PředmětyPředměty(verze: 964)
Předmět, akademický rok 2024/2025
   Přihlásit přes CAS
Molekulární biologie RNA - MB140P44
Anglický název: Molecular Biology of RNA
Český název: Molekulární biologie RNA
Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2022
Semestr: zimní
E-Kredity: 3
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:ústní
Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Zk [HT]
Počet míst: neomezen
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Úroveň: specializační
Vysvětlení: změna názvu a semestru výuku od 2022/23
Poznámka: povolen pro zápis po webu
Garant: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.
Vyučující: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.
Anotace -
Nové kolo přednášek seznamujících posluchače s novinkami v oboru molekulární biologie. První část kurzu sestává z
několika na sebe navazujících přednášek o detailním mechanizmu eukaryotické translace, metabolizmu RNA a způsobům
posttranskripční regulace genové exprese. Druhá část přednášek pak nabízí aktuální přehled z oborů genomiky,
molekulární biologie Eukaryot a jejich virů a také moderních metod genového inženýrství a to formou semináře částečně
vyplněného přednáškami pozvaných odborníků. Kurz je určen pro magisterské studenty a doktorandy všech biologických a
lékařských oborů.
Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (14.05.2009)
Literatura -

Doporučená literatura:

Translational control in biology and medicine (Michael B. Mathews, Nahum Sonenberg, John W.B. Hershey, eds.), Cold Spring Harbor Monograph Series, Monograph 48, CSHL, 2007, ISBN 978-087969767-9

Posledni ročníky časopisů Nature, Science, PNAS, NAR a RNA journal.

Poslední úprava: Mašek Tomáš, RNDr., Ph.D. (12.05.2011)
Požadavky ke zkoušce -

Zkouška se skládá z krátkého testu (6 otázek, možnost několika správných odpovědí, vždy alespoň jedna správná odpoveď, studenti PhD test nevyplňují)a písemné části, která se skládá ze 2 otázek (většinou zaměřených na větší objem probrané látky, studenti v prvním termínu mohou použít své poznámky z přednášek, nikoliv však stažené prezentace).

Poslední úprava: Mašek Tomáš, RNDr., Ph.D. (22.12.2011)
Sylabus -

1. Struktura ribozómu, iniciační a elongační translační faktory, proces iniciace translace

2. Elongace a terminace translace, společné znaky eukaryotické a prokaryotické translace, specifika translace u rostlin

3. Způsoby iniciace translace, na čepičce závislá translace, IRES elementy, reiniciace, recycling, ribosome shunting and hoping, kontrola genové exprese pomocí translačního frameshiftu, uORF a pročítání terminačního kodónu

4. Signální dráhy regulující aktivitu translace, mTOR, TOP mRNAs, kontrola translace dostupnými aminokyselinami, GCN4 systém, eIF2 kinázy, regulace elongace

5. Kontrola translace během stresu, teplotního šoku, spojení mRNA metabolizmu a translace, degradace RNA, NMD, P-bodies, polyadenylace a translace, lokalizovaná translace

6. translační strategie virů a obrana hostitele, pikornaviry, adenoviry, reoviry, chřipka, poxviry

7. regulace translace během vývoje, miRNA a translace, translace a paměť, translační kontrola během rakoviny a apoptózy, translace a metabolické poruchy, terapie

8. Sekvenační projekty, srovnávací genomika a její využití v současné biologii a medicíně.

9. SELEX a všestranné použití aptamérů

10. Translační iniciační faktory 4E a kontrola genové exprese

11. Struktura čepičky, mechanizmus syntézy, konce eukaryotických a virových transkriptů, metody studia

12. Přehled moderních vysokoprůchodných technologií používaných v molekulární biologii - sekvenování, mikroarrays, SAGE, qRT-PCR, atd.

13. Biologie viru hepatitidy C a příbuzných flavivirů, interakce s hostitelem, hledání vhodné terapie

Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (14.05.2009)
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK