Subjects

Your browser does not support JavaScript, or its support is disabled. Some features may not be available.

Microbiology - GAF433

Title:	Microbiology
Form of teaching:	lecture
Guaranteed by:	Department of Biomedical Sciences (16-16150)
Faculty:	Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
Actual:	from 2026
Duration in semesters:	1
Semester:	summer
Points:	0
E-Credits:	3
Examination process:	summer s.:written
Hours per week, examination:	summer s.:32/0, Ex [HS]
Capacity:	unknown / unknown (unknown)
Maximum number of enrolled students:	unlimited
Min. number of students:	unlimited
4EU+:	no
Virtual mobility / capacity:	no
Key competences:
State of the course:	taught
Language:	English
Teaching methods:	full-time
Level:
Repeated enrollment:	1 / 1 / - / 1
Note:	deregister from the exam date if a requisite was not fulfilled

Guarantor:	RNDr. Klára Konečná, Ph.D.
Comes under:	2.ročník 2026/27 Pharmacy (EN26)
Co-requisite :	GAF394
Incompatibility :	GAF129
Pre-requisite :	GAF410
Interchangeability :	GAF129
Is co-requisite for:	GAF397

Annotation -

The subject Microbiology belongs to biological disciplines, providing basic knowledge about biology, morphology, metabolism, genetics, and pathogenicity of microorganisms. The emphasis is put on fundamental aspects of the relationship between microorganism-host-environment and antimicrobial agents. During the study, the student will gain an overview of various microbial entities. Among other things, the most medically relevant pathogens of infectious diseases and the basic techniques for detecting microbial agents in microbiological laboratories are introduced. The issue of antimicrobial therapy is included in the overview, as well. Education aims to prepare students to extend the basic knowledge from the subject for subsequent studies and on the application of knowledge in medical practice.

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Course completion requirements -

Exam conditions:

Successfully passed exam test. Exam test, in summary 30 questions (20 questions – multiple choice, 10 questions /open- ended questions).

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Literature -

Obligatory:

. . In Hanlon, Geoffrey Hodges, Norman. Essential microbiology for pharmacy and pharmaceutical students . : Chichester, West Sussex, UK: John Wiley & Sons, 2013, s. -. ISBN ISBN 978-0-470-66534..

. . In Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S. Kobayashi, George S. Pfaltz, C. R.. Medical microbiology . St. Louis: Mosby Company, 2002, s. -. ISBN 0-323-01213-2..

. . In Hugo, W. B. Russell, A. D. (eds.). Pharmaceutical microbiology . Oxford: Blackwell Science, 1998, s. -. ISBN 0-632-04196X..

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Teaching methods -

lectures, PPT presentations, comments for included slides, learning outcomes

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Course assessment methods and requirements for successful completion, grading scheme -

Knowledge defined by questions within the learning outcomes documents (Study materials).

Knowledge of discipline defined in sylabus of the subject.

TOPICS IN THE SUBJECT MICROBIOLOGY

Part: General microbiology

1. The subject microbiology – aim of the study, disciplines, special/applied disciplines.

2. The role of microorganisms in nature – ecological role, role in medicine.

3. Utilization of microbes in food industry, biotechnological processes, bioremediation.

4. Microbes - their metabolism and relation to oxygen (photoautotroph, photoheterotroph, chemoautotroph, chemoheterotroph, strict aerobe, anaerobe, facultative anaerobe, …, (source of energy/carbon, examples).

5. The growth curve and factors affecting the growth of microbes.

6. The role of microbes in ecosystems – destruent, saprophyte, parasite, pathogen. Relations among organisms – symbiosis, commensalism, mutualism, parasitism.

7. Taxonomy of microorganisms – nomenclature and classification, binomial nomenclature.

8. Prokaryotic vs. eukaryotic cell – comparison; bacteria, mycobacteria, fungi – (cell structure, cell wall, cytoplasmic membrane, genetics, reproduction).

