|
|
|
||
Poslední úprava: doc. RNDr. Helena Lipavská, Ph.D. (20.04.2018)
Doporučuje se předem absolvovat některou z přednášek Fyziologie rostlin, přednášku z Biologie buňky a ze základů molekulární biologie. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. David Honys, Ph.D. (08.03.2019)
Alberts B., et al.: Molecular Biology of the Cell. Garland Science Publishing Inc., 2002, ISBN 0-8153-4072-9. Atkins J.F. et al.: RNA Worlds. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011, ISBN 978-0-87969-946-8. Elliott D., Ladomery M.: Molecular Biology of RNA. Oxford University Press, 2011, ISBN 978-0-19-928837-3. Meister G.: RNA Biology. Wiley-VCH Verlag & Co. KGaA, 2011, ISBN 978-3-527-32278-7. Darnell J.: RNA: Life's Indispensable Molecule. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011, ISBN 978-1-936113-19-4. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. David Honys, Ph.D. (08.03.2019)
Ústní zkouška |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. David Honys, Ph.D. (08.03.2019)
1. Struktura a vlastnosti RNA. Typy RNA v buňce. Katalytická RNA, ribozymy. Centrální dogma molekulární biologie. RNA svět. Teorie inkorporace bílkovin do RNA světa. 2. Syntéza RNA. Organizace chromatinu. RNA polymerázy. Transkripce rRNA a tRNA. Transkripce pre-mRNA. 3. Regulace transkripce. Interakce DNA/protein. Transkripční faktory. 4. Zrání pre-mRNA. hnRNP částice. Formování 5'a 3'-konce pre-mRNA, čepičkování, polyadenylace. Editace pre-mRNA. Typy a mechanismus editace pre-mRNA 5. Sestřih pre-mRNA. Struktura genů eukaryotických buněk. Definice exonů a intronů. Introny I. a II. skupiny, Samosestřih. snRNA. Spliceosom. Trans-sestřih. Alternativní sestřih. 6. Transport mRNA v buňce. Export z jádra, transport v cytoplasmě. Struktura jaderných pórů. Import RNA-vazebných bílkovin do jádra. Mezibuněčný transport RNA u rostlin. 7. Stabilita mRNA. RNP částice. Interakce RNA/protein. RNA-vazebné bílkoviny. Sekvence nestability. RNA-degradační aktivity. Gene silencing. 8. Translační aparát. Ribosom - struktura, tvar a evoluce. Zrání rRNA, snoRNA, snoRNP. Struktura, vlastnosti a zrání tRNA. Aminoacyl-tRNA syntetázy. Ribosomální bílkoviny. Translace in vitro. 9. Translatabilita mRNA. Úloha cis- a trans- elementů, organizace 5'-UTR a 3'-UTR oblasti, poly(A) řetězce, mRNA-vazebných bílkovin. Zásobní skladovaná mRNA. Interakce mRNA s ribosomem. Regulace translace na úrovni preiniciačního komplexu. Úloha ER, cytoskeletu a ribosomálních bílkovin. 10. Iniciace translace. Iniciační faktory, 43S ribosomální komplex, struktura a funkce 48S a 80S iniciačních komplexů. 11. Elongace a terminace translace. Elongační faktory, elongační oblasti, terminace. 12. Regulace translace. Autoregulace, vývojová a fyziologická regulace, modely feritin a tubulin, dostupnost aminokyselin, Ca iontů a hormonů. Post-translační modifikace bílkovin. Fosforylace, glykosylace, prenylace, acylace, sestřih bílkovin, inteiny. 13. Minoritní typy RNA v buňce. Telomerasa, RNAsa P, 7SL RNA, apod. RNA svět v organelách. Transkripce a translace v mitochondriích. Transkripce a translace v plastidech rostlin.
|