PředmětyPředměty(verze: 964)
Předmět, akademický rok 2024/2025
   Přihlásit přes CAS
Mikrobiologie II. - D1105038
Anglický název: Microbiology II.
Zajišťuje: Ústav lékařské mikrobiologie (13-323)
Fakulta: 2. lékařská fakulta
Platnost: od 2024
Semestr: zimní
Body: 4
E-Kredity: 4
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
Rozsah, examinace: zimní s.:56/0, Z+Zk [HT]
Rozsah za akademický rok: 14 [týdny]
Počet míst: neomezen / neurčen (neurčen)
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Kompetence:  
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Garant: prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Vyučující: prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Korekvizity : D1106089
Prerekvizity : D1103040, D1104339
Je korekvizitou pro: D1106089
Je prerekvizitou pro: D1108368, D1108038, D1108369, D1108004
Anotace
Jde o povinný studijní předmět, který patří mezi základní teoretické předměty profilujícího základu. Jeho absolvováním student získá znalosti a dovednosti v oblasti lékařské mikrobiologie – v popisu jednotlivých mikroorganismů a jejich vlastností, v zásadách odběru, transportu a zpracování biologického materiálu, v mechanismu účinku a působení antimikrobních látek, v obecných principech antiinfekční terapie a v poznání interakcí infekčních agens s makroorganismem, které jsou nezbytným předpokladem pro další úspěšné studium ve vyšších ročnících. V rámci předmětu si student osvojí například následující znalosti, dovednosti a kompetence: - zhodnotit laboratorní nálezy, které by mohly mít spojitost s onemocněním způsobeným mikroorganismy - abnormální počet leukocytů, abnormální výsledky analýzy stolice, okultní krvácení, nález parazitů, abnormální močový sediment, zvýšené markery zánětu - pochopit základní patologické stavy, které mohou mít přímou souvislost s působením mikroorganismu v lidském těle - např. lymfadenopatie, horečka, zimnice, svědění, otoky, edémy, hubnutí, akutní těžká bolest hlavy či meningismus - porozumět problematice nozokomiálních infekcí a jejich rizik – ATB rezistence, možnosti diagnostiky a terapie, spolupráce s epidemiologem, bariérová opatření - vnímat mechanismy šíření agens v populaci, zamezení cest přenosu, prevence - otázky týkající se imunizace jedince – očkovací plán; povinná, nepovinná očkování, doporučená očkování - použít základní klinickou rozvahu při získávání informací významných pro pacientovu léčbu. Zahrnout vědecké poznatky teoretických lékařských věd včetně epidemiologických informací (incidence, prevalence) do klinické rozvahy za účelem sestavit diferenciální diagnózu - zhodnotit závažnost obtíží pacienta, symptomů nemoci nebo situace, ve které se pacient nachází. Konzultovat s dalšími lékaři a členy týmu, aby došlo k potvrzení a schválení pracovní diagnózy, vysvětlit a zdokumentovat klinickou rozvahu, jež vedla k pracovní diagnóze; prokázat kritické myšlení vedoucí ke stanovení diferenciální diagnózy. - doporučit vstupní, nákladově efektivní diagnostickou metodu pro pacienta s akutním nebo chronickým onemocněním, nebo jako součást preventivní zdravotní prohlídky. Vyhodnotit výsledky testů a zahrnout je do diferenciální diagnózy. Pochopit důsledky a naléhavost v případě abnormálních výsledků vyšetření a v případě nutnosti požádat o pomoc s jejich výkladem.
Poslední úprava: Procházka Zdeněk (04.09.2020)
Podmínky zakončení předmětu

Zakončení předmětu M II je podmíněno úspěšně složenou ústní zkouškou. K té lze přistoupit po udělení zápočtu za zimní semestr.

1) Úspěšné absolvování písemných testů, tedy zisk minimálně 20 bodů v součtu všech tří průběžných testů. Jednotlivé testy mohou absolvovat studenti před začátkem přednášky (termíny viz dále). Náhradní termíny pro průběžné testy nejsou vypisovány. Každý z jednotlivých testů obsahuje 10 otázek, každá správně zodpovězená otázka je ohodnocena 1 bodem. Doba trvání každého jednotlivého testu je 10 minut. Pokud student nedosáhne na minimální bodové ohodnocení 20 bodů, má možnost uspět v souhrnném opravném testu v zápočtovém týdnu. Test obsahuje 30 otázek, minimum je získání 24 bodů.