9. Archaebacteria – main characteristic – size, cell structure, metabolism.

10. Bacteria - main characteristic – size, cell structure, metabolism, ecological role.

11. Eukaryotes - main characteristic – size, cell structure, metabolism, ecological role.

12. Fungi - main characteristic – cell structure (cell wall, cytoplasmic membrane), metabolism, growth - blastospores, mycelium, hypha, dimorphism; role in ecosystem; diseases (mycetism, mycotoxicosis, mycoallergy, mycosis, dermatomycosis, endemic mycosis, opportunistic mycosis).

13. Viruses - main characteristic, structure, reproduction, classification (DNA/RNA viruses, capsid symmetry, envelope), bacteriophage – main characteristic, gene engineering, phage therapy, lysogenic conversion.

14. Viral pathogenesis – lytic, lysogenic cycle, transformation.

15. Prions – main characteristic.

16. Theory of spontaneous generation, theory of biogenesis.

17. A. van Leeuwenhoek, L. Pasteur, R. Koch, J. Lister, E. Jenner, A. Fleming - their contribution to microbiology.

18. Bacterial genetics – chromosome, plasmid, transposons, genotype, phenotype, DNA polymerase, operon, mutations.

19. Parasexual processes in bacteria – transformation, transduction, conjugation.

20. Obligate parasite/pathogen, opportunistic pathogen/parasite.

21. Transmission of infectious particles – direct way, indirect way, vector, antropozoonosis, zoonosis.

22. Infection (inaparent, latent, manifestative), anatomical localization of infections, phases of infections.

23. Host defence mechanisms – mechanical, chemical, immune, ecological barriers.

24. Pathogenesis, factors of virulence – adhesins, enzymes, toxins, dimorphism.

25. Resistance – intrinsic, acquired, clinical resistance, microbiological resistance, multidrug resistance, cross-resistance, co-resistance, molecular mechanisms of resistance.

26. Determination of sensitivity/resistance to antimicrobials in vitro – disc diffusion method, E-test, broth microdilution method - MIC, MBC.

Part: Medical microbiology

27. Gram positive cocci - St. aureus, St. epidermidis, … (morphology, catalase, plasmacoagulase, haemolysins, toxins, enzymes production, infections), MRSA, VRSA.

28. Gram positive cocci – streptococci, enterococci; division according to haemolysis, antigenic structure, pathophysiology, Streptococcus pyogenes, Str. agalactiae, oral streptococci, Str. pneumoniae, E. faecium (disease, toxins, enzymes production, therapy).

29. Gram negative cocci – meningococci, gonococci (Neisseria meningitidis, N. gonorrhoeae) – disease, transmission, prevention, laboratory diagnostics.

30. Gram negative bacteria/rods – genus: Salmonella, Shigella, Yersinia (disease, transmission, diagnostics – serotypization), coliform bacteria – Escherichia (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC), Klebsiella, Citrobacter; aerobic Gram negative rods – Pseudomonas sp., Vibrio sp. (disease).

31. Spirochetes -Treponema pallidum, Borrelia burgdorferi (transmission, disease, therapy).

32. Mycobacteria – tuberculosis, mycobacteriosis (causative agents, therapy, laboratory diagnostics).

33. Sexually transmitted diseases - syphilis, gonorhea, ulcus mole, AIDS, herpes genitalis, … (causative agents, symptoms of disease, therapy).

34. Viruses - family: Herpesviridae, HSV1, HSV2, herpes virus varicellae-zosteris, cytomegalovirus, virus Epstein-Barr (transmission, disease, therapy, prevention).

35. Viruses - family: Poxviridae, smallpox virus, vaccinia virus (transmission, disease, therapy, prevention).

36. Viruses - influenza viruses (transmission, antigenic shift, antigenic drift, disease, therapy, prevention).

37. Hepatitis viruses – HAV, HBV, HCV, HDV (transmission, disease, therapy, prevention).

38. Retroviruses - HIV (transmission, tropism, symptoms of disease, therapy, prevention).

39. Mumps, measles, rubella viruses (transmission, disease, therapy, prevention).

40. Superficial mycosis – infections (pytiriasis versicolor, dermatomycosis – tinea, onychomycosis, white/black piedra).

41. Subcutaneous mycosis – chromoblastomycosis, subcutaneous zygomycosis, mycetoma.

42. Dimorphic fungi – occurrence, disease, causative agents.

43. Yeast infections – Candida albicans, dimorphism, pathogenesis, risk factors, disease (cutaneous, subcutaneous, systemic), Cryptococcus neoformans – virulence factor, disease, risk factors.

