Vybrané partie z biofyziky - NBCM001

• Anglický název: Selected Topics on Biophysics
• Zajišťuje: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Fakulta: Matematicko-fyzikální fakulta
• Platnost: od 2022
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: zrušen
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: doc. RNDr. Otakar Jelínek, CSc.
• Kategorizace předmětu: Fyzika > Biofyzika a chemická fyzika

Anotace

čeština

Poslední úprava: ()

Slabé chemické interakce a biologické molekuly, biologické specifita molekul, ligandy, biologické regulační mechanismy, moderní analytické metody s využitím fluorescenčních sond a značek, imunofluorescence, biosenzory.

angličtina

Poslední úprava: T_FUUK (17.05.2001)

Weak chemical interactions and their role in biomolecules, physical properties of water, hydrogen bonds, biological spcificity, conformation analysis of proteins and nucleic acids, prediction of molecular structures.

Literatura

Poslední úprava: RNDr. Pavel Zakouřil, Ph.D. (05.08.2002)

Stefen W.Hawking: Stručná historie času, Mladá fronta, Praha 1991 (str.116-138)

Julius Krempaský: Evolúcia vesmíru a prírodné vedy (Základy integrovanej prírodovedy), Slovenské pedagogické nakladatelstvo, Bratislava 1992

Zdeněk Vodrážka: Fyzikální chemie pro biologické vědy, Academia, Praha 1982

Pavel Hobza, Rudolf Zahradník: Mezimolekulové komplexy (Úloha van der Waalsových systémů ve fyzikální chemii a v biodisciplinách), Academia Praha 1988

Ch.R.Cantor, P.R.Schimmel: Biophysical Chemicstry, rusky Biofizičeskaja chimija Tom1 Mir, Moskva 1984 (str.43-147) Struktura bílkovin, (str.148-194) Struktura nukleových kyselin, (str.237-286) Konformační analýza bílkovin, (str.287-314) Konformační analýza nukleových kyselin

M.Nepraš, M.Titz: Základy teorie elektronových spekter, SNTL, Praha 1983

Sylabus

Poslední úprava: ()

Molekuly v kosmickém měřítku komplexnosti. Úloha bioprvků při vytváření struktur v organismech. Molekulární organizace biologických systémů. Fyzikální vlastnosti vody a jejich biologický význam. Experimentální metody studia vodíkových vazeb. Gibsova energie v molekulární biologii - rekapitulace základů chemické termodynamiky Mezimolekulární interakce: elektrostatické (ion-ion, ion-dipól, dipól-dipól), indukční (ion-molekula, dipól-molekula, 2 induk.dipóly), disperzní vodíkové vazby. Spektroskopie molekulárních dimérů. Význam slabých chemických interakcí pro strukturu a funkci biologických molekul. Síly určující konformace bílkovin a nukleových kyselin. Hydrofobní efekt a solvatační jevy. Iontová interakce a sírové můstky v bílkovinách. Peptidová vazba a polypeptidický řetězec. Konformační analýza bílkovin alfa-šroubovice, beta-list, polyprolin. Ramačandranovy diagramy, potenciálové funkce, predikace struktur. Konformace nukleových kyselin - struktura nukleotidového řetězce. Base, cukry, rotační úhly. Dvoušroubovice-B, A a Z-forma. Polymorfismus a konformační analýza nukleových kyselin.