Bez splnění uvedené podmínky udělení zápočtu nebude student připuštěn ke zkoušce. Zápočet má platnost jeden kalendářní rok. Neplatí pro studenty, kteří v rámci individuálního studijního plánu mají rozložený ročník.

Termíny zápočtových testů

1. test Obecná mikrobiologie 3. týden zimního semestru (Obecná bakteriologie, virologie, mykologie, parazitologie – základní pojmy, Antimikrobiální látky – přehled, mechanismy účinku i rezistence k ATB, spektrum účinku Vyšetřovací metody – přehled a rozdělení, význam, výhody a nevýhody jednotlivých metod)

2. test Speciální mikrobiologie 7. týden zimního semestru (Bakterie (G+, G- i ostatní), houby, paraziti, viry – znalosti o jednotlivých agens - klasifikace, nejvýznamnější faktory virulence, patogenita, možnosti diagnostiky a terapie)

3. test Klinická mikrobiologie 11. týden zimního semestru (Infekce nosokomiální, močové, respirační, alimentární, nervového systému, krevního řečiště – nejvýznamnější původci, metody diagnostiky, léčby i prevence)

Poslední úprava: Laušerová Romana (02.10.2024)
Literatura

Základní studijní literatura :

•Hurych J, Štícha R a kol.: Lékařská mikrobiologie - repetitorium, 3. vydání, Triton, 2021, ISBN 978-80-7553-976-2.

•Melter O et al.: The MicroBook - Clinical Microbiology for Medical Students, 1. vydání, Karolinum, 2019, ISBN 978-80-246-3871-3.

MOODLE:

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=6510

Poslední úprava: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (01.10.2024)
Požadavky ke zkoušce

Mikrobiologie II :

Pravidla:

Kombinace tří otázek ze tří okruhů:

