt antimikrobních látek.

59.   Antiinfektiva – účel využití, vlastnosti (mikrobistatický/mikrobicidní efekt), klasifikace – antivirotika, antibiotika, antimykotika, antiparazitika, anthelmintika, …).

60.   Antibiotika, chemoterapeutika – definice pojmu, použití, klasifikace (cidní/statická, úzko/širokospektrá, dle buněčného cíle, dle chemické struktury).

61.   Beta-laktamová antibiotika  - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, mechanismy rezistence – poriny, modifikace PBP, beta-laktamasa. Skupiny beta-laktamových antibiotik – penamy (příklady, účinek), cefemy (příklady, účinek), karbapenemy/monobaktamy (příklady, účinek).

62.   Inhibitory beta-laktamas – účinek, příklady.

63.   Aminoglykosidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

64.   Tetracykliny  - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

65.   Chloramfenikol – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky.

66.   Makrolidy, linkosamidy- cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

67.   Glykopeptidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky.

68.   Chinolony - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

69.   Ansamyciny/rifamyciny - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, rezistence.

70.   Nitrofurany - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

71.   Sulfonamidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

72.   Antituberkulotika – cíl působení, mechanismus účinku, příklady: pyrazinamid, isoniazid, rifampicin, ethambutol, streptomycin.

73.   Antivirotika – dělení dle mechanismu účinku, příklady: acyklovir, ganciklovir, amantadin, zidovudin, stavudin, sanquinavir, tenofovir, adefovir, ribavirin, interferony.

74.   Antimykotika – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady: polyenová – amfotericin B, nystatin; azolová – ketokonazol, flukonazol, itrakonazol, vorikonazol; echinokandiny – kaspofungin, mikafungin; alylaminy – terbinafin.

75.   Sterilita, sterilizace  - definice pojmu, sterilizační přístupy – fyzikální (suché, vlhké teplo, filtrace),  chemická cesta, záření, test sterility.

76.   Hlavní zdroje kontaminace surovin a farmaceutických produktů. Kritéria mikrobiologické nezávadnosti léků, jejich testování. Mikrobiální degradace farmaceutických přípravků.

77.   Sterilní farmaceutické produkty. Kontrola sterility a kvality farmaceutických výrobků.

78.   Aseptická příprava léků, boxy s laminárním prouděním, hygienická opatření a kontrola prostředí (správná laboratorní praxe).

 

Metodické přístupy v mikrobiologické laboratoři

 - dezinfekce, předsterilizační příprava, sterilizace, stěrové metody

- mikroskopické techniky, nativní a barvený preparát

- kultivace, podmínky kultivace, typy kultivačních půd, využití kultivačních půd

- testování citlivosti mikroorganismů vůči antimikrobním látkám

- laboratorní diagnostika gram-pozitivních, gram-negativních bakterií

- laboratorní diagnostika mykotických agens

- laboratorní diagnostika parazitárních agens

- metody identifikace mikrobiálních původců

 

 

 

 

 
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK