Introduction to study of plant evolution and diversity - MB120P153E

• Anglický název: Introduction to study of plant evolution and diversity
• Český název: Úvod do studia evoluce a diverzity rostlin
• Zajišťuje: Katedra botaniky (31-120)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2025
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:ústní
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/1, Z+Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Další informace: http://ibot.sav.sk/usr/Karol/teaching_mat.html
• Poznámka: povolen pro zápis po webu; při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
• Garant: prof. RNDr. Karol Marhold, DrSc.
• Vyučující: prof. RNDr. Karol Marhold, DrSc.
• Neslučitelnost : MB120P23

Anotace

čeština

Cieľom prednášky je podať prehľad základných metodických prístupov v taxonómii a na praktických príkladoch z
literatúry predviesť ich uplatnenie. Osobitná pozornosť je venovaná základnému terminologickému
aparátu taxonómie, klasifikácii polyploidných komplexov, využitiu molekulárnych a morfologických dát,
formálnej prezentácii výsledkov taxonomickej práce a niektorým otázkam botanickej nomenklatúry.

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

angličtina

Aim of the lecture is to provide an overview of basic methodical approaches in taxonomy and to show their application, based on practical examples from literature. Special attention is paid to the basic terminology of taxonomy, classification of polyploid complexes, evaluation of molecular and morphological data, formal presentation of the results of taxonomical work and to some problems of botanical nomenclature.

Poslední úprava: Marhold Karol, prof. RNDr., DrSc. (07.10.2025)

Literatura

čeština

Stuessy, T.F., 2009: Plant taxonomy. The Systematic evaluation of comparative data. Ed. 2. Columbia University Press, New York.

Stuessy, T.F., 1990: Plant taxonomy. The Systematic evaluation of comparative data. Columbia University Press, New York.

Stuessy, T. F., 1994: Case studies in plant taxonomy. Columbia University Press, New York.

Stace, C.A., 1991: Plant Taxonomy and Biosystematics. Cambridge University Press, Cambridge. Stebbins, G.L., 1971: Chromosomal evolution in higher plants. E. Arnold, New York.

Greuter W. et al., eds. [preložil Marhold, K.], 2000: Medzinárodný kód botanickej nomenklatúry (Saint Louis Code) [International code of botanical nomenclature (Saint Louis Code)]. - Zprávy Čes. Bot. Společn., Příloha 2000/1; Bull. Slov. Bot. Spoločn. Suplement 6.

Články z časopisov Taxon, Systematic Botany, Plant Systematics and Evolution, Mycotaxon, Folia Geobotanica, Preslia.

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

angličtina

Stuessy, T.F., 2009: Plant taxonomy. The Systematic evaluation of comparative data. Ed. 2. Columbia University Press, New York.

Stuessy, T.F., 1990: Plant taxonomy. The Systematic evaluation of comparative data. Columbia University Press, New York.

Stuessy, T. F., 1994: Case studies in plant taxonomy. Columbia University Press, New York.

Stace, C.A., 1991: Plant Taxonomy and Biosystematics. Cambridge University Press, Cambridge. Stebbins, G.L., 1971: Chromosomal evolution in higher plants. E. Arnold, New York.

Greuter W. et al., eds. 2000: International code of botanical nomenclature (Saint Louis Code).

Papers in journals Taxon, Systematic Botany, Plant Systematics and Evolution, Mycotaxon, Folia Geobotanica, Preslia.

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

Požadavky ke zkoušce

čeština

Ústní zkouška.

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

angličtina

Oral examination.

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

Sylabus

čeština

Pozícia taxonómie, prístupy v klasifikácii, z histórie taxonómie, taxonomické kategórie (druh, poddruh, varieta, forma), vymedzenie taxónov, postup práce pri taxonomickej štúdii (Marhold)

Taxonomické publikácie ako zdroj informácií a ako produkt taxonomického výskumu I - bibliografie, atlasy rozšírenia, určovacie kľúče, Index Herbariorum, prehľady počtov chromozómov (Marhold)

Taxonomické publikácie ako zdroj informácií a ako produkt taxonomického výskumu II - Flóry, checklisty, monografie (Marhold)

Herbáře, jejich role ve studiu biodiverzity, jak funguje herbář (Mráz)

Botanická nomenklatúra, Medzinárodný kód botanickej nomenklatúry, alternatívne prístupy v botanickej nomenklatúre (Marhold)

