Praktikum z genetiky prokaryot - MB140C13

• Anglický název: Practical course of genetics of prokaryotes
• Český název: Praktikum z genetiky prokaryot
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2025
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/1, Z [TS]
• Počet míst: 12
• Minimální obsazenost: 4
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Úroveň: základní
• Vysvětlení: jednotýdenní turnusové praktikum
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
• Vyučující: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.; RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.
• Prerekvizity : {jeden z předmětů MB140P33, MB140P26, MB140C88}
• Korekvizity : MB140P13

Anotace

čeština

Praktický kurz doplňuje teoretické znalosti získané na přednášce Genetika prokaryot MB140P13. Na třech úlohách budou demonstrovány vybrané základní principy a metody bakteriální genetiky: spontánní a indukovaná mutageneze, nespecifická inzerční mutageneze a práce s genomovými sekvencemi.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (15.01.2026)

angličtina

The course complements the theoretical lecture MB140P13. The three experimental tasks introduce selected principles and methods in bacterial genetics: spontaneous and induced mutagenesis, nonspecific insertional mutagenesis and conjugative mapping.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Literatura

čeština

Prezentace a protokoly s detailním popisem úloh jsou k dispozici na portálu MOODLE na stránkách příslušného předmětu.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (09.01.2024)

angličtina

E-textbook with detailed descriptions of particular experiments are available on the MOODLE portal.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Požadavky ke zkoušce

Credits are given on the basis of active partipcipation of the course and presentation protocols of experiments. Protocols should be written up by each student and should have the standard scheme: the objective, principle and task execution, results and discussion of results.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Sylabus

čeština

Úloha 1: Nespecifická inzerční mutageneze.

Cílem úlohy je pomocí inzerční inaktivace genů fágem MudI(Ap,lac) připravit auxotrofní mutanty a mutanty v genech, jejichž exprese je ovlivněna NaCl.

Úloha 2: Spontánní a indikovaná mutageneze.

Cílem úlohy je kvantifikovat spontánní mutagenní procesy B. subtilis a zhodnotit mutagenní potenciál peroxidu vodíku a ethidium bromidu.

Úloha 3: Bioinformatická analýza genomových sekvencí

Cílem úlohy je demonstrovat (vizualizovat) některé vlastnosti bakteriálních genomů (globální charakteristiky chromozomů, genomové ostrovy, plazmidy a jejich diverzita, CRISPR-Cas systémy a jejich diverzita) s využitím dostupných online nástrojů.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (17.01.2026)

angličtina

Task 1: Nonspecific insertional mutagenesis.

Task 2: Spontaneous and induced mutagenesis.

Task 3: Conjugative mapping.

 

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)

Výsledky učení

Po absolvování předmětu student:

• vysvětlí principy vybraných technik využívaných v genetice bakterií (nespecifická mutageneze, selekce mutantů, vizualizace exprese pomocí reportérovou fúzí).
• interpretuje získané experimentální výsledky a srozumitelně je zpracovává ve formě laboratorního protokolu.
• využívá základní bioinformatické nástroje a veřejné databáze pro vizualizace a jednoduché analýzy bakteriálních genomů a genetických elementů.
• dokáže zodpovědět teoretické otázky související s tématy experimentálních úloh.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (17.01.2026)