|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (21.02.2018)
Obecné charakteristiky buněčných signálních sítí Kontextualita odpovědi na sledovaný signál, specificita receptorů vůči „prvním poslům" Zesílení signálu na cestě od receptoru k efektorům, rozbíhání a sbíhání drah, existence uzlů, crosstalk Kompartmentalizace přenosů pomocí membrán a proteinových skeletů Vysoká mobilita signálních komponent Kódování signálu amplitudou a frekvencí změny koncentrace „posla" Využití reverzibilních posttranslačních modifikací , indukce proximity jako signál Modulární výstavba signálních proteinů, rekogniční kódy, kombinatorická komplexita signálních elementů Využití proteinových a RNA-"lešení" pro vznik signálních partikulí, využití řízeného foldingu a řízené proteolýzy signálních proteinů Kooperativní charakter buněčných odpovědí , kvantitativní limity pro vznik kvalitativních změn, konsolidace signálu uspořádané spouštění buněčných efektorových systémů, desenzitizace Protein-protein a protein-DNA rekognice S/T-specifické kinázy a fosfatázy (PKA), Y-specifické kinázy (Src), Receptory s Y-kinázovou aktivitou (InsR) Nadrodina steroidních-thyroidních receptorů NF-kappaB, p53/pRb, TGF-beta/Smad, Delta/Notch/CBF Koregulátory a histonový rekogniční kód Integrovaný model regulace genové exprese eukaryot |
|
||
Poslední úprava: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (06.07.2021)
General overview of cell signaling and basic principles: Molecular Biology of the Cell, 6th. Edition, 2014, Bruce Alberts, Alexander D. Johnson, et al. Molecular Cell Biology, 7th. Edition, 2013, Harvey Lodish, Arnold Berk, et al. Chapters 11, 13, 14, 15, 21, 23 Alternatively, use newer edition of any recognized international textbook on cell and molecular biology, biochemistry or molecular physiology. Cell signaling textbooks: Biochemistry of Signal Transduction and Regulation, Viley, 2014, G. Kraus Signal transduction, Academic press, 2015, ljsbrand Kramer Signal Transduction: Principles, Pathways, and Processes, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1st Ed., 2013, Lewis Cantley,Tony Hunter et al. Cellular Signal Processing: An Introduction to the Molecular Mechanisms of Signal Transduction, Taylor & Francis, 2nd Ed., 2017, Friedrich Marks et al. |
|
||
Poslední úprava: doc. RNDr. František Půta, CSc. (25.04.2012)
Zkouška je ústní z celého rozsahu přednášené látky. Předpokládány jsou elementární znalosti z biochemie a buněčné biologie. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (21.02.2018)
PSK01 Základní charakteristiky buněčných signálních sítí PSK02 cAMP – proteinkinasa A – CREB Od stimulace GPCR po aktivaci transkripčního faktoru CREB - proteinkinasa A jako základ pro pochopení dalších kináz PSK03 MAPKinasové kaskády - Jun Od mitogenní stimulace či působení stresových faktorů po aktivaci transkripčních faktorů komplexu AP1 - MAPKinasové moduly PSK04 Insulinový receptor - PI3Kinasy - FoxO Od aktivace insulinového receptoru přes tvorbu C3-fosforylovaných inosititdů po změny transkripce prostřednictvím FoxO - tyrozínová fosforylace a protein-proteinové interakce PSK05 AGC kinasy - GSK3 - PP1 Regulace metabolismu glykogenu - od insulinového receptoru po glykogensythasu - AGC kinasy, kinasa GSK3, fosfatasa PP1 - role defosforylace proteinů PSK07 Jaderné hormonální receptory Od steroidního ligandu po změny transkripčního faktoru - funkční architektura hormonálních receptorů PSK08 Jaderné receptory - koregulátory a chromatin Od jaderného receptoru po změny transkripce - transkripční koregulátory a změny na úrovni chromatinu PSK10 kinasa ATM - p53 - inhibitor CDK p21 Od poškození DNA po regulaci buněčného cyklu - tumorový supresor p53, inhibitory cyklin-dependentních kináz PSK11 signalizace TGFβ a inhibitory CDK Od ligandů přes receptorové PK po transkripční faktory Smad; regulace exprese a principy fungování inhibitorů cyklin-dependentních kináz PSK12 NFkappaB/Rel - fosforylace a dva typy ubiquitinylace Od vazby cytokinů na receptory po změny fungování transkripčních faktorů v jádře - regulovaná proteolýza v přenosu signálu PSK13 Signalizace Myc/Max a protein pRb Mitogenní signalizace Myc/Max a fungování pRb a E2F; Myc jako transkripční faktor řídící elongaci transkripce |