Please note, the lectures are given in czech language only. Genetic methods in zoology - a survey of methods and
approaches. The course includes a practical in molecular laboratory and an introduction to computer analysis of
data. You may like to see a similar course Molecular Applications in Zoology, which is given in English.
Last update: Munclinger Pavel, doc. Mgr., Ph.D. (12.02.2018)
Kvůli rekonstrukci posluchárny letos (2024) přednášky proběhnou turnusově v BIOCEVu.
Praktika proběhnou turnusovým způsobem během zkouškového období.
Kurz tvoří přednášky, praktická cvičení v laboratoři a úvod do počítačového zpracování dat. Cílem je seznámit
studenty se základy většiny genetických metod používaných v zoologii a jejich využitím. Praktická část slouží k
procvičení laboratorních dovedností studentů a k získání základních znalostí nutných k počítačovému zpracování
genetických dat.
Více informací a učební texty lze najít na adresách:
Přednášky na Moodle:
http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=507
Přednáška a data pro počítačovou část o databázích:
http://web.natur.cuni.cz/~muncling/
Pro zájemce o tuto problematiku existuje ještě přednáška "Molekulární ekologie živočichů", která na "Genetické
metody v zoologii" volně navazuje. Pro teoretické základy je vhodná přednáška Evoluční genetika.
Jinými slovy:
Evoluční genetika: teoretické základy
Genetické metody: jak se vyrábí data a pipetuje
Molekulární ekologie: jak pracovat s daty
Last update: Munclinger Pavel, doc. Mgr., Ph.D. (30.09.2024)
Literature -
Avise, 2000: Phylogeography: the history and formation of species.
Avise, 2004: Molecular Markers, Natural History, and Evolution, Second Edition
Arnold, 1997: Natural hybridization and evolution.
Balding, Bishop & Cannings (eds.), 2003: Handbook of statistical genetics, second edition.
Beebe & Rowe, 2004: An introduction to molecular ecology.
Hartl, 1999: A primer on population genetics.
Hartl & Clark, 1997: Principles of population genetics, third edition.
Hoelzel AR 1992: Molecular analysis of populations. Oxford Univ. Press.
Zima J., Macholán M., Munclinger P., Piálek J., 2004: Genetické metody v zoologii. Nakladatelství Karolinum, Praha, 239 s. (učební text)
Last update: Peterková Jindřiška, Ing. (26.04.2017)
Requirements to the exam - Czech
Zápočet se uděluje za aktivní řešení úloh na cvičeních.
Zkouška je formou písemného testu. Otázky se týkají témat z přednášek. Absolvování a nastudování přednášek by tedy mělo být dostečné pro úspěch při testu.
V případě on-line výuky bude zkouška a zápočet probíhat distanční formou.
Last update: Munclinger Pavel, doc. Mgr., Ph.D. (08.10.2021)
Syllabus -
Signal phenotype, coat colour genetics, epigenetic characters, geometrical morphology, karyotypes, chromosome banding, FISH, protein electrophoresis, allozymes and isozymes, DNA/DNA hybridisation, DNA cloning, PCR, RFLP, DNA fingerprinting, microsatellites, RAPD, sequencing, genomics.
Last update: Peterková Jindřiška, Ing. (26.04.2017)
GENETICKÉ METODY V ZOOLOGII osnova
Analýza fenotypu
fenotyp a genotyp
kvantitativní a kvalitativní znaky
signální fenotypy
nemetrické (epigenetické) znaky
homeotické mutace u octomilek a obratlovců
biochemie krevních skupin savců
Cytogenetika
základní pojmy
metodologické mezníky ve studiu chromosomů
vyšetření mitotických chromosomů
vyšetření meiotických chromosomů
proužkování chromosomů
chromosomy a monitorování mutagenních vlivů prostředí
in situ hybridizace
fluorescenční detekce míst hybridizace - FISH
vybavení cytogenetické laboratoře
Biochemická genetika
základní pojmy
principy elektroforézy
základní metody
nosiče
schopnost separace
detekce proteinů
vlastní postup
omezení metody
aplikace
Molekulární genetika
úvodní pojmy
odběr a uchovávání vzorků
extrakce DNA
hybridizace DNA
polymerázová řetězová reakce (PCR)
restrikční analýza
proměnlivost délky tandemově opakovaných motivů
(VNTR, variable number of tandem repeats)
proměnlivost konformace fragmentů
proměnlivost restrikčních míst
sekvencování DNA a aplikace
Last update: Peterková Jindřiška, Ing. (26.04.2017)