|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Zdeněk Verner, Ph.D. (21.08.2023)
zhodnocení nejběžnějších laboratorních dat. Jednotlivé tématické bloky mají stručný teoretický úvod do probírané metodiky následovaný demonstrací metody v doporučeném softwarovém prostředí. Těžiště bloku je v praktickém procvičení daného tématu. Závěrečný blok je věnovaný diskuzi nad vlastními daty a možnostmi jejich hodnocení. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Zdeněk Verner, Ph.D. (21.08.2023)
Šmilauer a Lepš: Biostatistika (2016) Sokal a Rohlf: Biometry (2011) Nováková a Veselý: Jazyk R a tvorba grafů (2021) |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Zdeněk Verner, Ph.D. (21.08.2023)
Zápočet je udělen na základě minimálně 80% účasti na kurzu a úspěšného vypracování minimálně 60 % domácích cvičení a zápočtových příkladů. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Zdeněk Verner, Ph.D. (21.08.2023)
● Základy statistického uvažování: statistika v biologii, formulace a testování hypotéz, chyby, populace/výběr/náhodný výběr, sampling error, bias ● Data a jejich vizualizace: kvalitativní vs. kvantitativní data, exploratory data analysis, popisné statistiky, vizualizace dat, normální rozložení a transformace dat ● Experimentální design: observační/experimentální studie, základní pojmy a jejich význam - praktické příklady, randomizovaný design/bloky/faktoriální/nested, replikace/pseudoreplikace ● Použití MS-Excelu: import dat a jejich formátování, rozdíly mezi absolutními a relativními odkazy, vyhledávání dat v maticích ● Analýza kategoriálních dat: formulace hypotéz a jejich testování, možnosti kontingenčních tabulek ● T-testy: předpoklady a jejich ověření, typy t-testů a jejich provedení v MS-Excel RStudiu, on-line alternativy. ● ANOVA: předpoklady a jejich ověření, typy a jejich provedení v MS-Excel, post-hoc testy a on-line kalkulátory. ● Vztahy mezi dvěma faktory: korelace a kauzalita, Pearsonův a Spearmanův korelační koeficient, lineární regrese a její hodnocení, prokládání funkce daty v MS-Excel ● Základy zpracování a analýzy obrazových dat: FIJI, praktické důsledky různých typů bitových zobrazení, použití HiLo tabulky, slučování obrazových kanálů, základní charakteristiky tvarů, slučování snímaných rovin, kolokalizace obrazových bodů a jejich charakteristika pomocí Pearsonova a Mandersova koeficientu ● Diskuze nad vlastními experimentálními daty a designem pokusů.
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Zdeněk Verner, Ph.D. (21.08.2023)
Vzhledem k praktickému zaměření se předpokládá, že studenti již mají či v blízké budoucnosti začnou sbírat vlastní data. Práce probíhá na vlastních počítačích, nutným SW vybavením je MS-Office 365, RStudio a FIJI. |