PředmětyPředměty(verze: 802)
Předmět, akademický rok 2016/2017
   Přihlásit přes CAS
Praktikum z molekulární fylogenetiky - MB160C21
Anglický název: Practical course of molecular phylogenetics
Zajišťuje: Katedra parazitologie (31-161)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2016 do 2016
Semestr: zimní
E-Kredity: 1
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
Rozsah, examinace: zimní s.:0/1 Z [dny/semestr]
Počet míst: 36
Minimální obsazenost: neomezen
Stav předmětu: nevyučován
Jazyk výuky: čeština
Další informace: http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/
Poznámka: předmět má cyklickou výuku
Garant: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
Kde je předmět použit    Výsledky anket   Termíny zkoušek   Rozvrh   
Anotace -
Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (19.03.2010)

Praktické cvičení ke kurzu B160P21 Molekulární taxonomie. Obsah: Praktické cvičení
zaměřené na seznámení posluchačů se základními programy využívanými v molekulární taxonomii a příbuzných oborech a
základními molekulárně biologickými technikami používanými v molekulární taxonomii a fylogenetice. Počet posluchačů
může být omezen. Více informací na http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/.
Literatura
Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (04.08.2011)

Felsenstein J: Inferring phylogenies. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004

Hillis DM, Moritz C a Mable BK: Molecular Systematics, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 1996

Avise JC. Molecular Markers, Natural History and Evolution, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004

Požadavky ke zkoušce
Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (16.12.2011)

Odevzdání samostatně vyřešené úlohy.

Sylabus
Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (16.09.2015)

Rozvrh praktika v roce 2015:

Praktikum bude probíhat v nové počítačové učebně B311 v čase 9:00-12:00.

30. 11. - získávání sekvencí z veřejných databází

7. 12. - tvorba alignmentu, tvorba stromů ze sekvencí DNA

14. 12. - tvorba stromů ze sekvencí aminokyselin

21. 12. - Bayéské metody, molekulární hodiny

11. 1. - multigenové analýzy, testy, distanční data, analýza migrace 

 
Univerzita Karlova | Informační systém UK