|
|
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Neustupa, Ph.D. (10.10.2017)
Pro smysluplné absolvování předmětu je velmi dobré předtím navštěvovat předmět MB120P126 "Multivariační metody v taxonomii". V letním semestru 2016 se Geometrická morfometrika koná v úterý od 18:10 v učebně B13 v Benátské 2. Poprvé se sejdeme v úterý 23.2. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Neustupa, Ph.D. (10.10.2017)
1. Úvod (internetové stránky, přehled software). Morfologie a morfometrika; vývoj kvantitativního myšlení v morfologii; biologický strukturalismus. 2. Typy morfometrických metod - lineární vzdálenosti a úhly; obrysové metody, landmarková (geometrická) morfometrika. 3. Obrysové metody (eliptická Fourierova analýza). Digitalizace obrysů, harmonické koeficienty, zpracování a hodnocení výsledků, rekonstrukce obrysů. 3. Landmarkové metody - digitalizace landmarků, Booksteinovy tvarové souřadnice, generalizovaná prokrustovská analýza, thin plate spline. 4. Hlavní a částečné warpy, analýza relativních warpů - vliv parametru "alfa". Mnohorozměrná regrese nezávislých proměnných na tvarové proměnné, metoda parciálních nejmenších čtverců. Rekonstrukce teoretických či průměrných tvarů. CVA tvarových proměnných při analýze skupinových rozdílů. 5. Semilandmarky. Použití landmarkových metod na struktury bez homologních landmarků. 6. Morfologická asymetrie v biologii - evoluční a ekologický význam. Rozklad asymetrie v geometrické morfometrice. 7. Rekonstrukce a modelování obrazu pomocí geometrické morfometriky.
Literatura: 1. Dryden, I.L. & Mardia, K.V. (1998): Statistical shape analysis. - John Wiley & Sons, New York. 2. http://life.bio.sunysb.edu/morph/ 3. Zelditch M.L., Swiderski D.L. & Fink W.L. (2004): Geometric Morphometrics for Biologists: A Primer. Elsevier. [E-book na: http://www.sciencedirect.com/science/book/9780127784601] |