Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (15.09.2017)
Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod
a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v
medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální
mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky.
Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM,
CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji.
Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i
konfokálním režimu
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)
Test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury, praktická práce na mikroskopu a výstup ve formě obrázků s popisem upravených pro publikaci.
Poslední úprava: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)
Credit test using lectures, practical work on a microscope and output in the form of images with the descriptions ready for publication.
Sylabus -
Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (15.09.2017)
1 Introduction to optical microscopy and historical overview
2 Microscopic methods in bright field
3 Fluorescence microscopy
4 Spinning disc
5 Confocal laser scanning microscopy
6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet
7 FRAP, FRET, FLIM and FCS
8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS
9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan
10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD
11 Nanoscopy 2 - STED
12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5
13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5
Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (15.09.2017)
1 Introduction to optical microscopy and historical overview
2 Microscopic methods in bright field
3 Fluorescence microscopy
4 Spinning disc
5 Confocal laser scanning microscopy
6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet
7 FRAP, FRET, FLIM and FCS
8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS
9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan
10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD
11 Nanoscopy 2 - STED
12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5
13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5
Podmínky zakončení předmětu -
Poslední úprava: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)
Test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury, praktická práce na mikroskopu a výstup ve formě obrázků s popisem upravených pro publikaci.
Poslední úprava: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)
Credit test using lectures, practical work on a microscope and output in the form of images with the descriptions ready for publication.