1. Obecná mikrobiologie (okruh I.)

2. Speciální mikrobiologie (okruhy II.-IV)

3. Klinická mikrobiologie (okruh V.) a Vyšetřovací metody (okruh VI.)

I. Obecná mikrobiologie (26 otázek)

1. Složení buněčné stěny G+ a G- bakterií. Klasifikace bakterií.

2. Stavba bakteriální buňky a povrchové struktury, bakteriální spora.

3. Exotoxiny a jejich rozdělení podle mechanismu a místa účinku.

4. Bakteriální genom a jeho plasticita. Mobilní genetické elementy.

5. Stavba virových částic. Klasifikace virů.

6. Patogeneze virových infekcí.

7. Obecná mykologie. Klasifikace mikromycet.

8. Obecná parazitologie. Klasifikace parazitů.

9. Mechanismy účinku antibiotik.

10. Mechanismy rezistence k antibiotikům.

11. Rezervní antibiotika

12. Zásady racionální antibiotické terapie.

13. Penicilinová antibiotika.

14. Cefalosporiny I. až V. generace, karbapenemy

15. Glykopeptidy. Oxazolidinony (linezolid)

16. Přípravky s inhibitory betalaktamáz

17. Makrolidová a linkosamidová antibiotika.

18. Tetracykliny včetně tigecyklinu. Chloramfenikol.

19. Aminoglykosidy. Polypeptidová antibiotika (polymyxin).

20. Chinolononová antibiotika.

21. Kotrimoxazol. Metronidazol. Nitrofurantoin.

22. Antituberkulotika.

23. Virostatika včetně léčby covid-19.

24. Antimykotika.

25. Antiparazitika (s důrazem na antimalarika) vč. antiinfektiv využívaných k léčbě parazitárních infekcí.

26. Nežádoucí účinky antibiotik.

II. Speciální virologie a mykologie (19 otázek)

27. Herpesviry - HSV1, HSV2 a VZV.

28. Herpesviry - EBV, CMV a HHV-6.

29. Viry influenzy.

30. Virus parotitidy. Virus spalniček.

31. Virus zarděnek a parvovirus B19.

32. Virus vztekliny.

33. Adenoviry.

34. Rotaviry. Caliciviry.

35. Polioviry a jiné enteroviry.

36. Flaviviry způsobující encefalitidy

37. Virové hemoragické horečky.

38. Papilomaviry. Lidské patogenní poxviry.

39. RSV, viry parainfluenzy, rhinoviry.

40. SARS-CoV-2 a další koronaviry

41. Původci virových hepatitid.

42. Virus HIV a jiné retroviry.

43. Kvasinky (kandidy)

44. Vláknité mikromycety (aspergily, mukormycety, dermatofyty).

45. Cryptococcus. Pneumocystis.

III. Speciální bakteriologie (33 otázek)

46. Staphylococcus aureus.

47. Koaguláza negativní stafylokoky.

48. Streptococcus pyogenes.

49. Beta hemolytické streptokoky jiné než S. pyogenes.

50. Streptococcus pneumoniae a ústní streptokoky.

51. Enterokoky.

52. Neurotoxická klostridia.

53. Histotoxická klostridia.

54. Clostridioides difficile.

55. Bacillus anthracis a ostatní bacily.

56. Listeria monocytogenes.

57. Korynebakteria.

58. Aktinomycety a nokardie.

59. Pseudomonas aeruginosa a další G- nefermentující tyčinky.

60. Bordetelly.

61. Brucely a Francisella tularensis. Legionella pneumophila.

62. Campylobacter. Helicobacter pylori.

63. Haemophilus influenzae a ostatní hemofily.

64. Vibrio cholerae a ostatní vibria.

65. Escherichia coli. Shigely.

66. Yersinie.

67. Salmonely (Typhi, Enteritidis a další sérotypy).

68. Klebsiella. Enterobacter.

69. Citrobacter, Serratia, Proteus a Providencia.

70. Neisseria meningitidis.

71. Neisseria gonorrhoeae.

72. Anaerobní bakterie jiné než klostridia a aktinomycety).

73. Treponema pallidum.

74. Borrelie a leptospiry.

75. Rickettsie, coxielly, bartonely.

76. Chlamydie.

77. Mykoplasmata a ureaplasmata.

78. Mykobakteria.

IV. Parazitologie (11 otázek)

79. Trypanosomy a leishmanie.

80. Giardia. Cryptosporidium. Trichomonas.

81. Entamoeba a další améboidní prvoci.

82. Původci malárie.

83. Toxoplasma gondii.

84. Schistosomy.

85. Taeniae a ostatní původci střevních cestodóz.

86. Echinokoky a ostatní původci tkáňových cestodóz.

87. Enterobius a Ascaris. Ostatní původci střevních nematodóz.

88. Trichinella a další původci tkáňových nematodóz (včetně filarióz).

89. Ektoparazité.

V. Klinická mikrobiologie (18 otázek)

90. Lidský mikrobiom. Fyziologická mikrobiota.

91. Infekce horních cest dýchacích.

92. Infekce dolních cest dýchacích.

93. Průjmová onemocnění.

94. Infekce močových cest.

95. Sexuálně přenosné infekce.

96. Nehnisavé (aseptické) neuroinfekce.

97. Hnisavé meningitidy.

98. Infekce krevního řečiště. Pojem sepse.

99. Infekce spojené se zdravotní péčí (healthcare-associated infections).

100. Multirezistentní kmeny a možnosti léčby.

101. Exantémová onemocnění.

102. Infekce kůže a měkkých tkání.

103. Infekce kostí a kloubů.

104. Infekce způsobené anaerobními bakteriemi.

105. Infekce plodu a novorozence.

106. Typy očkovacích látek. Povinné očkování.

107. Doporučené očkování a očkování na žádost jedince.

VI. Vyšetřovací postupy a diagnostika (12 otázek)

108. Mikrobiologická diagnostika bakteriálních infekcí

109. Mikrobiologická diagnostika virových infekcí

110. Mikrobiologická diagnostika mykotických infekcí

111. Mikrobiologická diagnostika parazitárních infekcí

112. Mikroskopie v diagnostice infekčních onemocnění.

113. Kultivace bakterií.

114. Postupy vedoucí k identifikaci bakterií.

115. Testy citlivosti k antibiotikům. Interpretace výsledků

116. Serologické reakce (aglutinace, ELISA, WB, imunochromatografie).

117. Metody molekulární biologie a jejich výhody a nevýhody v diagnostice infekčních onemocnění.

118. PCR a jeho využití v diagnostice infekčních onemocnění (včetně režimu POCT).

119. Sekvenování a jeho využití v mikrobiologické laboratoři.

Poslední úprava: Hurych Jakub, MUDr., Ph.D. (01.10.2024)
 
