Návrh a dizajn inovatívnych metylačných microarrazs pre onkologické ochorenia
| Název práce v jazyce práce (slovenština): | Návrh a dizajn inovatívnych metylačných microarrazs pre onkologické ochorenia |
|---|---|
| Název práce v češtině: | Návrh a design inovativních metylačních microarrays pro onkologická onemocnění |
| Název v anglickém jazyce: | Proposal and design of innovative methylation microarrays for oncology diseases |
| Klíčová slova: | metylačních microarrays, epigenetika, metylace DNA, HTS |
| Klíčová slova anglicky: | methylation microarrays, epigenetics, DNA methylation, HTS |
| Akademický rok vypsání: | 2018/2019 |
| Typ práce: | disertační práce |
| Jazyk práce: | slovenština |
| Ústav: | BIOCEV, 1. LF UK (11-00131) |
| Vedoucí / školitel: | Ing. Ivan Mikula, Ph.D. |
| Řešitel: | skrytý - zadáno vedoucím/školitelem |
| Datum přihlášení: | 09.11.2018 |
| Datum zadání: | 09.11.2018 |
| Konzultanti: | doc. Ing. Milan Jakubek, Ph.D. |
| Zásady pro vypracování |
| Vypracování panelu biomarkrů. Vypracování metodiky pro přípravu microarrays. Vypracování metodiky pro spracování microarrays. Vypracování metodiky pro vyhodnocování microarrays. |
| Předběžná náplň práce |
| V rámci řešení doktorandského projektu student navrhne panel biomarkrů, k onkologické diagnostice, které následně použije k sestavení microarray. K přípravě bude použita technologie spotování robotickým zařízením NanoPrint. Pro vyhodnocování je k dispozici fluorescenční skener GenePix 4000b s příslušním softwarem. Student má v plánu se zaměřit na epigenetickou diagnostiku metylované DNA u onkologických onemocnění. |
| Předběžná náplň práce v anglickém jazyce |
| Student will design a panel of biomarkers for oncological deseases. Microarrays are going to be manufactured, based on design of panel. Manufacturing is based on NanoPrint spoting technology. Obtaining of result is made by GenePix 4000b fluorescent scaner with software. Student has plan to focus on epigenetics diagnostics of methylated DNA for oncological use. |