Last update: RNDr. Gabriela Mikušová, Ph.D. (05.01.2018)
The lecture comprises the basics of the general microbiology with particular focus on bacteria. The most important topics are covered: structure and function of bacterial cell, growth, metabolism, interactions with environment and host, diversity of microorganism, pathogeny and the practical use of microorganisms.
The course is held in Czech language.
References:
Brock Biology of Microorganisms, Eds. Madigan, Martinko, Stahl, Clark, 13th Edition, 2012, Pearson (or higher edition)
Základy bakteriologie, F. Kaprálek, 1999, Karolinum
Last update: RNDr. Petra Lišková, Ph.D. (08.03.2022)
Přednáška je pojednána jako obecná mikrobiologie s hlavním důrazem na bakterie. Posluchač se dozví základní údaje o stavbě bakteriální buňky, jejím růstu, metabolismu, interakcích s prostředím včetně člověka, o rozmanitosti mikroorganismů, jejich patogenitě a využití člověkem v průmyslové mikrobiologii.
Předpokládá se znalost alespoň základů biochemie (nicméně nejdůležitější témata nutná pro pochopení přednášené látky budou stručně probrána).
Předmět je primárně určen posluchačům oborů Klinická a toxikologická analýza, Geobiologie a Praktická geobiologie. Přednáška probíhá společně s MB140P88.
Nutnou podmínkou závěrečné zkoušky je absolvování doprovodného turnusového mikrobiologického praktika a zápočet z něj.
Praktika budou vyučována prezenčně v termínu dle rozvrhu. Pokud to epidemiologická situace neumožní, proběhnou v daném termínu distančně. Studenti budou o formě konání praktik informováni s týdenním předstihem prostřednictvím SIS a Moodle.
Přednášky budou uskutečňovány prezenčně.
Literature -
Last update: RNDr. Michaela Schierová, Ph.D. (26.10.2019)
Brock Biology of Microorganisms, Madigan, Martinko, Stahl, Clark (Eds.), 13th Edition, 2012, Pearson Education, Inc. (případně pozdější vydání)
Presentations are regularly updated and available at Moodle MB140P26/MB140P88
Last update: RNDr. Gabriela Mikušová, Ph.D. (05.01.2018)
Brock Biology of Microorganisms, Madigan, Martinko, Stahl, Clark (Eds.), 13th Edition, 2012, Pearson Education, Inc. (případně pozdější vydání)
Základy bakteriologie, F. Kaprálek, 1999, Karolinum
Prezentace k přednáškám - budou průběžně k dispozici v Moodle - kurz MB140P26/MB140P88
Requirements to the exam
Last update: RNDr. Gabriela Mikušová, Ph.D. (16.04.2020)
The exam is a written one, questions are based on the sylabus.
Topics are published in Moodle.
A prerequisite for the exam is a credit from practical exercises.
In the academic year 2019/2020 there will be an alternative distance form of the practical course. Students are given study materials in Moodle and should pass the online test in Moodle to get the credits.
Syllabus -
Last update: RNDr. Gabriela Mikušová, Ph.D. (25.10.2019)
1. Microorganisms and microbiology
· properties of the cells, three domains of life, role of microorganisms in the environment
· microbiology in historical context
2. Microbial cell structure and function
· microscopy, Gram staining
· cells of bacteria – cell wall, cytoplasmic membrane and transport, nucleoid, ribosomes, inclusions, flagellum, pili, capsule, gas vesicles, bacterial locomotion
· endospores, sporulation
3. Molecular microbiology
· bacterial genome - chromosome, plasmids
· horizontal gene transfer - transformation, transduction, conjugation, transposition
· gene cloning, mutation, selection
· restriction endonucleases
4. Microbial metabolism
· cell chemistry and nutrition
· media and laboratory culture
· energy classes of microorganisms
· Bioenergetics – free energy, redox potential, activation energy, glycolysis, Krebs cycle, electron donors and acceptors, ATP
· person-to-person bacterial and viral diseases, airborne bacterial and viral diseases, direct-contact diseases, sexually transmitted infections, vectorborne and soilborne infections, water and food as vehicles of bacterial diseases
10. Industrial microbiology and biotechnology
· eukaryotic microbial cells
· microorganisms in food industry
· production of antibiotics, enzymes and vitamins,
· bioremediation, wastewater and drinking water treatment
Last update: RNDr. Petra Lišková, Ph.D. (05.01.2022)
1. Mikroorganismy a mikrobiologie
Vymezení pojmů, náplň oboru mikrobiologie, základní vlastnosti buňky, evoluce života, tři domény organismů, životní prostředí mikroorganismů a jejich úloha v něm, mikroorganismy a člověk, stručná historie mikrobiologie.
2. Buňka
Techniky pozorování mikroorganismů, struktura prokaryotní buňky - buněčná stěna, membrána, membránový transport, cytoplazma, jádro, ribozómy, buněčné inkluze, bičíky, pili, fimbrie, pouzdra, plynové vakuoly, magnetozómy, pohyb bakterií, struktura eukaryotické mikrobiální buňky.
3. Molekulární mikrobiologie
Bakteriální genom - chromozom, plazmidy. Horizontální přenos genetické informace - rekombinace, transformace, transdukce, konjugace, transpozice, princip klonování, pojem mutace, restrikční endonukleázy.
4. Výživa a metabolismus
Chemické složení buňky, prvky a živiny, kultivace mikroorganismů, živné půdy. Organismy podle typu energetického metabolismu a zdroje uhlíku. Základní metabolické dráhy a principy - volná energie, redoxní potenciál, aktivační energie, glykolýza, Krebsův cyklus, přenašeče redukčních ekvivalentů, ATP. Fermentace, aerobní respirace, anaerobní respirace, chemolitotrofie, fototrofie.
5. Růst bakteriální buňky
Růst individuální bakteriální buňky a její dělení, růst bakteriální populace, růstová křivka, kontinuální kultivace bakterií.
6. Bakterie a prostředí
Vliv teploty, pH, vodní aktivity, osmotického tlaku, záření na růst mikroorganismů, vztah mikroorganismů ke kyslíku. Prevence růstu mikroorganismů - fyzikální a chemické metody (sterilizace, dezinfekce, antisepse).
Životní prostředí bakterií (terestrické, vodní, hostitel), symbióza mezi mikroorganismy, rostliny a savci jako přirozené prostředí mikroorganismů
7. Evoluce a systém
Vznik života na Zemi, evoluce mikroorganismů, tři domény organismů. Zvláštnosti systematiky mikroorganismů, prokaryotní druh, genosystematika, fylogenetika, charakteristika hlavních systematických skupiny eubakterií a archebakterií.
8. Interakce mikroorganismů s člověkem
Fyziologické osídlení lidského těla, patogenita a virulence mikroorganismů, bakteriální toxiny. Nespecifická a specifická imunita, vakcinace.
9. Infekční choroby způsobené bakteriemi
Patogeny přenosné kontaktem člověk-člověk, přenašeči, z půdy, vodou, potravinami, nosokomiální nákazy. Antimikrobiální látky a rezistence k nim.
10. Průmyslová mikrobiologie a biotechnologie
Mikroorganismy využívané v průmyslu a biotechnologiích. Výroba antibiotik, aminokyselin, vitaminů, enzymů, biopaliv, bioplastů. Mikroorganismy v potravinářství - výroba piva, vína, droždí, octa, lihu, mléčných výrobků. Rekombinantní technologie. Biodegradace, bioremediace.
