Epigenetika - MB150P85
|
|
Soubory | Komentář | Kdo přidal | |
2023 Epigenetics Course Summary.zip | 2023 Epigenetika prehled | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics exam.zip | 2023 Epigenetika zkouska | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 1.zip | 2023 Epigenetika 1 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 10.zip | 2023 Epigenetika 10 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 2.zip | 2023 Epigenetika 2 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 3.zip | 2023 Epigenetika 3 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 4.zip | 2023 Epigenetika 4 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 5.zip | 2023 Epigenetika 5 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 6.zip | 2023 Epigenetika 6 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 7.zip | 2023 Epigenetika 7 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 8.zip | 2023 Epigenetika 8 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. | |
2023 Epigenetics 9.zip | 2023 Epigenetika 9 | prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. |
|
||
Poslední úprava: prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. (22.02.2019)
uvažují o vědecké kariéře v oblasti buněčné a molekulární biologie a biomedicíny. Kurz byl vytvořen podle přednášek v magisterském a PhD programu na University of Pennsylvania. Kurz je přednášen v angličtině interaktivní formou a používá původní data z oblasti epigenetiky. Zásadní důraz je kladen na syntézu znalostí a řešení problémů. Kurz pokrývá v první polovině tři hlavní epigenetické mechanismy: histonové modifikace, DNA metylaci a malé RNA molekuly. Ve druhé polovině pak tyto mechanismy integruje ve výkladu významných biologických procesů a modelů jako jsou imprinting, dosage compensation (včetně X-inaktivace), epigenetické reprogramování v životním cyklu savců a biologie kmenových buněk. V kurzu jsou podrobně rozebrány metody studia epigenetiky jako jsou chromatinová imunoprecipitace, bisulfitové sekvenování a RNAi. |
|
||
Poslední úprava: prof. Mgr. Petr Svoboda, Ph.D. (22.02.2019)
Studenti dostávají ke každé přednášce sadu tematických původních článků a recentních review. Studenti mají k dispozici aktualizovanou prezentaci k přednášce. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (14.09.2019)
COURSE PROGRAM: Introduction Overview of the course, basic concepts of epigenetic marks, diversity of epigenetic mechanisms and effects Histone modification I Concept of chromatin structure. Heterochromatin and euchromatin. Core histones, linker histones, replacement histones, protamines. Methods for studying chromatin. Histone modification II Histone modifications, polycomb proteins, acetylation, fosforylation and histone methylations, effects on gene expression. DNA methylation I Molecular basis of DNA methylation. CpG and non-CpG methylation. Adenosin methylation. Metods for studying DNA methylation. Bisulfite sequencing. DNA methylation II Effects of DNA methylation on gene expression, Methyl-binding proteins and mechanisms of inhibition of gene expression, distribution of DNA methylation within genes and mammalian genomes. Imprinting Concept of imprinting, mammalian imprinting. Molecular mechanisms of imprinting. Role of imprinting, Battle of the sexes. X-inactivation Principles and different strategies for dosage compensation. Control of X-inactivation in mammals. Epigenetic reprogramming in the mammalian life-cycle Integration of epigenetic modification in the mammalian life cycle. Reprogramming of gene expression during development, artificial reprogramming - the traditional view. Epigenetic mechanisms found in other model systems (plants, yeasts, invertebrates ...) Selected epigenetic mechanisms controlling genome integrity and gene expression RNA silencing I - molecular machines for RNA silencing A historical introduction into RNA silencing. Post-transcriptional effects. Roles and effects of dsRNA. Proteins and complexes in RNA silencing. RNA silencing II - RNAi technology Experimental and therapeutic use. Design of RNAi experiments RNA silencing III - roles of RNA silencing pathways miRNA pathway, chromatin connection. Integrated view of regulation of gene expression Establishment and maintenance of pluripotency in ES cells and embryos
Students are expected to actively participate during the course.
|