Rozpis rozvrhový
Rozvrhový lístek Datum Od - Do Typ výuky Téma Učitel Soubory Poznámka
24aD1105038p1

Okruhy studentů
M3.VL
St 02.10.2024 14:25 - 16:05 přednáška Obecná virologie, metody diagnostiky ve virologii MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Čt 03.10.2024 13:30 - 15:10 přednáška Virová exantémová onemocnění MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
St 09.10.2024 14:25 - 16:05 přednáška Sekvenační techniky v mikrobiologii. Lidský mikrobiom, fyziologická mikrobiota. MUDr. Jakub Hurych, Ph.D.
Čt 10.10.2024 13:30 - 15:10 přednáška Lékařská mykologie MUDr. Daniela Lžičařová
St 16.10.2024 14:25 - 16:05 přednáška Protozoa I prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Čt 17.10.2024 13:30 - 15:10 přednáška Herpesviry + ZÁPOČTOVÝ TEST I MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
St 23.10.2024 14:25 - 16:05 přednáška Protoza II, Trematoda prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
Čt 24.10.2024 13:30 - 15:10 přednáška Cestoda, Nematoda prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
St 30.10.2024 14:25 - 16:05 přednáška Úvod do nosokomiálních infekcí, katetrové infekce, ranné infekce, nosokomiální a ventilátorové pneumonie MUDr. Václav Vaniš
Čt 31.10.2024 13:30 - 15:10 přednáška Infekce močových cest MUDr. Eliška Bébrová
St 13.11.2024 14:25 - 16:05 přednáška VK 2.LF UK - PŘEDNÁŠKA NEBUDE
Čt 14.11.2024 13:30 - 15:10 přednáška VK 2.LF UK - PŘEDNÁŠKA NEBUDE
St 20.11.2024 14:25 - 16:05 přednáška Arbovirózy; hemoragické horečky MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Čt 21.11.2024 13:30 - 15:10 přednáška "Neuroinfekce
ZÁPOČTOVÝ TEST II"
MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
St 27.11.2024 14:25 - 16:05 přednáška Intestinální sérotypy E. coli a shigelly doc. MUDr. Martina Bielaszewska, CSc.
Čt 28.11.2024 13:30 - 15:10 přednáška Infekce vyvolané Clostridioides difficile (CDI) Mgr. Marcela Krůtová, Ph.D.
St 04.12.2024 14:25 - 16:05 přednáška Infekce gastrointestinálního traktu prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
Čt 05.12.2024 13:30 - 15:10 přednáška Respirační infekce prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
St 11.12.2024 14:25 - 16:05 přednáška Respirační viry MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Čt 12.12.2024 13:30 - 15:10 přednáška Infekce krevního řečiště prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
St 18.12.2024 14:25 - 16:05 přednáška MDR bakterie a rezervní antibiotika MUDr. Otakar Nyč, Ph.D.
Čt 19.12.2024 13:30 - 15:10 přednáška "Infekce kostí a kloubů +
ZÁPOČTOVÝ TEST III"
MUDr. Václav Vaniš
St 08.01.2025 14:25 - 16:05 přednáška Infekce kůže a měkkých tkání MUDr. Anežka Gryndlerová
Čt 09.01.2025 13:30 - 15:10 přednáška Pohlavně přenosné infekce (STI) prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
St 15.01.2025 14:25 - 16:05 přednáška Virus HIV a viry hepatitid (HBV a HCV) MUDr. Petr Hubáček, Ph.D.
Čt 16.01.2025 13:30 - 15:10 přednáška Infekce v těhotenství a infekce u novorozenců prof. MUDr. Pavel Dřevínek, Ph.D.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK