Pokročilé metody NMR - MC270P08A

• Anglický název: Advanced NMR methods
• Český název: Pokročilé metody NMR
• Zajišťuje: Katedra organické chemie (31-270)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2024
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:ústní
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: 3
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu; při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
• Garant: doc. RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.
• Vyučující: doc. RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.

Anotace

Navazující kurz NMR spektroskopie, kde se budou rozvíjet znalosti v popisu experimentálních technik, jejich využití a vyhodnocování dat.
Hlavním cílem je poskytnout přehled o bohatých možnostech NMR spektroskopie a naučit posluchače zvolit správnou metodu pro studium konkrétního problému. Techniky vícerozměrné spektroskopie (2D až 4D) budou aplikovány na studium biomolekul, a to jak jejich struktury, tak interakcí mezi nimi či s malými ligandy. Budou
rovněž podány informace posledních trendech NMR kapalin a pokročilých metodách NMR pevné fáze.

Poslední úprava: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Literatura

Cavanagh, J.; Fairbrother, W.J,; Palmer, A.G.III; Rance, M.; Skelton, N.J.: Protein NMR spectroscopy: Principles and practice, Elsevier, 2007

Poslední úprava: KFNTZT/MFF.CUNI.CZ (21.09.2011)

Požadavky ke zkoušce

Zkouška = prezentace a obhajoba řešení zkouškového domácího úkolu před vyučujícím. Úkol je zadáván min. 14 dní před zkouškou a testuje porozumění pulsním sekvencím a vyhodnocování získaných dat.

Poslední úprava: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Sylabus

1.) Moderní popis NMR, souhrn NMR interakcí.
2.) Přenos polarizace, nepřímá detekce, selektivní a tvarované pulsy, fázové cykly.
3.) Vícerozměrná spektroskopie. Homonukleární a heteronukleární korelace.
4.) NMR biomolekul. Izotopové obohacení. Techniky pro přiřazení signálů a struktury proteinů.
5.) Měření dynamických procesů (změny chem. posunu, relaxace a relaxační disperze; segmentální pohyblivost, vazba ligandu, mezimolekulární interakce, difuze)
6.) Moderní trendy v NMR kapalin (pure-shift spektra, TROSY, RDC, přenos saturace,...)
7.) Pokročilé techniky NMR pevné fáze.

Poslední úprava: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Výsledky učení

Student po absolvování kurzu

- rozebere funkci a vysvětlí princip pulsních sekvencí

- navrhne metodu pro studium specifických dynamických procesů molekul (agregace, výměny, relaxace, pohyblivost, vzdálenost, kinetika, termodynamické parametry,...) a vyhodnotí naměřená data

- vysvětlí principy řešení prostorové struktury proteinů pomocí NMR v roztoku

- zhodnotí možnosti využití NMR pevné fáze

Poslední úprava: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Vstupní požadavky

Vstupním požadavkem je absolvování některého ze základních kurzů NMR, předpokládá se však znalost na úrovni kurzu MC260P107 Techniky NMR spektroskopie

Poslední úprava: KFNTZT/MFF.CUNI.CZ (12.04.2018)