Tento předmět bude zaměřen na vektorovou grafiku, která má oproti grafice rastrové očividné výhody: jakmile je jednou obrázek vytvořen, lze jej použít opakovaně, od drobných obrázků v publikacích přes prezentace s názornou infografikou až po postery. Na velikosti skutečně nezáleží, vektorové obrázky jsou vždy hladké a čitelné, pdf soubory zoomovatelné a postery bez rozkostičkovaných obrázků. Vektory šetří i prostor na disku. Části již hotových vektorových obrázků mohou být snadno zkombinovány do nových kontextů, čím šetří čas i úsilí. Mnoho programů, ať už statistických, fylogenetických či geoinformačních, umožňují exportovat výsledky do vektorového formátu (.eps, .svg), které zůstávají editovatelné a lze je tedy doladit ve vektorovém programu.
Během kurzu budeme pracovat v programu Inkscape, který je nejmocnější z volně dostupných programů s otevřeným kódem. Ač může na začátku působit jako uživatelsky nepříjemný, učící křivka je poměrně strmá. Obsah předmětu bude "přitesán" potřebám i zkušenostem studentů. Na začátku osvěžíme základy, aby bylo jasné, že všichni chápou principy vektorové grafiky a orientují se v prostředí programu a jeho nezbytných nástrojích. Později se zaměříme na pokročilejší nástroje, které usnadní práci a metody aplikujeme na vědecké výstupy - mapy, grafy, stromy, atd.
V ideálním případě by měl student vstupovat do předmětu s vlastním projektem (poster, prezentace na konferenci, nebo graf/obrázek do vědeckého článku / závěrečné práce), na němž bude moci demonstrovat nabyté znalosti. Mimoto pak s vlastním laptopem (Windows/Linux/iOS), s nainstalovaným Inkscapem.
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (23.10.2019)
This course will be focused on vectors graphics, the advantage of which, in contrast to raster images, is obvious:
once image is created, it can be easily re-used for many purposes, from small figures in the scientific papers,
through slides with clear infographics, to stand-out posters. Indeed, scale does not matter, vector image will
always be smooth and readable, the pdfs zoomable and posters without pixelated images. Vectors save a lot of
disk-space as well. Parts of different vector images can be easily combined into new context, saving time and
effort. Many programs, including R or GIS-software, allow to export the output to vector format (.eps, .svg), which
stays editable and can thus be polished-up in a vector editor.
During the course we will mainly work in Inkscape, which is the most powerful open-source software available at
the moment. Although it might seem a bit user-unfriendly at start, it has a steep learning curve.
The course will be tailored to the needs and skill-level of the students. At start we will refresh the basics, so that
everyone will understand the principles of vector graphics and will be familiar with the program environment and
with the essential tools. We will later focus on the use of advanced tools that make the life even easier, and how to
apply this knowledge to scientific outputs, maps, charts, trees etc.
Ideally, the student should enter the course with a particular project of his own (e.g. poster / slides for a
conference, or figure for a scientific paper / thesis) on which he or she will be able demonstrate the acquired
skills.
Preferably own laptop with either Windows, Mac, or Linux operating system, and Inkscape already installed.
Poslední úprava: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (10.05.2019)
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (23.08.2019)
Požadavky ke zkoušce -
Splnění většiny (minimálně 80 %) úkolů (lehčích až náročnějších) v průběhu kurzu.
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (26.01.2026)
Fulfilling most (> 80%) of the tasks (some easier, some more complicated) during the progress of the course.
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (26.01.2026)
Sylabus -
Kurz poběží ve třech jednodenních (cca 6h) blocích (syllabus je předběžný)
1 Základy - Pracovní prostředí Inkscape, nejdůležitější nástroje a klávesové zkratky - Rozvržení - jak zarovnat a rozmístit objekty - Křivky (lines - polygons) - Úpravy textu, vlastní fonty - Importování obrázků
2 Pokročilejší nástroje - Vektorizace rastrů - Vzory, rozmisťování podle křivek, Distribution along lines - Filtry - Mnohonásobné úpravy / výběr - Klony
3 Vědecké výstupy - Grafy - Mapy - Stromy - Ostatní
- Kombinování objektů do komplexnějších obrazů
- Kombinování vektorových a rastrových obrázků - Export do PDF / EPS
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (23.10.2019)
The course will run in three subsequent one-day blocks (the syllabus is preliminary) 1 The Basics - Inkscape working space and the most important basic tools and key shortcuts - Layout - how to align, distribute the objects - Paths (lines - polygons) - Text editing & custom fonts - Importing images 2 Advanced Tools - Transformation from images to vectors - Patterns, Distribution along lines - Filters - Multiple editing / selection - Clones 3 Scientific Outputs - Graphs - Maps - Trees - Assembling complex figures - Combining vector and raster images - Export to PDFs / Eps
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (23.10.2019)
Výsledky učení -
ZNALOSTI
Po absolvování kurzu bude student schopen:
Vysvětlit základní rozdíl mezi vektorovou a rastrovou grafikou, a jaké té má důsledky pro kvalitu, škálování a velikost souboru.
