Praktikum z molekulární fylogenetiky - MB160C21

• Anglický název: Practical course of molecular phylogenetics
• Český název: Praktikum z molekulární fylogenetiky
• Zajišťuje: Katedra parazitologie (31-161)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2023 do 2023
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/22, Z [HS]
• Počet míst: 24
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Další informace: http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.
• Vyučující: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D.; Mgr. Jiří Novák

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (19.03.2010)

Praktické cvičení ke kurzu B160P21 Molekulární taxonomie. Obsah: Praktické cvičení
zaměřené na seznámení posluchačů se základními programy využívanými v molekulární taxonomii a příbuzných oborech a
základními molekulárně biologickými technikami používanými v molekulární taxonomii a fylogenetice. Počet posluchačů
může být omezen. Více informací na http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/.

angličtina

Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (10.02.2010)

Annotation - Application of molecular biology techniques in taxonomy, epidemiology, forensic medicine, evolutionary biology, sociobiology. Basic laboratory techniques, sequencing, molecular fingerprinting, DNA hybridization, allozyme analysis, immunological techniques. Genetic distances, construction of phylogenetic trees, analysis of statistical support for the trees. See also http://web.natur.cuni.cz/~vlada/moltax/.

Literatura

Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (04.08.2011)

Felsenstein J: Inferring phylogenies. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004

Hillis DM, Moritz C a Mable BK: Molecular Systematics, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 1996

Avise JC. Molecular Markers, Natural History and Evolution, second edition. Sinauer Associates, Inc., USA, 2004

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (16.12.2011)

Odevzdání samostatně vyřešené úlohy.

Sylabus

Poslední úprava: doc. Mgr. Vladimír Hampl, Ph.D. (24.09.2023)

Practicals will be held in room 311 (V7) on Thursdays at 14:50.

23. 11. – Database searches, sequence formats, alignment

30. 11. – Trees from the DNA sequences

7. 12. – Trees from amino acid sequences

14. 12. – Bayesian methods, molecular dating

21. 12. – Metabarcoding