44. Moulds – Aspergillus spp., Mucorales – diseases.

45. Medically important protozoa – forms (trophozoit, cyst), amoebae - Entamoeba hystolytica, Entamoeba gingivalis – transmission, disease, therapy; flagellated parasites - Giardia lamblia (intestinalis), Trichomonas vaginalis, Trypanosoma gamblinese, Leishmania sp. – occurence, transmission, disease, therapy; parasitic alveolate - -Toxoplasma gondii – transmission, disease.

46. Blood parasites – Plasmodium spp., occurrence, transmission, malaria (tertian fever, quartan fever), prevention, therapy; laboratory diagnostic.

47. Parasitic helminths - nematoda – common characteristics; Trichinella spiralis, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, filaria… (occurrence, transmission, disease).

48. Parasitic helminths – flatworms- cestoda, trematoda – common characteristics, transmission; Trichinella spiralis, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, filaria…(occurrence, transmission, disease).

49. Types of clinical specimens – naturally sterile, non-sterile materials.

50. Light microscopy – slide preparation for microscopy – wet/stained mounts, Gram staining, acid-fast staining by Ziehl-Neelsen, Burry staining, Giemsa staining technique.

51. Cultivation of microorganisms – cultivation condition, cultivation atmosphere, growth media – blood, Endo, Loewenstein, Mueller-Hinton, McConkey, Sabouraud agar.

52. Microbial flora of human body – examples, the role.

Part: Pharmaceutical microbiology

53. Antimicrobial agents, definitions: disinfectants, antiseptics, preservatives, antibiotics.

54. Disinfectants – definition, categories/classification, application, examples, factors affecting effectiveness.

55. Antiseptics – definition, application, examples, ideal antiseptic.

56. Preservatives – definition, effect, application, examples.

57. Antimicrobials – classification according ethiology, definition, application, classification according the effect/according the spectrum of activity.

58. Antibiotics – classification according to the target in microbes/mechanism of action.

59. Antibiotics – classification according to chemical structure.

60. Beta-lactam antibiotics – target, mechanism of action, spectrum, mechanisms of resistance, groups – penams, cephems, carbapenems, monobactams- examples; inhibitors of beta-lactamases.

61. Aminoglycosides – mechanism of action, spectrum, examples, mechanisms of resistance.

62. Tetracyclines - mechanism of action, spectrum, examples, mechanisms of resistance.

63. Chloramphenicol - mechanism of action, spectrum, examples, mechanisms of resistance, toxicity.

64. Glycopeptides - mechanism of action, spectrum, examples, toxicity.

65. Macrolides - mechanism of action, spectrum, examples.

66. Lincosamides - mechanism of action, spectrum, examples.

67. Quinolones - - mechanism of action, spectrum, examples – division into generations, contraindication.

68. Ansamycins - mechanism of action, spectrum, examples, resistance.

69. Sulphonamides - mechanism of action, spectrum, examples.

70. Nitrofurans/Nitroimidazoles - mechanism of action, spectrum, examples.

71. Antituberculotics - mechanisms of action, examples.

72. Antiviral drugs – mechanism of action, examples: aciclovir, ganciclovir, amantadine, zidovudine, stavudine, tenofovir, adefovir, ribavirin, interferons.

73. Antifungal drugs – targets, mechanism of action, spectrum of action, examples: polyene antifungals – amfotericin B, nystatin; azole antifungals – ketoconazole, fluconazole, itraconazole, voriconazole; echinocandins – caspofungin, micafungin; alylamine antifungals – terbinafine.

74. Sterility, sterilization – definition, sterilization processes – physical sterilization (dry heat, autoclave), chemical sterilization.

