Prognostická role imunitního infiltrátu a jeho vliv na imunoterapeutickou léčbu metastatického karcinomu ovária

• Název práce v češtině: Prognostická role imunitního infiltrátu a jeho vliv na imunoterapeutickou léčbu metastatického karcinomu ovária
• Název v anglickém jazyce: 111/5000 Prognostic role of immune infiltrate and its influence on immunotherapeutic treatment of metastatic ovarian cancer
• Akademický rok vypsání: 2020/2021
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: prof. PharmDr. Jitka Palich Fučíková, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Vědecká orientace Ústavu imunologie je dlouhodobě věnována imunologii nádorových onemocnění a imunogenní buněčné smrti nádorových buněk (Fucikova et al, Blood, 2016; Fucikova et al, Cancer Res 2016; Fucikova et al, CCR, 2019). Společným jmenovatelem projektů je porozumění mechanismům protinádorové imunitní odpovědi a jejich využití pro přípravu protokolů specifické protinádorové imunoterapie (Fucikova et al, Front Immunol, 2019; Fucikova, CII, 2018).
Nádorové mikroprostředí představuje komplexní heterogenní strukturu, která hraje esenciální roli v podpoře růstu, proliferaci a schopnosti maligních buněk tvořit metastatická ložiska. Nádorové mikroprostředí je tvořeno maligními, stromálními, epiteliálními a endoteliálními buňkami a složkami imunity. Z výsledků preklinického testování na našem pracovišti vyplývá, že složení a funkční orientace imunitního systému v nádorovém mikroprostředí pacientek s primárním karcinomem ovaria (HGSC) má zásadní vliv na výslednou prognózu tohoto závažného onemocnění (Truxova et al, JITC, 2018; Fucikova et al, CCR, 2019; Kasikova et al, JITC, 20219). Nicméně, složení a funkční orientace nádorového mikroprostředí metastatické tkáně a jeho případný vliv na prognózu pacientek s high-grade serózním karcinomem ovária (HGSC) není dosud jednoznačně objasněn.

Ve spolupráci s Ústavem patologie a molekulární medicíny ve FN Motol a Fingerlandovým patologickým ústavem v HK máme přístup k vzorkům primární a metastatické nádorové tkáně pacientek s HGSC. V laboratoři jsou zavedeny protokoly pro práci s primární nádorovou tkání a následné metodické postupy: imunohistochemická a imunofluorescenční analýza FFPE vzorků nádorových tkání, průtoková cytometrie, western blot, bioinformatická analýza celogenomového sekvenování, RT-PCR (Truxova et al, JITC, 2018; Fucikova et al, CCR, 2019; Kasikova et al, JITC, 20219). Dalším významným aspektem práce s klinickými vzorky je dostupnost dat o klinickém průběhu onemocnění u zařazených pacientů díky dlouhodobé spolupráci s Gynekologicko-porodnickou klinikou ve FN Motol, FN Hradec Králové a FN Královské Vinohrady.

Cílem postgraduálního studia bude:
1) Charakterizovat přítomnost imunitního infiltrátu v nádorovém mikroprostředí primární a metastatické tkáně karcinomu ovaria na genové i proteinové úrovni u retrospektivní a prospektivní kohorty pacientek pomocí celogenomového sekvenovaní, metody RT-PCR, imunohistochemie, imunofluorescence a průtokové cytometrie a korelovat získaná data s dříve publikovanými výsledky a klinickým průběhem onemocnění léčených pacientek.
2) Pomocí průtokové cytometrie charakterizovat expresi a produkci markerů imunogenních molekul a blíže specifikovat funkční orientaci subpopulací imunitního systému v nádorovém mikroprostředí u pacientek s HGSC léčených/neléčených chemoterapií.
3) Charakterizovat vliv aplikované neo-adjuvantní chemoterapie na mutační nálož nádorové tkáně (TMB, z angl. Tumor mutational burden) a současně charakterizovat vliv TMB na výslednou aktivaci protinádorové imunitní reakce.