Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (16.04.2024)
Jednosemestrální praktický kurs (přednášky a cvičení) v angličtině je zaměřen na získání přehledu a praktických
dovedností v používání výpočetních metod pro moderní návrh léčiv. Je s výhodou, pokud frekventanti tohoto kursu
absolvovali přednášky o struktuře a funkci biomolekul, obecné chemii a použití počítačů k vědecké práci. Určeno
pro studenty 1. a 2. ročníku navazujícího magisterského studia (příp. pro 3. ročník bakalářského studia) a
pro postgraduální (Ph.D.) studenty včetně lékařských oborů.
V kurzu budou probírána následující témata:
1. Objevování nových biologicky aktivních látek
2. Struktura, dynamika a interakce v komplexech biomolekul s ligandy
3. Biologicky aktivní látky, jejich vlastnosti a interakce
4. Dokování, molekulová mechanika, dynamika, skórování
5. Návrh léků založený na ligandech
Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (16.04.2024)
One-semester practical course in English aims at obtaining an overview and hands-on
experience in using computational methods for modern drug design. It is desirable that the
attendees have previous knowledge of structure and function of biomolecules, general
chemistry and use of computers for scientific work. Aimed at Master students of 1st or 2nd
year (potentially 3rd year Bachelor students) and PhD students including medical faculties.
The topics covered in the course:
1. Discovery of new biologically active compounds
2. Structure, dynamics and interactions in biomolecule-ligand complexes
3. Biologically active compounds, their properties and interactions
4. Docking, molecular mechanics and dynamics, scoring
5. Ligand-based drug design
Literatura -
Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (16.04.2024)
Obsah přednášky je částečně pokryt v následujících knihách:
Základní: Young, D.C. Computational Drug Design. Wiley, 2009.
Krogsgaard-Larsen, P; Stromgaard, K; Madsen, U. Textbook of Drug Design and Discovery, 4th ed., CRC Press, 2010.
Doporučená: Young D.C. Computational Chemistry, a Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems. Wiley, 2001.