75. Sequels of microbial contamination/spoilage of pharmaceuticals, prevention of microbial degradation/contamination of pharmaceutical products.

76. Microbiological control in pharmacy – sterility control and testing, division of pharmaceutical products into categories, bacterial endotoxin/pyrogen testing.

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Znalosti vymezené otázkami v rámci dokumentu výstupy učení (studijní materiály).

Znalosti oboru dané okruhy uvedenými v rámci sylabu předmětu.

Okruhy ke zkoušce z předmětu Mikrobiologie

Obecná mikrobiologie

1. Obor mikrobiologie, disciplíny – speciální/aplikované mikrobiologické vědy.

2. Role mikroorganismů v přírodě – ekologická role, role v lékařství.

3. Využití mikroorganismů člověkem – potravinářství, biotechnologie, bioremediace.

4. Mikrobi – metabolismus a vztah ke kyslíku - fotoautotrof, fotoheterotrof, chemoautotrof, chemoheterotrof, striktní aerob, anaerob, fakultativní anaerob, …, (zdroj energie, zdroj uhlíku, příklady).

5. Růstová křivka a faktory ovlivňující růst.

6. Role bakterií v ekosystémech – destruent, saprofyt, parazit, patogen. Vztahy mezi organismy – symbióza, komensalismus, mutualismus, parazitismus.

7. Klasifikace mikroorganismů, klasifikační skupiny – sestupný/vzestupný přehled, binomická nomenklatura.

8. Srovnání prokaryotické a eukaryotické buňky - bakterie, mykobakterie, mykotická agens (stavba buňky, buněčná stěna, cytoplazmatická membrána, genetika, rozmnožování).

9. Archebakterie – jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus.

10. Bakterie - jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus, ekologická role.

11. Eukaryota, eukaryotní mikro/organismy – jejich obecná charakteristika - velikost, stavba buňky, ekologická role.

12. Mykotická agens – stavba buňky (cytoplazmatická membrána, buněčná stěna), metabolismus, růst hub – blastospora, mycelium, hyfa, dimorfismus; role v ekosystému, onemocnění (mycetismus, mykotoxikóza, mykoalergie, mykóza, dermatomykóza, endemické mykózy, oportunní mykózy).

13. Viry – obecná charakteristika, struktura, reprodukce, klasifikace (DNA viry, RNA viry, symetrie kapsidy, obal), bakteriofág – charakterizace, využití pro genové inženýrství, fágová terapie, lyzogenní konverze.

14. Patogeneze virových infekcí – lytický, lyzogenní cyklus, transformace.

15. Priony – obecná charakteristika.

16. Hypotéza spontánní generace, teorie biogeneze.

17. A. van Leeuwenhoek, L. Pasteur, R. Koch, J. Lister, E. Jenner, A. Fleming a jejich přínos pro mikrobiologii.

18. Genetika bakterií – chromozom, plazmid, transpozon, genotyp, fenotyp, DNA polymeráza, operon, mutace.

19. Parasexuální procesy u bakterií – transformace, transdukce, konjugace.

20. Obligátní vs. oportunní patogen/parazit, intracelulární parazit.

21. Přenos infekčních agens – přímá cesta, nepřímá cesta, vektor, antropozoonóza, zoonóza.

22. Infekce (inaparentní, latentní, manifestativní), anatomické lokalizace infekce, fáze infekce.

23. Obrana hostitele před infekcí – mechanické, chemické, imunitní, ekologické bariéry.

24. Patogeneze, faktory virulence - adhesiny, enzymy, toxiny, dimorfismus.

25. Rezistence – primární, sekundární, klinická rezistence, mikrobiologická rezistence, multirezistence, polyrezistence, zkřížená/sdružená rezistence, přenos genů kódujících rezistenci, molekulární mechanismy rezistence - inaktivace, alterace cílové struktury, změna permeability.

26. Určování citlivosti na antimikrobní látky in vitro - diskový difúzní test, E-test, mikrodiluční bujónový test – MIC, MBC.

