PředmětyPředměty(verze: 964)
Předmět, akademický rok 2024/2025
   Přihlásit přes CAS
Metody zpracování naměřených dat pro začátečníky - MO550P106
Anglický název: Data analysis for scared biologists
Český název: Metody zpracování naměřených dat pro začátečníky
Zajišťuje: Ústav pro životní prostředí (31-550)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2024
Semestr: zimní
E-Kredity: 3
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:písemná
Rozsah, examinace: zimní s.:2/1, Z+Zk [HT]
Počet míst: neomezen
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Poznámka: povolen pro zápis po webu
při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
Garant: prof. RNDr. Pavel Kindlmann, DrSc.
RNDr. Mgr. Ondřej Mudrák, Ph.D.
Vyučující: RNDr. Mgr. Ondřej Mudrák, Ph.D.
Anotace -
Kurz seznámí vyděšeného studenta biologie s vrozenou averzí k matematice se základními metodami prokládání empirických dat křivkou a se základními statistickými metodami zpracování dat. Drtivá většina studentů totiž znalost statistiky bude potřebovat. Všechny modely a simulace jsou prováděny v EXCELu či ve Statistice. Některé příklady budou uvedeny ve volně šiřitelném Pastu.

V rozvrhu jsou pro vás připraveny dvě paralelky a to jak pro přednášku tak pro cvičení. Paralelky poběží vždy ob týden - tj. jedna přednáška + cvičení v sudé ak. týdny, druhá v liché. V rámci "přednášky" dostanete krátký vhled do teorie, a to si vzápětí vyzkoušíte na úlohách v rámci cvičení.


Poslední úprava: Mudrák Ondřej, RNDr. Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Literatura

J. Lepš, P. Šmilauer (2016): Biostatistika. EPISTEME, České Budějovice, ISBN: 978-80-7394-587-9.

http://botanika.prf.jcu.cz/suspa/vyuka/statistika.php

R. Reisenauer (1970): Metody matematické statistiky, SNTL, Praha.

K. Zvára ( 1989): Regresní analýza. Academia, Praha.

N.J. Gotelli, A.M. Ellison (2004): A primer of ecological statistics. Sinauer Assoc. , Mass., USA.

Poslední úprava: Kindlmann Pavel, prof. RNDr., DrSc. (02.10.2021)
Požadavky ke zkoušce

Studijní materiály s teoretickým výkladem budou dostupné online studentům zapsaným do kurzu. Postupně během semestru, jak bude látka probírána tam nalezne následující:

- PowerPointové prezentace jednotlivých přednášek.

- Ve formátu MP4 uložené „videopřednášky“, tedy v podstatě "ozvučené filmy", kde přednášející vysvětluje probíranou látku na základě PowerPointového souboru.

- Další pomocné soubory využívané při přednášce a při cvičeních, tedy třeba soubory v Excelu s daty a podobně.

 

Ke splnění zápočtu bude vyžadováno správné vypracování dvou domácích úkolů, jež budou studentovi zadány v průběhu semestru.

 

Zkouška sestává ze zaškrtávacího testu obsahujícího (výběr zakřížkováním správné ze čtyř možných odpovědí). Test ověřuje osvojení si probrané látky.

Poslední úprava: Mudrák Ondřej, RNDr. Mgr., Ph.D. (18.09.2024)
Sylabus

P1. Základní funkce používané při prokládání dat v biologii, biologický význam jejich parametrů, nalezení prvotních odhadů parametrů na základě znalosti souřadnic význačných bodů (extrémy, asymptoty). Aplikace těchto křivek na běžné biologické závislosti, linearizace dat.

P2. Náhodná rozdělení (rovnoměrné, normální, binomické) a jejich použití v praxi. Typy dat, zobrazení dat, histogramy, tabulky četností.

P3. Míry střední hodnoty a variability a jejich odhady z empirických dat na základě výběru z populace.

P4. Testování hypotéz. Test významnosti rozdílu dvou veličin: t-test.

P5. Popisné statistiky, t-test, F-test ve Statistice a Pastu.

P6. Kontingenční tabulky.

P7. Jednocestná analýza variance.

P8. Dvoucestná analýza variance.

P9. Korelace a regrese. Korelační a determinační koeficienty, jejich výpočet a biologický význam. Metody prokládání dat u statických modelů, minimalizace součtu čtverců odchylek, příklady užití této metody v EXCELu a Statistice.

P10. Prokládání empirických dat křivkou - závislost pokryvnosti na nadmořské výšce, doba vývoje vs. teplota, křivka plodnosti, species-area, rychlost růstu vs. teplota, funkcionální odezva 2. a 3. typu dle Hollinga.

Poslední úprava: Mudrák Ondřej, RNDr. Mgr., Ph.D. (28.09.2023)
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK