Molekulární imunologie - MB150P15A

• Anglický název: Molecular Immunology
• Zajišťuje: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2012 do 2012
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 5
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Z [HT]; letní s.:2/0, Zk [HT]
• Rozsah za akademický rok: 52 [hodiny]
• Počet míst: 70
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Vysvětlení: přednáší se ve čtvrtek ve Viničné 7, B2 od 15,45
• Další informace: http://mi.img.cas.cz/lab/ po zalogování: student/imuno
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Karel Drbal, Ph.D.
• Vyučující: RNDr. Karel Drbal, Ph.D.

Anotace

čeština

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.08.2013)

Pokročilý 2-semestrální přednáškový kurs je zaměřen na podstatné prohloubení znalostí o molekulárních mechanismech vybraných imunitních dějů, jejichž základy byly probrány v základní přednášce Imunologie, kterou musí studenti povinně absolvovat v předchozím ročníku včetně zkoušky (Imunologie - MB150P14B). Nebudeme zde opakovat celou základní imunologii, ale spíše provazovat funkce vybraných molekul imunitního systému s buňkami a onemocněními.
Určeno pro studenty 3.,4. a 5. ročníku a pro postgraduální (Ph.D.) studenty včetně lékařských oborů.

- V zimním semestru budeme probírat následující témata:
1/ úvod do metodiky: základní principy současných metod používaných v molekulární imunologii
2/ stavební kameny imunitního systému: molekulární mechanismy vzniku a funkce receptorů přirozené imunity, imunoreceptorů a MHC proteinů, NK receptorů, cytokinů/chemokinů a jejich příslušných receptorů, adhezivních molekul a další páry ligand/receptor

- V letním semestru se potom zaměříme na složitější systémy:
3/ důležité signalizační dráhy, související transkripční programy a jejich souhra na buněčné úrovni
4/ systémový pohled na molekulární úroveň imunitních dějů a jejich příčinné souvislosti s lidskými chorobami: funkční genomika, interaktom, metabolom, doménové a motivové uspořádání interagujících partnerů

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.08.2013)

Please note: the lectures are given in Czech language only. Once there is a serious demand to transfer the course to English, I would be more than happy. Please, write to: [e-mail]

Advanced 2-semestral lecture course focuses on substantial broadening of your knowledge about selected molecular mechanisms of immune system functioning that were covered within the previous basic course "Immunology" in the winter semester last year. It is essential to pass the exam (Imunologie - MB150P14B) prior to entering this course. We shall not discuss basic theory of immune system components once more, just stress the links between selected molecules and their function within the immune system and its pathology.
The course is targeted to 3rd, 4th and 5th class and PhD students in biomedicine.

In winter semester we will cover:
(1) methodology introduction
(2) molecular mechanisms of generation and function of immunoreceptors and MHC proteins, NK receptors, innate receptors, adhesion molecules, cytokines/chemokines and their respective receptors and other ligand/receptor pairs;

In summer semester we will cover:
(3) coherent implication of essential signaling pathways and transcriptional programs to the functioning of immune cells;
(4) systems biology view on molecules of the immune system ant their causative relationship to human disease: functional genomics, interactome, metabolome, domain a motif assembly of interacting partners

Literatura

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (26.08.2013)

Obsah přednášky je POUZE ČÁSTEČNĚ pokryt v následujících knihách:

Hořejší V., Bartůňková J.: Základy imunologie, 4. vydání, 316 str., Triton, Praha 2009 ISBN-13: 978-80-7387-280-9

(TATO KNIHA SLOUŽÍ JAKO ZÁKLADNÍ INFORMAČNÍ ZDROJ FUGOVÁNÍ IMUNITNÍHO SYSTÉMU, KTERÝ MUSÍTE ZNÁT Z PŘEDNÁŠKY IMUNOLOGIE V PŘEDCHOZÍM ROČNÍKU!)

Obecné imunologické učebnice:

Murphy K.: Janeway's Immunobiology (Immunobiology: The Immune System (Janeway)), 8th Edition, Garland Science Publishing 2011, 888 pages, ISBN-13: 978-0815342434

5. vydání je přístupné k vyhledávání na NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=imm.TOC&depth=2

A. K. Abbas, A. H. Lichtman, S. Pillai: Cellular and Molecular Immunology, 7th Edition, Saunders 2012, 560 pages, ISBN-13: 978-1-4377-1528-6

T. J. Kindt, R. A. Goldsby, B. A. Osborne: Kuby Immunology, 6th Edition, W.H. Freeman, 2006, 574 pages, ISBN-13: 978-0716785903

Metodické učebnice:

W. Luttman, K. Bratke, M. Kupper, D. Myrtek: Immunology (The Experimenter), 1st Edition, Academic Press Inc, 2006, 264 pages ISBN-13: 978-0120885442

http://books.google.cz/books?id=nHmCmG7koSkC

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (25.08.2013)

Zkouška je hodnocena bodově a skládá se ze 3 oblastí (1 povinné, výběru ze 2 volitelných a 1 dobrovolné):

1/ POVINNÁ KOMPILACE (60 bodů): povinná kompilační práce na téma, které bylo v rámci přednášky pouze nakousnuto. Student má na výběr z >20 témat, která budou zveřejněna v polovině zimního semestru. Každé vybrané téma poté student vypracuje samostatně přímo na Wikipedii (nutné založení osobního účtu), bude obodováno 0-40-ti body za věcnou správnost.