Popsat strukturu a logiku vektorových formátů běžně používaných ve vědeckých výstupech (např. SVG, EPS, PDF).
Porovnat schopnosti i omezení Inkscapu s ostatními grafickými nástroji.
Porozumět tomu, jak vektorový editor navazuje na výstupy vědeckých softwarů, jako je R nebo různé GIS platformy.
Vyjmenovat osvědčené postupy pro přípravu publikovatelných obrázků, posterů a prezentací pomocí vektorové grafiky.
DOVEDNOSTI
Po absolvování kurzu bude student schopen:
Orientovat se bez problémů v pracovním prostředí Inkscapu a efektivně používat jeho základní nástroje, klávesové zkratky a pracovní postupy.
Vytvářet a upravovat vektorové objekty včetně cest, tvarů, textu a importovaných obrázků, a manipulovat s nimi.
Využívat přehledná a esteticky konzistentní rozvržení s využitím nástrojů pro zarovnání, rozložení a transformace.
Aplikovat pokročilejší techniky vektorové editace, jako je vektorizace obrázků, klonování nebo tvorba vzorů.
Kombinovat více grafických prvků (včetně rastrových i vektorových dat) do jednoho komplexnějšího obrázku.
Upravovat již existující obrázky (své vlastní nebo práce jiných autorů).
Exportovat grafiku do vhodných vektorových formátů určených pro vědecké publikace a velkoformátový tisk.
KOMPETENCE
Po absolvování kurzu bude student schopen:
Samostatně vytvářet vysoce kvalitní, znovupoužitelné vizuální materiály pro vědeckou komunikaci (články, postery, prezentace).
Kriticky hodnotit a zlepšovat vizuální srozumitelnost a komunikační účinnost vědeckých obrázků.
Aplikovat postupy vektorové grafiky na reálné výzkumné výstupy a šetřit tak čas i úložný prostor.
Přizpůsobit získané grafické dovednosti různým vědeckým kontextům, jako jsou mapy, grafy, fylogenetické stromy a složené obrázky.
Zapojit editor vektorové grafiky do celkového vědeckého pracovního postupu a vytvářet editovatelné, a tudíž opakovaně použitelné grafické výstupy.
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (26.01.2026)
KNOWLEDGE
Upon successful completion of the course, the student will be able to:
Explain the fundamental difference between vector and raster graphics, including implications for scale, quality, and file size.
Describe the structure and logic of vector formats commonly used in scientific workflows (e.g. SVG, EPS, PDF).
Identify the capabilities and limitations of Inkscape as an open-source vector graphics editor in comparison to other graphical tools.
Understand how vector graphics integrate with outputs from scientific software such as R or GIS platforms.
Recognize best practices for preparing publication-ready figures, posters, and presentations using vector graphics.
SKILLS
Upon successful completion of the course, the student will be able to:
Confidently navigate the Inkscape working environment and efficiently use essential tools, keyboard shortcodes, and workflows.
Create, edit, and manipulate vector objects including paths, shapes, text, and imported images.
Design clear and aesthetically consistent layouts using alignment, distribution, and transformation tools.
Apply advanced vector-editing techniques such as image vectorization, cloning or pattern creation.
Assemble scientific figures by combining multiple graphical elements and integrating raster and vector data.
Adjust already existing figures (student's own, or work of others).
Export graphics into appropriate vector formats suitable for scientific publishing and large-format printing.
COMPETENCES
Upon successful completion of the course, the student will be able to:
Independently produce high-quality, reusable visual materials for scientific communication (papers, posters, slides).
Critically assess and improve the visual clarity and communicative effectiveness of scientific figures.
Apply vector-graphic workflows efficiently to real research outputs, saving time and storage space.
Adapt acquired graphical skills to diverse scientific contexts such as maps, graphs, phylogenetic trees, and composite figures.
Integrate vector-graphic editing into their broader research workflow and maintain editable, future-proof graphical outputs.
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (26.01.2026)
Vstupní požadavky -
Nejsou, ale vhodné je mít vlastní projekt (prezentaci / poster / grafiku do publikace)
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (23.10.2019)
None, but preferably own project (presentation / poster)
Poslední úprava: Pipek Pavel, Mgr., Ph.D. (13.06.2019)
