|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (18.05.2020)
mikrobiální svět a jeho ekologická pravidla, která můžou, ale nemusí být stejná jako v nám bližším makrosvětě. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (18.05.2020)
Brock Biology of Microorganisms, 15th Edition. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (18.05.2020)
Ústní zkouška a protokoly z praktické části. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (18.05.2020)
Co je mikroorganismus? Jak je veliký? Limity velikosti a jejich příčiny a důsledky. Jak vznikly mikroorganismy? Zmenšením velkých nebo zvětšením žádných? Evoluce a historie mikroorganismů.
2. Strom života vs. roští života: speciality mikrobiální genetiky Existuje fylogeneze mikroorganismů? Vyměnitelné a stabilní části genomu. Horizontální přenos genetické informace. Existuje biologický druh u prokaryot? Speciace jako reakce na existenci různých stabilních strategií.
3. Ekologie v malém: Platí obecné ekologické principy pro mikroorganismy? Mikrobiální nika: může někde chybět „vhodná“ bakterie? Pro a proti prokaryotické buňky: kousni si, když to dokážeš. Konkurence fyziologií vs. konkurence tvarem, velikostí a chováním.
4. Mikroorganismy ve velkém měřítku: mikrobiální makroekologie Platí známé makroekologické principy pro mikroby? Existuje latitudinální gradient mikrobiální diverzity? Existuje mikrobiální biogeografie nebo je fakt všechno všude? Jak reagují mikroorganismy na změnu klimatu?
5. Mikroorganismy jako stroje: Jak energie dostupná v ekosystémech pohání tvorbu replikátorů Je život jen redoxní reakce? Co vše může být zdroj energie? Je v obyvatelné zóně Země nějaký nevyužitý geochemický zdroj energie? Mikrobiální metabolismy. Zdroje uhlíku. Zdroje a význam makro- a mikroživin.
6. Mikrobiální ekosystémy: Od boje se živly k občanským válkám Kde můžou žít jenom mikroorganismy? Jak řeší environmentální stresy? Jak dokážou žít pohromadě? Geneze ekosystému jako proces, od redoxního páru po strukturované prostředí.
7. Mikroorganismy v globálních cyklech látek Kolik jich vlastně je? Kde se nacházejí? Globální mikrobiální biomasa, produkce. Které jsou jen kuriozita a které jsou podstatné? Které chemické přeměny by bez mikrobů neprobíhaly nebo probíhaly jinak?
8. Metody analýzy mikrobiálních společenstev a ekosystémů Měření abundance a biomasy. Analýza struktury společenstva a populace. Měření aktivity. Největší výzva mikrobiologie: Jak se pozná mikrobiální proces od abiotického? Které jevy lze a nelze ze struktury společenstva odvodit? Klamy sekvenační mikrobiologie. Praktikum/Practical: Návštěva reálné lokality, odběr vzorků, terénní měření, analýza sekvenačních dat a interpretace. |