Adresa pro výběr a dokumentaci témat: https://docs.google.com/spreadsheet/ccc?key=0AiDuLDlbjsp0dE9BeUw3Wl9Za0JHNG50d0s0TWZmNUE

Hesla budou nejprve vytvořena v češtině / slovenčině a zkontrolovaná hesla potom mohou být přeložena do anglického jazyka (bodováno dalšími 20-ti body).

Tato kompilace (zisk počtu bodů za věcnou správnost >30) je podmínkou získání zápočtu v zimním semestru.

2/ VOLITELNÝ TEST / PROJEKT (160 bodů): v povinné druhé části zkoušky mají studenti na výběr z klasického písemného testu nebo projektu (celkem max. 160 bodů):

• TEST se skládá z 20 krátkých otázek, na které lze odpovědět jednoslovně nebo jednovětně (0-4 body za každou otázku) a výběr 2 ze 4 komplexních témat zpracovaných vždy na 1 A4 stranu (2x 0-40 bodů). Celkově tedy může student získat až 160 bodů. Časově je písemný test omezen 2 hodinami čistého času.

• PROJEKT: <10 projektů je zadáno v polovině ročníku na konci zimního semestru a student vypracuje podrobný návrh obsahující využití poznatků molekulární imunologie v diagnostice lidských onemocnění. Projektům se budeme věnovat podrobně v jednom termínu během druhé části letního semestru. Za projekt je možné obdržet až 160 bodů stejně jako za písemný test.

Neuspěje-li student v této druhé části, bude prozkoušen ústně v druhém zkušebním termínu.

3/ DOBROVOLNÉ NEPOVINNÉ TESTY = OPAKOVÁNÍ (80 bodů): mezi hodinami bude vždy vyvěšena anketa kontrolních otázek sumarizujících předchozí hodinu na síť a student zde může získat až 16 x 5 bodů za správné odpovědi v obou semestrech. Společně na úvod další hodiny probereme správně odpovědi.

Celkový možný bodový součet za zkoušku je 300 bodů, na 1 je třeba 250, na 2 alespoň 200, na 3 minimálně 150 bodů.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.08.2013)

PŘEDNÁŠKY ZIMNÍHO SEMESTRU
1. Úvod

2. Metody molekulární imunologie

3. Receptory přirozené imunity rozeznávají vetřelce v našich tělech = PAMP, DAMP, teorie nebezpečí

4. Toll like receptory, NOD like receptory, inflamazom

5. Receptory NK buněk, NKT buněk

6. Funkce MHC proteinů, klasické a neklasické

7. Diverzita TCR a BCR

8. Mechanismy signalizace přes imunoreceptory

9. Aktivace T lymfocytů - role kostimulačních receptorů

10. Cytokiny, chemokiny - jejich receptory a signalizace

11. Adhezivní molekuly, Fc receptory a komplementové receptory

12. Signalizační sítě a interakční domény proteinů

Další témata:

Charakteristické molekuly leukocytárních subpopulací

Principy základních imunologických, molekulárně biologických a biochemických metod

Přednáška je shrnuta v dostupných prezentacích (pdf), ovšem tyto jsou jen připomenutím faktů o kterých se v přednášce mluví. Pro úplné pochopení látky je nutná přítomnost na přednáškách. Samozřejmým předpokladem je znalost základů, tedy toho, co se probíralo v základní přednášce "Imunologie" v zimním semestru předchozího ročníku.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (24.08.2013)

LECTURES IN WINTER SEMESTER
1. Introduction

2. Methods in molecular immunology

3. Receptors of innate immune cells recognizing pathogens in our bodies = PAMP, DAMP, danger theory

4. Toll like receptors, NOD like receptors, inflammasome

5. Receptors of NK cells, NKT cells

6. MHC proteins function, classical and non-classical

7. Diversity of TCR and BCR

8. Mechanisms of signaling via immunoreceptors

9. Activation of T cells - the role of costimulatory receptors

10. Cytokines, chemokines - their receptors and signaling

11. Adhesion molecules, Fc receptors and complement receptors

12.Signaling networks and protein interaction domains

Additional topics:

• Characteristic markers of leukocyte subpopulations

• Principles of some relevant methods in immunochemistry, molecular biology and biochemistry

The lecture is available in presentation slides (pdf), which summarize the discussed topics. The presence at the lectures is essential for full understanding. Winter course "Immunology" plus passing the exam during previuos year is a prerequisite for participation in this course.

Vstupní požadavky

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (03.10.2015)

Základy imunologie byly probrány v základní přednášce Imunologie, kterou musí studenti povinně absolvovat v předchozím ročníku včetně zkoušky (Imunologie - MB150P14B: Hořejší, Brdička).
Absolvování základního kurzu Imunologie MB150P14B ovšem nelze oficiálně vyžadovat, protože pro magisterské studium nemůžeme dávat prerekvizity z bakalářského studia. Tím by se diskriminovali ti, kdo přichází po bakalářském studiu z jiných fakult. Těmto studentům doporučuji absolvovat předmět MB150P14E v angličtině v 1. ročníku magisterského studia.a posunout si předmět Molekulární imunologie do 2. ročníku magisterského studia.

Požadavky k zápisu

Poslední úprava: RNDr. Karel Drbal, Ph.D. (25.09.2014)

V úvodní lekci proběhne vstupní test, který zkontroluje vaše současné znalosti imunologie a dá vám doporuční zda je vhodné absolvovat předmět Molekulární imunologie v tomto nebo příštím roce.

Jedná se o stejný způsob testování, který vás čeká na konci ročníku. Test se skládá z 23 multiple choice otázek, kde jsou odpovědi hodnoceny na škále -2 až 5 bodů. Z celkového počtu 115 bodů je dostačující počet bodů pro vstup do předmětu - 50.