Klinická mikrobiologie

27. Klinicky významné Gram pozitivní koky - St. aureus, St. epidermidis, … (morfologie, kataláza, plazmakoaguláza, hemolýza, produkce toxinů, enzymů, infekce), MRSA, VRSA.

28. Klinicky významné Gram pozitivní koky – streptokoky, enterokoky, dělení streptokoků do skupin dle hemolýzy, dle antigenní struktury, dle patofyziologie, Streptococcus pyogenes, Str. agalactiae, viridující streptokoky, Str. pneumoniae, E. faecium, E. faecalis, … (onemocnění, produkce toxinů, enzymů, léčba).

29. Klinicky významné Gram negativní koky – meningokok, gonokok (Neisseria meningitidis, N. gonorrhoeae), onemocnění, cesta přenosu, klinický obraz, léčba, prevence, laboratorní diagnostika – oxidáza, kultivace.

30. Klinicky významné Gram negativní bakterie - obligátně patogenní/oportunně patogenní, rody: Salmonella, Shigella, Yersinia (onemocnění, přenos, diagnostika - sérotypizace), střevní fakultativně anaerobní bakterie – Escherichia (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC), Klebsiella, Citrobacter sp., Enterobacter sp. (onemocnění, diagnostika), aerobní Gram negativní bakterie – Pseudomonas sp., Vibrio sp. (onemocnění, diagnostika).

31. Klinicky významné spirochety: Treponema pallidum, Borrelia burgdorferi (přenos, onemocnění, léčba).

32. Mykobakterie – tuberkulóza (původce), mykobakteriózy (původci) – onemocnění, diagnostika, léčba.

33. Pohlavně přenosná onemocnění – syfilis, kapavka, ulcus molle, lymphogranuloma venereum, AIDS, trichomoniáza, vulvovaginální kandidóza, herpes genitalis, condylomata accuminata, pediculosis pubis, chlamydiové infekce (původce, stádia onemocnění, příznaky, terapie).

34. Klinicky významné viry - čeleď: Poxviridae, virus varioly, virus vakcinie (přenos, formy onemocnění, prevence).

35. Klinicky významné viry - čeleď: Herpesviridae, HSV1, HSV2, herpes virus varicellae-zosteris, cytomegalovirus, virus Epstein-Barrové (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

36. Klinicky významné viry - viry chřipky (přenos, antigenní shift, antigenní drift, onemocnění, léčba, prevence).

37. Virus příušnic, zarděnek, spalniček (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

38. Retroviry – HIV (přenos, tropismus viru, stadia onemocnění, léčba, prevence).

39. Viry hepatitid -HAV, HBV, HCV, HDV (přenos, onemocnění, léčba, prevence).

40. Superficiální mykózy - infekce (pityriasis versicolor, dermatomykózy – tinea, onychomykóza, bílá/černá piedra).

41. Subkutánní mykózy - chromoblastomykóza, subkutánní zygomykóza, mycetom.

42. Dimorfní houby – výskyt, onemocnění, původci.

43. Kvasinkové infekce – Candida albicans, dimorfismus, patogeneze, rizikové faktory, onemocnění (kožní, mukokutánní, systémové), Cryptococcus neoformans – faktor virulence, onemocnění, rizikové faktory.

44. Vláknité houby – Aspergillus spp., Mucorales - onemocnění.

45. Prvoci jako původci onemocnění – formy (trofozoit, cysta), améby – Entamoeba histolytica, Entamoeba gingivalis, přenos, onemocnění, terapie; bičíkovci – Giardia lamblia (intestinalis), Trichomonas vaginalis, Trypanosoma gamblinese, Leishmania sp. – výskyt, přenos, onemocnění; výtrusovci -Toxoplasma gondii – přenos, onemocnění.

46. Krevní prvoci – Plasmodium, výskyt onemocnění, přenos, malarický záchvat (maligní, benigní terciány), laboratorní diagnostika (tlustá kapka, tenký roztěr), prevence onemocnění, léčba onemocnění.

47. Parazitické hlístice – stavba těla, způsoby přenosu, zástupci: Trichinella spiralis, Trichuris trichura, Strongyloides sp., měchovci, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, filárie (výskyt, přenos, onemocnění, léčba).