Multivariačná morfometrika, geometrická morfometrika, rekonštrukcia evolúcie, tvorba fylogenetických stromov (Marhold)

Cytotaxonomie, karyologie, cytogenetika (historie, řešené otázky, metodický aparát) -I (Suda)

• data používaná v cytotaxonomii (počet chromozomů, charakter karyotypu, meoitické chování, velikost genomu, "proužkování")

• metodické přístupy (roztlakové preparáty, specifické barvení, FISH, GISH)

• Cytotaxonomie, karyologie, cytogenetika (historie, řešené otázky, metodický aparát) -II (Suda)

• průtoková cytometrie (podstata metody, historie, srovnání rostlinné a živočišné cytometrie, výhody/nevýhody)

• otázky řešené pomocí průtokové cytometrie (delimitace taxonů, hybridizace, cytogeografie, reprodukční způsoby)

• modelové studie

• Uplatnění molekulárních přístupů ve studiu biodiverzity, v taxonomii a v rekonstrukci evoluce - I. (Fér)

• přehled molekulárních metod (isozymy, RAPD, AFLP, mikrosatelity, sekvence) a jejich použití při studiu fylogeneze, hybridizace, polyploidie, fylogeografie

• Uplatnění molekulárních přístupů ve studiu biodiverzity, v taxonomii a v rekonstrukci evoluce - II. (Fér)

• příklady molekulárních studií

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

angličtina

Position of taxonomy in biological sciences; history of taxonomy; delimitation of taxa; evolutionary relationships; species, subspecies, variety, forma; different approaches to infraspecific classification; taxonomical studies (Marhold)

Taxonomic publications as a source of information and as a product of taxonomic research I. Bibliographies, distribution atlases, identification keys, Index Herbariorum, chromosome number surveys (Marhold)

Taxonomic publications as a source of information and as a product of taxonomic research II. Floras, checklists, monographs (Marhold)

Herbaria, their role in biodiversity studies, basic rules of work in herbarium (Mráz)

Botanical nomenclature, International Code of Botanical Nomenclature, alternative approaches to botanical nomenclature (Marhold)

Multivariate morphometrics, geometrical morphometrics, reconstruction of evolution, building of phylogenetic trees (Marhold)

Cytotaxonomy, karyology, cytogenetics (history, questions, methods) I (Suda)

• data in cytotaxonomy (chromosome numbers, karyotypes, meiotic behaviour, genome size, banding)

• methods (squashes, specific staining, FISH, GISH)

• Cytotaxonomy, karyology, cytogenetics (history, questions, methods) I (Suda)

• flow cytometry (methods, history, comparison of plant and animal flow cytometry, advantages, disadvantages)

• questions addressed by FCM (taxon delimitation, hybridisation, cytogeography, reproduction modes)

• case studies

• Molecular approaches in biodiversity studies, in taxonomy and reconstruction of evolution I (Fér)

• methods (isozymes, RAPD, AFLP, microsatellites, sequences) and their application in phylogenetic, hybridisation, polyploid and phylogeographic studies

• Molecular approaches in biodiversity studies, in taxonomy and reconstruction of evolution I (Fér)

• case studies

Poslední úprava: Štefánek Michal, Mgr. (04.05.2022)

Výsledky učení

After completing the course, students will be able to:

1. Explain the fundamental principles of plant taxonomy, classification, and nomenclature in the context of evolutionary biology.
   

2. Describe major methodological approaches used in the study of plant diversity, including morphological, cytogenetic, and molecular techniques.
   

3. Apply basic taxonomic terminology and distinguish between different hierarchical and infraspecific levels of classification.
   

4. Comprehend use of morphological and molecular data in the delimitation of taxa and reconstruction of phylogenetic relationships.
   

5. Evaluate the role of polyploidy, hybridization, and genome size variation in plant evolution and diversification.
   

6. Describe basic procedures of herbarium work and recognize the importance of taxonomic collections in biodiversity research.
   

7. Highlight the benefits and limitations of using low cytometry and molecular markers in modern taxonomic and evolutionary studies.
   

8. Critically analyse published taxonomic and systematic works, and summarize their findings in accordance with the principles of botanical nomenclature.

Poslední úprava: Gáliková Kristýna, Mgr. et Mgr., DiS. (21.10.2025)