Biologie kvasinek - MB140P24

• Anglický název: Biology of the yeasts
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2010 do 2013
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:písemná
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Zk [HT]
• Rozsah za akademický rok: 13 [týdny]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Úroveň: specializační
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. RNDr. Blanka Janderová, CSc.
• Vyučující: doc. RNDr. Blanka Janderová, CSc.
• Atributy: Modul Buněčná a molekulární biologie
• Je korekvizitou pro: MB140C24

Anotace

čeština

Přednáška seznamuje posluchače s biologií kvasinek v plném rozsahu. Zahrnuta jsou témata: cytologie, buněčný cyklus, stárnutí, apoptóza, konjugace, sporulace, killer fenomén, jaderný a mitochondriální genom, priony, transposony, metabolismus, taxonomie, patogenní kvasinky, kvasinky v průmyslu a v přírodě. Důraz je kladen na nejnovější poznatky kvasinkové genetiky a molekulární biologie. Na přednášku navazuje nepovinný praktický kurz.
Doporučuje se předchozí absolvování přednášky Základy molekulární biologie a Mikrobiologie.

Poslední úprava: Janderová Blanka, doc. RNDr., CSc. (04.09.2013)

angličtina

The lecture covers the wide area of the yeast biology: yeast cytology, regulation of the cell cycle,aging, apoptosis, mating, meiosis and sporulation, killer phenomenon, nuclear and mitochondrial genome, prions, transposons, yeast metabolism , taxonomy, yeast as pathogens, yeasts in industry, ecology of yeasts. The emphasis is laid on recent progress in understanding of the yeast genetics and molecular biology.

References:

The yeasts, Vol. 1-6, Ed. A.H.Rose, J.S.Harrison, Academic Press,1987-1995

The molecular and cellular biology of the yeast Saccharomyces, Vol.1-3, Ed. J.R.Pringle,
J.R.Broach, E.W.Jones, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1991-1997

Poslední úprava: Janderová Blanka, doc. RNDr., CSc. (04.09.2013)

Literatura

Janderová B., Bendová O.: Úvod do biologie kvasinek, skriptum, Nakladatelství Karolinum 1999

Rose A.H., Harrison J.S.: The yeasts, Vol. 1 - 6, 1987 - 1995

Broach J.R., Pringle J.R., Jones E.W.: The molecular and cellular biology of the yeast Saccharomyces, Vol. 1 -3, 1991-1997

Šipický M., Šubík J.: Genetika kvasiniek, 1992

Kocková - Kratochvílová A.: Taxonómia kvasiniek a kvasinkovitých mikroorganismov, 1990

Pospíšek M.: Kvasinkové dsRNA viry II, Biologické listy, 63: 115-138, 1998

Horová I., Janderová B.: Dimorfismus u Saccharomyces cerevisiae: pseudohyfální růst jako

projev alternativního buněčného cyklu, Biologické listy, 63: 1-16, 1998

http://www.bio.net:80/hyper. mail/YEAST/ - kvasinky na Internetu

http://genome-www.stanford.edu./Saccharomyces/ - genom S. cerevisiae

Poslední úprava: Vopálenská Irena, Mgr., Ph.D. (13.09.2018)

Sylabus

čeština

1. Úvod.

Definice kvasinek, význam, využití. Požadavky na prostředí - voda, teplo, kyslík. Kultury kvasinek v tekutém a na pevném médiu. Izolace kvasinek,

eliminace kvasinek. Morfologie kvasinek, typy rozmnožování, typy buněk.

2. Patogenní kvasinky.

Typy, identifikace, genetické determinanty virulence.

3. Průmyslově významné kvasinky.

4. Cytologie.

Pouzdro, buněčná stěna, jizvy, flokulace, plasmatická membrána, sekreční dráhy, jádro, vakuola, mitochondrie, peroxisomy, cytoskelet.

