Microbiology 1 - B00035 (Všeobecné lékařství)

• Title: Mikrobiologie 1
• Guaranteed by: Institute of Medical Microbiology First Faculty of Medicine and General University Hospital in Prague (11-00351)
• Faculty: First Faculty of Medicine
• Actual: from 2022
• Semester: summer
• Points: 4
• E-Credits: 4
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:2/2, C [HT]
• Extent per academic year: 60 [hours]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: not taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Explanation: Mgr. Kateřina Petříčková, Ph.D.; [e-mail] praktická cvičení: plášť a obuv do laboratoře na celý blok praktikRozpis pracovních skupin je na výukové tabuli ÚIM
• Additional information: http://uim.lf1.cuni.cz
• Old code: 35
• Guarantor: prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc.
• Attributes: Lékařství; Teoretický předmět
• Pre-requisite : {splněna jedna z anatomií}, {splnit jeden z kódů}, B00005
• Is pre-requisite for: B02856
• Is interchangeable with: B03122

Annotation

English

Provides basic information on clinical microbiology, virology, and parasitology. Based on the recent classification, reviews the most important bacteria, fungi, and parasites of humans, their features, pathogenesis, diseases. Reviews microbiological diagnostic techniques, prevention, vaccination, and therapeutic methods. During the practicals, provides the opportunity to test correct sampling, subsequent basic laboratory diagnostic methods, pathogen identification, and antibiotics sensitivity testing, and strategy of ATB therapy.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Czech

Poskytuje základní informace z obecné mikrobiologie, speciální lékařské mikrobiologie, virologie a parasitologie. Seznamuje s nejdůležitějšími lidskými patogeny, s jejich vlastnostmi, se základy patogenese příslušných onemocnění, se základy jejich diagnostiky,se základy imunizace,se základy antibiotické, antivirové a antiparasitární terapie.Formou praktické výuky poskytne základní dovednosti bakteriologického vyšetření vybraných klinických materiálů, seznámí s metodami odběru vybraných klinických materiálů, se strategií identifikace bakterií a strategií antibiotické terapie.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Aim of the course

Seznámení posluchačů se základy lékařské mikrobiologie. Výuka postupů a chování v infekčním prostředí a zacházení s infekčním materiálem.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Course completion requirements

zápočet na základě docházky a absolvování praktik

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Literature

Základní literatura

• Julák J.: Úvod do lékařské bakteriologie. Karolinum, Praha 2015. ISBN 978-80-246-3210-0
• Julák J., Pavlík E. Lékařská mikrobiologie pro zubní lékařství. Karolinum, Praha, 2010. - virologická část
• Julák J.: Praktická cvičení a semináře z lékařské mikrobiologie. Karolinum, Praha. 2009.
• Votava M.: Lékařská mikrobiologie obecná. Neptun, Brno. 2002
• Votava M a kol.: Lékařská mikrobiologie speciální. Neptun, Brno. 2003
• Votava M a kol.: Lékařská mikrobiologie vyšetřovací metody. Neptun, Brno 2010.

 Doporučená literatura

• Bednář M., Fraňková V., Schindler J., Souček A., Vávra J.: Lékařská mikrobiologie. Marvil, Praha, 1. vyd. 1996.
• Votava M., Ondrovčík P.: Vybrané kapitoly z klinické mikrobiologie. Masarykova Universita, Brno, 2000.
• Carey R.B., Schuster M.G., McGowan K.L.: Lékařská mikrobiologie v klinických případech. Triton, Praha 2011.
• Goering R.V. a spol. Mimsova Lékařská mikrobiologie,  5.vydání, Triton, Praha 2016.

 E-literatura, ÚVI 1.LF UK

• Patrick R. Murray, Ken S. Rosenthal, Michael A. Pfaller, Medical Microbiology, Seventh Edition
• Richard Goering, Hazel Dockrell, Mark Zuckerman, Ivan M. Roitt, Peter L. Chiodini, Mims' Medical Microbiology, Fifth Edition
• David Greenwood, Richard Slack, Michael Barer, W L Irving, Medical Microbiology, 2012 Eighteenth Edition

 

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Teaching methods

Přednášky, semináře: velká posluchárna Purkyňova ústavu.
Bloková praktická cvičení v rozsahu 1 týdne: praktikárny Ústavu imunologie a mikrobiologie, Studničkova 7, Praha 2, zadní vchod, přízemí. Pokyny jsou uvedeny v přiložených souborech.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Requirements to the exam

Zápočet
Zápočet uděluje vedoucí praktických cvičení v zápočtovém týdnu.

