Stochastické modelování v biologii - NSTP069

• Anglický název: Stochastic Modelling in Biology
• Zajišťuje: Katedra pravděpodobnosti a matematické statistiky (32-KPMS)
• Fakulta: Matematicko-fyzikální fakulta
• Platnost: od 2014
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: zrušen
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: prof. Lev Klebanov, DrSc.
• Třída: DS, pravděpodobnost a matematická statistika
• Kategorizace předmětu: Matematika > Pravděpodobnost a statistika
• Záměnnost : NMST562
• Je neslučitelnost pro: NMTP572

Anotace

čeština

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

Kurz je určen pro seznámení studentů s aplikacemi stochastických procesů a matematické statistiky v biologii, např. v teorii přežití nebo testování modelů v biologii.

angličtina

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

This course is designed to familiarize students with applications of stochastic processes and mathematical statistics in biology, e.g. survival models, testing, etc.

Cíl předmětu

čeština

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

Cílem přednášky je interpretovat některé partie stochastických procesů a statistiky při řešení problémů moderní biologie.

angličtina

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

The aim of the lecture to interpret some parts of statistics and stochastic processes, typically used in some problems of modern biology.

Literatura

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

Taylor, H.M. and Karlin, S. An Introduction to Stochastic Modeling. 3rd Edition, Academic Press, Inc., 1998.

L.J.S. Allen (2003) An Introduction to Stochastic Processes with Applications to Biology. Pearson Prentice

Hall.

J.K. Percus (2002) Mathematics of Genome Analysis. Cambridge University Press, New York.

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: T_KPMS (17.05.2011)

Přednáška.

angličtina

Poslední úprava: T_KPMS (17.05.2011)

Lecture.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

1. Základy
1.1 Náhodné procesy a statistika.

1.2 Limitní věty.

1.3 Teorie přežití.

1.4 Metody vícerozměrné analýzy.

1.5 Vícenásobné testování.

2. Jak stochastické modely vznikají přirozeně v biologii.

2.1 Populační růst, epidemie, gen. regulační sítě, atd.

2.2 Stochastické (bio) chemické kinetické modely.

2.3 Modelování přežití a vyléčení.

2.4 Statistická analýza genových řad.

angličtina

Poslední úprava: T_KPMS (14.05.2010)

1. Background

1.1 Stochastic processes and statistics.

1.2 Limit theorems (approximation techniques) .

1.3 Survival theory.

1.4 Methods of multivariate analysis.

1.5 Multiple testing theory

2. Show how stochastic models arise naturally in biology.

2.1 Population growth, epidemics, gene regulatory networks, etc.

2.2 Stochastic (bio) chemical kinetic models.

2.3 Survival and cure modeling.

2.4 Statistical analysis of microarrays.