5. Průběh a regulace buněčného cyklu.

Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe. Fáze buněčného cyklu, start - výběr vývojových alternativ, genová regulace, cykliny, signální dráhy - Ras-cAMP dráha, , polarizovaný růst pupene - výběr místa založení pupene, polarizace růstu, pseudohyfální růst. Stárnutí a apoptóza.

6. Pohlavní rozmnožování kvasinek.

S. cerevisiae, Sch. pombe a další kvasinky. Životní cyklus u basidiomycetových kvasinek. Genetická determinace párovacího typu, homothalismus a heterothalismus, průběh konjugace, feromony, receptory, aglutininy, feromonová signální dráha. Sporulace - morfologické změny, biochemické změny, genetická determinace, spory.

7. Jaderný genom.

Metody studia, sekvenování genomu, variabilita, genom, transkriptom, proteom, umělé kvasinkové chromosomy, transposony, kvasinkové priony. 2 um a 3 um plasmidy.

8. Mitochondriální genom.

Velikost a uspořádání mt DNA, genetická mapa, mitochondriální mutanty, respiračně deficitní mutanty, přenos mitochondriálního genomu.

9. Killer fenomén.

Killer kmeny s dsRNA, cytoplasmatickou DNA, jadernou determinantou, charakteristiky systémů, mechanismy účinku, využití killer fenoménu.

10. Metabolismus.

Transport látek do buňky, zdroje uhlíku a energie, zdroje dusíku, zásobní látky. Metabolické regulace - katabolická represe, Pasteurův, Kluyverův a Custersův efekt. Kvasinkové ATPázy.

11. Taxonomie kvasinek.

Systém kvasinek podle dr. Kockové- Kratochvílové

Poslední úprava: Vopálenská Irena, Mgr., Ph.D. (13.09.2018)

angličtina

Please note, the lectures are given in czech language only.

1. Introduction.

Yeast definition, importance and exploitation of yeasts. Requirements on milieu ? water, temperature, oxygen. Yeast cultures in liquid and on solid medium. Cell morphology, modes of propagation, cell types.

2. Cytology.

Capsule, cell wall, scars, flocculation, plasma membrane, secretion pathways, nucleus, vacuole, mitochondria, peroxisomes, cytoskeleton.

3. Cell cycle.

Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe. Phases of the cell cycle, Start ? selection of developmental possibilities, gene regulation, cyclins, signal pathways, polarised growth of the bud, pseudohyphal growth. Senescence and apoptosis.

4. Sexual reproduction of the yeasts.

S. cerevisiae, Sch. pombe, other yeasts. Life cycle of basidiomycetous yeasts. Genetic determination of mating type, homothallism, heterothallism, conjugation, pheromones, receptors, agglutinins, pheromone signal pathway. Sporulation ? morphological, biochemical processes, genetic determination, spores.

5. Nuclear genome.

Methods of its study, sequencing of the genome, variability, characteristics of the genome of various yeasts, transcriptome, proteome, artificial yeast chromosomes, transposons, prions. 2 ?m plasmid.

6. Mitochondrial genome.

Sizes and organization of mtDNA, genetic map, mitochondrial mutants, respiratory deficient mutants, transfer of mtDNA.

7. Killer phenomenon.

Killer strains with dsRNA, cytoplasmatic DNA, nuclear ?killer genes?, characteristics of various killer systems, modes of action, exploitation of killer phenomenon. Yeasts ? predators.

8. Metabolism.

Import of the chemicals into the cell, sources of carbon and energy, sources of nitrogen, carbohydrate reserves. Metabolic regulations ? catabolic repression, Pasteur effect, Custers effect, Kluyver effect. Pathways of the sensoring of nutrients. Yeast ATPases.

9.Pathogenic yeasts.

Types, identification, genetic determinants of virulence.

10.Industrially important yeasts.

11.Taxonomy of the yeasts.

Poslední úprava: Vopálenská Irena, Mgr., Ph.D. (28.10.2019)