Praktikum z molekulární biologie a virologie - MB140C77

• Anglický název: Molecular biology and virology practical training course
• Český název: Praktikum z molekulární biologie a virologie
• Podoba výuky: cvičení
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2022
• Počet semestrů výuky: 1
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/1, Z [TS]
• Počet míst: 18
• Maximální kapacita předmětu: 18
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Úroveň: specializační
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
• Třída: Horizontální laminární box 120 cm; Biohazard laminární box 200 cm; Stolní chlazená centrifuga univerzální se více rot; Invertovaný mikroskop s fluorescenční kamerou; Elektroforéza DNA horizontální; Zdroj napětí na elektroforézu; Pipetmany (sada); Termoblok; Mikrocentrifuga stolní; Mikrocentrifuga malá; Dataprojektor; Mikroskop badatelský

Anotace

čeština

INFORMACE PRO LETNÍ SEMESTR 2026/2027

Praktikum probíhá jako týdenní praktický kurz.
Je předběžně naplánován od 17.5. do 21.5.2027, v místnosti praktika v BIOCEVu vždy od 9:00 hod.

S pozdravem
Vojtěch Šroller a kol.

Moodle - Praktikum molekulární biologie a virologie MB140C77
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=3944

Týdenní turnusový kurz z molekulární biologie a virologie poskytuje praktický a teoretický nácvik laboratorních
metod z molekulární biologie a virologie. Vybrané úlohy umožňují studentům se seznámit jak se základními
metodami (jako izolace DNA, gelová elektroforéza) tak i s metodami pokročilejšími, které jsou používány ve
výzkumných a diagnostických laboratořích věnující se biomedicínskému výzkumu (např. PCR, sekvenování, elektronová mikroskopie).
Laboratorní kurz je vhodný především pro studenty se zaměření na molekulární biologii a virologii.

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)

angličtina

One week course from molecular biology and virology provides both practical and theoretical training in laboratory
methods from molecular biology and virology. The selected experiments allow students to practice not only basic
methods (like DNA isolation, gel electrophoresis) but also methods more advances, which are used in biomedical
research and diagnostics laboratories (like electron microscopy, PCR, sequencing). Laboratory course is well
suited for students interested in molecular biology and virology.

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (08.01.2024)

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Podmínkou pro udělení zápočtu je aktivní účast, vypracování protokolů a jejich schválení vedoucím praktika.

Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)

angličtina

Credits are given based on active participation on the course and written up completed protocols approved by the supervisor of laboratory course.

Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)

Literatura

čeština

Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell

Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press

Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.10.2019)

Kontroly studia předmětu a podmínky pro jejich úspěšné vykonání, způsob hodnocení

čeština

Udělení zápočtu je podmíněno aktivní účastí na praktiku (jsou povolené 4 hodiny řádně omluvené absence během celého turnusového praktika). Pro získání zápočtu je dále třeba odevzdat  protokol k praktickým úlohám v předepsaném termínu a formě. 

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)

angličtina

Credit is conditional upon active participation in the practical course (four hours of duly excused absence are permitted during the intensive practical course). To obtain credit, students must also submit a protocol on the practical tasks by the specified deadline and in the required format.

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)

Sylabus

čeština

Úlohy řešené v průběhu praktik: (mohou být mírně upraveny podle aktuální situace)

1. Izolace plazmidové DNA z bakteriální kultury, vizualizace na gelové elektroforéze, stanovení množství DNA UV spektrofotometrií, Sangerovo sekvenování, určení neznámé sekvence DNA porovnáním s databází

2. Pasážování savčích buněčných kultur, jejich infekce virem, kvantifikace virových DNA genomů metoodu qPCR

3. Vizulazice virových částic pomocí elektronové mikroskopie

4. Detekce virus-neutralizačních protilátek v séru, vyhodnocení pomocí imuofluorescenčního barvení.  

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)

angličtina

The work schedule of practical course (subject to minor adjustments based on current circumstances)

1. Isolation of plasmid DNA from bacterial culture, visualization via gel electrophoresis, DNA quantification using UV spectrophotometry, Sanger sequencing, and identification of an unknown DNA sequence by database comparison.
2. Passaging of mammalian cell cultures, viral infection of the cells, and quantification of viral DNA genomes using qPCR. 
3. Visualization of viral particles via electron microscopy
4. Detection of virus-neutralizing antibodies in serum, evaluated using immunofluorescence staining.

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (26.08.2026)

Výsledky učení

Po absolvování předmětu student/ka:

Vysvětlí principy základních molekulárně biologických a virologických metod, zejména postup při práci s buněčnými kulturami a jejich infekce virem, virus neutralizační test, imunofluorescenční barvení, izolaci plazmidové DNA z bakteriální kultury, kvantitativní polymerázovou řetězovou reakci, Sangerovo sekvenování, elektronovou mikroskopii, a jejich využití ve výzkumné, lékařské a biotechnologické praxi.

Samostatně provede vybrané základní laboratorní postupy, jako je práce se savčími tkáňovými kulturami, fixace a imunofluorescenční barvení buněk, infekce buněk viry, fluorescenční mikroskopie, kvantitativní PCR, izolace plazmidové DNA, příprava sekvenační reakce a dodržuje zásady správné laboratorní praxe.

 Dokáže analyzovat a interpretovat experimentální výsledky, včetně pořízení a vyhodnocení snímků z fluorescenčního mikroskopu, výpočtů podle vzorečků u kvantifikačních metod a srozumitelně je zpracovat ve formě laboratorního protokolu.

Využívá základní bioinformatické nástroje a veřejné databáze pro vyhodnocení výsledků sekvenační reakce, kvantitativní PCR a kontrolu výpočtů a řešení jednoduchých teoretických úloh v molekulární biologii.

Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)