Základní metody buněčné a molekulární biologie - CVOL0289

• Anglický název: Basic techniques of cell and molecular biology
• Zajišťuje: Ústav biochemie, buněčné a molekulární biologie 3. LF UK (12-BIOC)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: letní
• Body: 3
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/15, Z [HS]
• Počet míst: neurčen / neurčen (12)
• Minimální obsazenost: 4
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán; povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Vlasta Němcová, Ph.D.; RNDr. Kamila Balušíková, Ph.D.
• Patří mezi: VSEOB-VP-2 (ZÁPIS); VSEOB-VP-3 (ZÁPIS); VSEOB-VP-4 (ZÁPIS); VSEOB-VP-5 (ZÁPIS); VSEOB-VP-6 (ZÁPIS); VSEOB1-VP-2 (ZÁPIS); VSEOB1-VP-3 (ZÁPIS)
• Prerekvizity : CVSE1M0001

Anotace

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (14.04.2022)

Kurz je určen zejména pro studenty, kteří mají zájem o výzkum a práci v laboratoři. Teoreticky se seznámí se základními metodami a technikami používanými v buněčné a molekulární biologii a jejich aplikacemi v medicíně. Znalost a pochopení principů a technik buněčné a molekulární biologie usnadní i studium odborné literatury týkající se diagnostiky i výzkumu v různých oblastech medicíny, např. onkologii, imunologii, hematologii a genetice.

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (14.04.2022)

minimálně 80% účast, vypracování úkolu na zadané téma v rozsahu cca 2-3 stránky A4

Sylabus

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (14.04.2022)

1. Buněčné kultury a kultivace buněk
2. Metody studia nukleových kyselin - sekvenování, Southern blot, Nothern blot, PCR, qPCR, metylační analýza, RFLP, sekvenování, FISH, ChIP, atd.
3. Metody studia proteinů - sekvenace, hmotnostní spektrometrie, protilátky, buněčná frakcionace, SDS-PAGE, Western blot, průtoková cytometrie, ELISA, imunoprecipitace, luciferázová assay, GFP, FRET, FRAP, EMSA, kolokalizace, Cre-lox systém, genový knockout, RNAi, shRNA, editace genomu-CRISPR, ZFN, TALEN, blue native PAGE, atd.
4. Metody analýzy buněčných dějů -mitochondriální membránový potenciál, ROS, hladina vápníku, apoptóza, atd.
5. „High throughput“ a „-omics“ metody - RNA sekvenování, microarrays, iTRAQ, SILAC, 2D elektroforéza, DIGE, atd.

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (14.04.2022)

minimálně 80% účast, vypracování úkolu na zadané téma v rozsahu cca 2-3 stránky A4