Microbiology 1 - B03122 (General Medicine)

• Title: Mikrobiologie 1
• Guaranteed by: Institute of Immunology and Microbiology First Faculty of Medicine and General University Hospital in Prague (11-00351)
• Faculty: First Faculty of Medicine
• Actual: from 2023
• Semester: summer
• Points: 6
• E-Credits: 6
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:2/2, C [HT]
• Extent per academic year: 60 [hours]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Explanation: RNDr. Jan Novák, Ph.D.Pro praktická cvičení: plášť a obuv do laboratoře na celý blok praktik
• Additional information: http://uim.lf1.cuni.cz
• Old code: 35
• Note: prefer medical statement; enabled for web enrollment
• Guarantor: prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
• Attributes: Lékařství; Teoretický předmět
• Pre-requisite : {splněna jedna z anatomií}, {splnit jeden z kódů}
• Interchangeability : B00035
• Is pre-requisite for: B00054, B03163, B00382

Annotation

English

Last update: Jana Kolářová (10.02.2020)

Provides basic information on clinical microbiology, virology, and parasitology. Based on the recent classification, reviews the most important bacteria, fungi, and parasites of humans, their features, pathogenesis, diseases. Reviews microbiological diagnostic techniques, prevention, vaccination, and therapeutic methods. During the practicals, provides the opportunity to test correct sampling, subsequent basic laboratory diagnostic methods, pathogen identification, and antibiotics sensitivity testing, and strategy of ATB therapy.

Czech

Last update: Jana Kolářová (10.02.2020)

Poskytuje základní informace z obecné lékařské mikrobiologie, virologie a parasitologie. Na základě platné klasifikace seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, jejich vlastnostmi, se základy patogeneze příslušných onemocnění, základy jejich diagnostiky, základy vakcinace a se základy antibiotické, antivirové a antiparazitární terapie. Formou praktické výuky umožní osvojení technik mikrobiologického vyšetření vybraných klinických materiálů, seznámí s metodami odběru vybraných klinických materiálů, se strategií identifikace bakterií a strategií antibiotické terapie.

Aim of the course

Last update: Ing. Vladislava Kohútová (20.12.2018)

Seznámení posluchačů se základy lékařské mikrobiologie. Výuka postupů a chování v infekčním prostředí a zacházení s infekčním materiálem.

Syllabus

English

Last update: Ing. Vladislava Kohútová (20.12.2018)

Week Lecturer Theme: Introduction to Microbiology. Morphology of bacteria. Physiology of bacteria. Bacterial genetics. Interaction of bacteria and the host. Viruses and the Host. Prions. Normal flora. Principles of antiinfectious imunity mechanisms. Basic properties of pathogenic fungi. Basic properties of parasites. Antibiotics and antimicrobial therapy. Rational antimicrobial therapy. Collecting specimens for microbial diagnostics and basic detection techniques. Nosocomial (Hospital-acquired infections). Disinfection and Sterilisation.

Seminar (Attendance Compulsory): Antiviral, antifungal and antiparazitic therapy.

Practicals (one week,):

Microscopy in medical bacteriology, mycology and parasitology. Native, fixed and stained slide. Staining techniques (Gram. Ziehl-Nielsen, Buri, Giemsa, immunofluorescence). Aerobic and anearobic culture (bacterial culture media, cultures and macroscopic morphology.) Metabolic Tests (API, Pliva Staphytest, Streptotest, Enterotest) Toxin detection. Antigen detection, Typing. Antibiotic susceptibility tests (diffusion disc tests, E-tests, MIC, MBC-testing). Yeast culture (Sabouraud) and GT-test. Serologic reactions( agglutination, precipitation, immunodiffusion, immunofluorescence, ELISA, immunoblot). Genome detection techniques, hybridisation, PCR. Sample collection techniques and Kits, documentation, transport requirements.

