Základy praktické bioinformatiky - GDPX09

• Anglický název: Introduction to applied bioinformatics
• Zajišťuje: Katedra biochemických věd (16-16160)
• Fakulta: Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
• Platnost: od 2019
• Semestr: oba
• Body: 0
• E-Kredity: 0
• Způsob provedení zkoušky: ústní
• Rozsah, examinace: 0/0, Zk [HT]
• Počet míst: zimní:neurčen / neurčen (neurčen); letní:neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je určen pouze pro doktorandy; předmět lze zapsat v ZS i LS
• Garant: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.
• Záměnnost : GDXP09
• Je záměnnost pro: GDXP09

Anotace

čeština

Bioinformatika je mezioborová disciplína zabývající se ukládáním, tříděním, analýzou a interpretací souborů biologických dat. V rámci předmětu Základy praktické bioinformatiky se studenti dozvědí o možnostech využití dostupných bioinformatických databází a programů. Prakticky se studenti naučí vyhledávat informace a sekvenční data a seznámí se s možnostmi jejich využití. Tento předmět je založen hlavně na praktické práci u počítače a samostatném vyzkoušení různých webových aplikací. Probíraná témata zahrnují: vyhledávání literatury, databáze proteinových a nukleotidových sekvencí, porovnávání sekvencí a analýza jejich vlastností, hledání podobných sekvencí, restrikční analýza, návrh primerů, specializované databáze atd.

Poslední úprava: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

angličtina

Bioinformatics is interdisciplinary field of science dealing with storage, classification, analysis and interpretation of biological data. In the subject Introduction to Applied Bioinformatics students learn about possibilities how to find and use bioinformatic databases and tools. This subject is focused mainly on practical usage and training of various web based programs and software tools. Topics include scientific literature search, databases of protein and nucleotide sequences, sequences comparison and their feature analysis, restriction analysis, primer design, specialized databases, etc.

Poslední úprava: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

Literatura

čeština

Doporučená:

• null. . In Cvrčková, Fatima. Úvod do praktické bioinformatiky . Praha: Academia, 2006, s. -. ISBN 80-200-1360-1..
• null. . In Claverie, Jean-Michel Notredame, Cedric. Bioinformatics for dummies . Hoboken: Wiley Publishing, 2007, s. -. ISBN 0-470-08985-7..
• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..
• null. . In Zvelebil, Marketa J. Baum, Jeremy O.. Understanding bioinformatics . New York: Garland Science, Group, 2008, s. -. ISBN 978-0-8153-4024-9..

Poslední úprava: prepocet_literatura.php (14.08.2025)

angličtina

Recommended:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..
• null. . In Claverie, Jean-Michel Notredame, Cedric. Bioinformatics for dummies . Hoboken: Wiley Publishing, 2007, s. -. ISBN 0-470-08985-7..
• null. . In Zvelebil, Marketa J. Baum, Jeremy O.. Understanding bioinformatics . New York: Garland Science, Group, 2008, s. -. ISBN 978-0-8153-4024-9..

Poslední úprava: prepocet_literatura.php (14.08.2025)

Požadavky ke zkoušce

čeština

"Písemná" zkouška u počítače. Praktické splnění zadaných úkolů.

Poslední úprava: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)

angličtina

Practical test by computer of practical knowledge of the subject with the possibility to use gained materials.

Poslední úprava: Matoušková Petra, doc. Ing., Ph.D. (05.02.2019)