Podmínkou udělení zápočtu je absolvování praktických cvičení s ověřením získaných vědomostí a dovedností, vypracování seminární práce na vybrané téma (předepsaný způsob a témata jsou uveřejněny na webových stránkách ústavu ÚIM) a zápočtový test (Bude psán na konci semestru, studenti s registrovanou účastí na 10 přednáškách tento test psát nemusí).

Zkouška se skládá až po absolvování 2. části přednášek - Mikrobiologie 2 v následujícím semestru. Před začátkem praktických cvičení Mikrobiologie 2 (příští semestr) se bude psát vstupní test, ve kterém budou prověřeny znalosti získané na praktických cvičeních a přednáškách Mikrobiologie 1.

 

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (13.02.2019)

Syllabus

English

Week Lecturer Theme: Introduction to Microbiology. Morphology of bacteria. Physiology of bacteria. Bacterial genetics. Interaction of bacteria and the host. Viruses and the Host. Prions. Normal flora. Principles of antiinfectious imunity mechanisms. Basic properties of pathogenic fungi. Basic properties of parasites. Antibiotics and antimicrobial therapy. Rational antimicrobial therapy. Collecting specimens for microbial diagnostics and basic detection techniques. Nosocomial (Hospital-acquired infections). Disinfection and Sterilisation.
Seminar (Attendance Compulsory): Antiviral, antifungal and antiparazitic therapy.
Practicals (one week,):
Microscopy in medical bacteriology, mycology and parasitology. Native, fixed and stained slide. Staining techniques (Gram. Ziehl-Nielsen, Buri, Giemsa, immunofluorescence). Aerobic and anearobic culture (bacterial culture media, cultures and macroscopic morphology.) Metabolic Tests (API, Pliva Staphytest, Streptotest, Enterotest) Toxin detection. Antigen detection, Typing. Antibiotic susceptibility tests (diffusion disc tests, E-tests, MIC, MBC-testing). Yeast culture (Sabouraud) and GT-test. Serologic reactions( agglutination, precipitation, immunodiffusion, immunofluorescence, ELISA, immunoblot). Genome detection techniques, hybridisation, PCR. Sample collection techniques and Kits, documentation, transport requirements.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Czech

Přednášky:
Obsah předmětu lékařská mikrobiologie, morfologie a fyziologie bakterií, genetika bakterií, interakce bakteriální a hostitelské buňky, viry a hostitelská bunka, viry a hostitelský organismus. Priony. Mikrobiální osídlení lidského těla. Antiinfekční imunita. Základy mykologie. Základy parazitologie. Antibiotika a chemoterapeutika, racionální terapie ATB. Vyšetřovací metody klinické mikrobiologie. Nosokomiální infekce. Sterilizace a desinfekce.

Praktická cvičení (týdenní blok):
Mikroskopické vyšetření v bakteriologii, mykologii a parazitologii. Nativní, fixovaný a barvení preparát. Barvící techniky. Aerobní a anaerobní kultivace bakterií (kultivační média, bakteriální kultury, morfologie kolonií). Identifikace bakterií (API, Pliva Staphytest, Streptotest, Enterotest). Průkaz toxinů. Stanovení citlivosti na antibiotika (diskový difusní test, MIC, MBC, E-testy). Kultivace kvasinek a plísní, GT-test. Serologické reakce (aglutinace, precipitace, imunodifuse, imunofluorescence, ELISA, imunoblot). Molekulárně biologické techniky detekce infekčního agens (PCR, hybridisace). Odběr a transport vzorků, odběrové soupravy.


Před začátkem praktických cvičení Mikrobiologie 2 (příští semestr) se bude psát vstupní test, ve kterém budou prověřeny znalosti získané na praktických cvičeních a přednáškách

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Entry requirements

 Prerekvizity : Biologie a genetika 1 (B00005)

Praktická cvičení: Praktická cvičení se konají v týdenních blocích, zahájení je vždy v pondělí ve 14:30 hod. Posluchači budou rozděleni do pracovních skupin po 16ti. Jmenný seznam je vyvěšen v souboru předmětu Mikrobiologie 1. Pomůcky a potřeby: plášť, obuv na přezutí, visací zámek k šatní skříňce, potřeby na psaní protokolů a skripta: J.Julák, Praktická cvičení a semináře z lékařské mikrobiologie. Karolinum, Praha. 2003. Poslední den v pátek se provede dezinfekce pracovních plášťů. Na chodbě před praktikárnami bude vozík, kam se odloží použité, označené pláště (z infekčního prostředí). Vydezinfikované, usušené pláště budou k vyzvednutí následující pondělí odpoledne.

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)

Registration requirements

prerekvizity

Last update: Novák Jan, RNDr., Ph.D. (23.05.2019)