48. Parazitičtí ploštěnci – stavba těla, zástupci: Taenia saginata, Taenia solium, Echinococcus granulosus (výskyt, přenos, onemocnění, léčba), motolice – Schistosoma haematobium (výskyt, přenos, onemocnění, léčba).

49. Typy biologického materiálu (přirozeně sterilní, nesterilní).

50. Příprava preparátů pro světelnou mikroskopii (nativní, barvený – Gram, Ziehl-Neelsen, Burry, Giemsa).

51. Kultivace mikroorganismů - podmínky pro kultivaci, závislost na teplotě, závislost na kyslíku, typy kultivačních médií (diagnostická půda, selektivní půda, selektivně diagnostická půda, půda pro antibiotické zkoušky – krevní, Endův, Loewenstein-Jensen agar, Mueller-Hinton, McConkey, Sabouraudův agar).

52. Mikrobiální flóra – její role, zastoupení.

Farmaceutická mikrobiologie

53. Antimikrobní látky, pojmy: dezinficiencia, antiseptika, konzervancia, antibiotika.

54. Dezinficiencia/dezinfekce- definice pojmu, kategorizace dezinfekce (fyzikální, chemická), účel, vlastnosti, mechanismus účinku, použití, volba dezinficiens, příklady.

55. Antiseptika/antisepse – definice pojmu, vlastnosti, mechanismus účinku, příklady.

56. Dekontaminace, sanace, asepse – definice pojmů.

57. Konzervancia/konzervace – účel, efekt, vlastnosti, použití.

58. Faktory ovlivňující efekt antimikrobních látek.

59. Antiinfektiva – účel využití, vlastnosti (mikrobistatický/mikrobicidní efekt), klasifikace – antivirotika, antibiotika, antimykotika, antiparazitika, anthelmintika, …).

60. Antibiotika, chemoterapeutika – definice pojmu, použití, klasifikace (cidní/statická, úzko/širokospektrá, dle buněčného cíle, dle chemické struktury).

61. Beta-laktamová antibiotika - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, mechanismy rezistence – poriny, modifikace PBP, beta-laktamasa. Skupiny beta-laktamových antibiotik – penamy (příklady, účinek), cefemy (příklady, účinek), karbapenemy/monobaktamy (příklady, účinek).

62. Inhibitory beta-laktamas – účinek, příklady.

63. Aminoglykosidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

64. Tetracykliny - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

65. Chloramfenikol – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky.

66. Makrolidy, linkosamidy- cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

67. Glykopeptidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky.

68. Chinolony - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

69. Ansamyciny/rifamyciny - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, rezistence.

70. Nitrofurany - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

71. Sulfonamidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady.

72. Antituberkulotika – cíl působení, mechanismus účinku, příklady: pyrazinamid, isoniazid, rifampicin, ethambutol, streptomycin.

73. Antivirotika – dělení dle mechanismu účinku, příklady: acyklovir, ganciklovir, amantadin, zidovudin, stavudin, sanquinavir, tenofovir, adefovir, ribavirin, interferony.

74. Antimykotika – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady: polyenová – amfotericin B, nystatin; azolová – ketokonazol, flukonazol, itrakonazol, vorikonazol; echinokandiny – kaspofungin, mikafungin; alylaminy – terbinafin.

75. Sterilita, sterilizace - definice pojmu, sterilizační přístupy – fyzikální (suché, vlhké teplo, filtrace), chemická cesta, záření, test sterility.

76. Hlavní zdroje kontaminace surovin a farmaceutických produktů. Kritéria mikrobiologické nezávadnosti léků, jejich testování. Mikrobiální degradace farmaceutických přípravků.

77. Sterilní farmaceutické produkty. Kontrola sterility a kvality farmaceutických výrobků.

78. Aseptická příprava léků, boxy s laminárním prouděním, hygienická opatření a kontrola prostředí (správná laboratorní praxe).