Czech

Last update: Jana Kolářová (10.02.2020)

Přednášky:

Obsah předmětu lékařská mikrobiologie, morfologie a fyziologie bakterií, genetika bakterií, interakce bakteriální a hostitelské buňky, viry a hostitelská bunka, viry a hostitelský organismus. Priony. Mikrobiální osídlení lidského těla. Antiinfekční imunita. Základy mykologie. Základy parazitologie. Antibiotika a chemoterapeutika, racionální terapie ATB. Vyšetřovací metody klinické mikrobiologie. Nosokomiální infekce. Sterilizace a desinfekce.

Praktická cvičení (týdenní blok):

Mikroskopické vyšetření v bakteriologii, mykologii a parazitologii. Nativní, fixovaný a barvení preparát. Barvící techniky. Aerobní a anaerobní kultivace bakterií (kultivační média, bakteriální kultury, morfologie kolonií). Identifikace bakterií (API, Pliva Staphytest, Streptotest, Enterotest). Průkaz toxinů. Stanovení citlivosti na antibiotika (diskový difusní test, MIC, MBC, E-testy). Kultivace kvasinek a plísní, GT-test. Serologické reakce (aglutinace, precipitace, imunodifuse, imunofluorescence, ELISA, imunoblot). Molekulárně biologické techniky detekce infekčního agens (PCR, hybridisace). Odběr a transport vzorků, odběrové soupravy.

Literature

Last update: RNDr. Jan Novák, Ph.D. (08.02.2021)

Doporučená:

• Mikrobiologický atlas z MUNI, Brno [online]. Dostupné z: https://www.med.muni.cz/mikroblg/atlas/index_cs.htm
• Hurych J., Štícha R. et al. . . Lékařská mikrobiologie - Repetitorium. . Praha: Stanislav Juhaňák - TRITON., 2020, s. ISBN ISBN 078-80-7553-844.

Teaching methods

Last update: RNDr. Jan Novák, Ph.D. (17.02.2022)

Přednášky, semináře: velká posluchárna Purkyňova ústavu. Paralelka a (úterý 7:15-8:45), paralelak b (čtvrtek 12:30-14:00)
Bloková praktická cvičení v rozsahu 1 týdne: praktikárny Ústavu imunologie a mikrobiologie, Studničkova 7, Praha 2, zadní vchod, přízemí. Pokyny jsou uvedeny v přiložených souborech.

Requirements to the exam

Last update: Mgr. Kateřina Petříčková, Ph.D. (20.02.2024)

POŽADAVKY PRO ZÁPOČET

1. Přednášky

• účast je nepovinná, přesto si ji registrujte přes čtečku ISIC karet v posluchárně.
• Pokud se zúčastníte alespoň 10 přednášek, nemusíte psát závěrečný zápočtový test.
• Volitelný zápočtový test bude obsahovat pouze témata probíraná na přednáškách a znalosti z praktik (PC místnost, Moodle prostředí, 30 otázek s volbou a-d, hodnotí se percentuálně, 60 % nutno pro splnění, možné jsou 3 pokusy, primárně v zápočtovém týdnu).
• Účast na laboratorním praktickém bloku. 

• Ze závažných a řádně doložených důvodů (onemocnění, úraz, apod.) lze po předchozí dohodě s vyučujícím tolerovat absenci v jednom dni. Toto neplatí pro poslední den, pátek, věnovaný parazitologii, jehož absolvování je povinné.
• Případnou páteční neúčast je potřeba nahradit po dohodě s dr. Vladimírem Skálou ([e-mail]) v náhradním termínu s jinou skupinou.
• V případě jednodenní omluvené nepřítomnosti má vyučující právo prověřit, že si student učivo z daného dne doplnil.

        3. Protokoly. Protokoly budou kontrolovány vyučujícím. V dalším semestru slouží studentům k přípravě na praktika Mikrobiologie 2.

NEÚČAST NA LABORATORNÍM TÝDNU ZE ZÁVAŽNÝCH DŮVODŮ – Student se může zúčastnit alternativního termínu po dohodě s organizátory praktik (počet míst v jednotlivých termínech je limitován kapacitou laboratoře). Prosíme, aby k změnám docházelo pouze, pokud to je opodstatněné a doložené, žádosti zasílejte na adresu [e-mail], budou posouzeny a schváleny individuálně ve spolupráci s garantem předmětu.