|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (24.02.2012)
využití fluorescence a radioaktivně značených látek. Tyto metody jsou výhodné pro svou specifičnost, citlivost a relativní jednoduchost. Důraz bude kladen zejména na praktické provedení metod a interpretaci výsledků. UPOZORNĚNÍ: speciální limnologické metody je doporučeno absolvovat ve 2. ročníku navazujícího magisterského studia. |
|
||
Poslední úprava: VSACH (22.03.2005)
1. Riemann,B., Sondergaard,M. (Eds): Carbon dynamics in eutrophic, temperate lakes, (248 str.). Elsevier, Amsterdam, 1986.
2. Preparation of samples for liquid scintillation counting (a catalog) Nuclear Chicago Corporation, Des Plaines, USA, 1976.
3. Sherr B. F., Sherr E.B. and Fallon R. D., 1987. Use of monodispersed, fluorescently labeled bacteria to estimate in situ protozoan bacterivory. Appl. Environ. Microbiol., 53, 958-965.
4. Porter K. G. and Feig Y.S., 1980. The use of DAPI for identifying and counting aquatic microflora. Limnol. Oceanogr., 25, 943-948.
5. Hobbie,J.E., Daley,R.J. and Jasper,S., 1979: Use of Nuclepore filters for counting bacteria by epifluorescence microscopy. Appl. Environ. Microbiol. 33: 1225-1228. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (18.11.2011)
Zápočet je udělován za aktivní účast na kurzu a vypracované protokoly ze všech úloh. |
|
||
Poslední úprava: VSACH (29.04.2002)
P - přednáška, C - cvičení 1) P: Fluorescenční mikroskopie, pojem primární a sekundární fluorescence, specifická vazba fluorochromů. C: Příprava preparátů s nízkou fluorescencí pozadí, barvení DTAF a akridinovou oranží, rozlišení přítomnosti chlorofylu v buňkách mikroorganismů.
2) P: Barvení fluorochromy které se vážou na DNA, rozlišení mikroorganismů na prokaryota a eukaryota. C: Barvení DAPI (zvýraznění DNA a jader mikroorganismů), barvení primulinem (zvýraznění povrchových struktur prvoků).
3) P: Využití vícenásobného diferenciálního barvení fluorochromy v mikrobiální ekologii, modelový systém predátor-kořist. C: Barvení bakterií DTAF, dobarvení prvoků DAPI, stanovení rychlosti vyžírání bakterií prvoky.
4) P: Základy analýzy kinetických dat v biochemii: časové průběhy, saturační kinetika, užívané modely, software. C: Vyhodnocování kinetických dat pomocí počítače.
5) P: Spektrofluorometrie, základní principy a využití. C: Seznámení s obsluhou a kalibrací fluorometru, kalibrační křivka methylumbelliferonu (MUF).
6) P: Fluorometrické stanovení aktivity extracelulárních enzymů. C: Stanovení aktivity extracelulární fosfatázy a ß-glukosidázy pomocí příslušných MUF-substrátů.
7) P: Práce s radioaktivitou: základní pojmy, zákonné normy, vybavení izotopové laboratoře I. kategorie. C: Seznámení s vybavením izotopové laboratoře. Test ze znalostí předpisů pro práci s radioaktivitou (podmínka připuštění k práci s izotopy).
8) P: Měření radioaktivity scintilační spektrometrií. Teorie, obsluha a kalibrace scintilačního počítače, vyhodnocování výsledků. C: Seznámení s funkcí a obsluhou scintilačního počítače, kalibrace pomocí externích standardů.
9) P: Primární produkce 14C metodou, osud prim. prod. a extracelulární produkce 14C metodou. C: Stanovení primární produkce 14C metodou, část I.
10) P: Obrat rozpuštěného ortofosfátu 32P metodou, inkorporace 32P, stanovení dostupného ortofosfátu podle Riglera. C: Stanovení primární produkce 14C metodou, část II.
11) P: Bakteriální produkce inkorporací 3H-thymidinu, 3H-leucinu, 35S. C: Stanovení bakteriální produkce inkorporací 3H-thymidinu.
12) P: Inkorporace a oxidace 14C značených substrátů (glukóza, acetát...), heterotrofní aktivita dle Hobbie & Wright. C: Inkorporace 14C-glukózy.
13) P: Mikroautoradiografie - princip metody, použití značených substrátů (3H, 14C, 32P, 33P) pro planktonní objekty různých velikostí. C: Mikroautoradiografie s 3H-substráty, interpretace výsledků.
|