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Syllabus -

Introduction to microbiology, milestones in microbiology, relationships between human and microbes

Microbial physiology, morphology and metabolism of prokaryotes

Basic review of antimicrobial compounds

Antibiotics

Resistance to antibiotics

Microbial genetics

Microbial physiology, morphology and metabolism of prokaryotes

Introduction to pharmaceutical microbiology

Medically important grampositive bacteria

Medically important gramnegative bacteria

Medically important acid-fast bacteria

Parazitology - parasitic protozoa and hemlmints

Sexually transmitted diseases

Introduction to mycology and virology

Introduction to laboratory practice in microbiology laboratory

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Learning resources -

Study Materials | Intranet FAF (cuni.cz)

Department of Biological and Medical Sciences | Intranet FAF (cuni.cz)

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.09.2025)

Learning outcomes -

Learning Outcomes of the subject Microbiology

Upon successful completion of the course, the student will be able to:

- Explain the fundamental concepts and key historical milestones of microbiology, and describe the characteristics, cellular structure, and physiology of microorganisms.

- Characterize the basic structure of bacterial cells and outline the principles of bacterial genetics as well as the nature of prion infections.

- Differentiate between disinfectants, antiseptics, preservatives, and antibiotics, explain their properties and applications, and provide relevant examples.

- Classify antibiotics according to their chemical structure, mechanism and target

of action, and spectrum of activity.

- Define the term multiresistance, cross-resistance, and co-resistance, distinguish between primary and secondary resistance, and relate specific resistance mechanisms to the corresponding antibiotic classes.

- Describe the scope of pharmaceutical microbiology and the biotechnological applications of microorganisms, including sterilization processes and methods for assessing the microbial safety of environments and pharmaceutical products.

- Identify major representatives of Gram-positive and Gram-negative bacteria (cocci and rods), characterize their properties and associated diseases, and outline the basics of their diagnosis and treatment.

- Characterize mycobacteria, including the course, diagnosis, and treatment of related diseases, and demonstrate essential knowledge of other acid-fast bacteria (e.g., Nocardia, Corynebacterium) and chlamydiae.

- Demonstrate essential knowledge in mycology, virology, and parasitology, including clinically important pathogens and fundamental diagnostic and therapeutic approaches.

- Apply basic procedures used in clinical microbiology laboratories for the diagnosis of infectious disease agents.

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.12.2025)

Výsledky učení předmětu Mikrobiologie

Po absolvování předmětu bude student schopen:

- Vysvětlit základní pojmy a historické milníky z oboru mikrobiologie, popsat charakteristiku mikroorganismů, jejich stavbu a fyziologii.

- Charakterizovat základní strukturu bakteriálních buněk a popsat principy bakteriální genetiky a prionové infekce.

- Vysvětlit rozdíly mezi dezinfekčními prostředky, antiseptiky, konzervanty a antibiotiky, popsat jejich vlastnosti, použití a uvést příklady.

- Zařadit antibiotika dle struktury, cíle působení a spektra účinku.

- Vysvětlit pojmy multirezistence, zkřížená a sdružená rezistence, rozlišit pojmy primární a sekundární rezistence, a přiřadit mechanismy rezistence k příslušným skupinám antibiotik.

- Popsat problematiku farmaceutické mikrobiologie a biotechnologického využití mikroorganismů, uvést sterilizační procesy a způsob hodnocení mikrobiální nezávadnosti prostředí a přípravků.

- Identifikovat hlavní zástupce G+ a G– bakterií (koky i tyčky), charakterizovat jejich vlastnosti, onemocnění, které vyvolávají, uvést základní diagnostiku a způsob léčby.

- Charakterizovat mykobakterie (průběh onemocnění, diagnóza a léčba) a uvést základní znalosti o dalších acidorezistentních bakteriích (Nocardia, Corynebacterium) a chlamydiích.

- Prokázat základní znalosti z mykologie, virologie a parazitologie, včetně uvedení nejdůležitějších patogenů, základů diagnostiky a léčby infekcí, které vyvolávají.

- Orientovat se v základních postupech laboratorní diagnostiky původců infekčních onemocnění.

Last update: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (02.12.2025)