Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology - CPGS006

• Anglický název: Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology
• Zajišťuje: Ústav patofyziologie 3. LF UK (12-UFYP)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: zimní
• Body: 0
• E-Kredity: 0
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/30, Jiné [HS]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je určen pouze pro doktorandy
• Garant: RNDr. Jan Pala, Ph.D.

Anotace

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky. Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM, CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji. Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i konfokálním režimu

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

účast alespoň 50 % a test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury

Sylabus

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

1 Introduction to optical microscopy and historical overview

2 Microscopic methods in bright field

3 Fluorescence microscopy

4 Spinning disc

5 Confocal laser scanning microscopy

6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet

7 FRAP, FRET, FLIM and FCS

8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS

9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan

10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD

11 Nanoscopy 2 - STED

12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5

13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

účast alespoň 50 % a test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury