Výzkum vzájemné interakce membránových receptorů NKR-P1D a Clrb

• Název práce v češtině: Výzkum vzájemné interakce membránových receptorů NKR-P1D a Clrb
• Název v anglickém jazyce: Studies on interactions between NKR-P1D and Clrb membrane receptors
• Klíčová slova: NK buňky, membránové proteiny, NKR-P1D, Clrb, nekovalentní interakce, chemické zesítění proteinů, hmotnostní spektrometrie
• Klíčová slova anglicky: NK cells, membrane proteins, NKR-P1D, Clrb, non-covalent interactions, chemical cross-linking, mass spectrometry
• Akademický rok vypsání: 2009/2010
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 02.10.2009
• Datum zadání: 02.10.2009
• Datum odevzdání elektronické podoby: 05.05.2011
• Datum proběhlé obhajoby: 02.06.2011
• Oponenti: Mgr. Tomáš Brdička, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Příprava konstruktů kódujících extracelulární čast NK receptoru (NKR-P1D a Clrb). Heterologní exprese zmíněných receptorů v E. coli a optimalizace jejich in vitro složení. Ověření správnosti sbalení receptorů pomocí gelové filtrace, analytické ultracentrifugace, hmotnostní spektrometrie a NMR. Finální studium jejich vzájemné interakce pomocí gelové filtrace, analytické ultracentrifugace, povrchové plasmonové resonace a hmotnostní spektrometrie v kombinaci s chemickým zesítěním.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Preparation of constructs coding extracellular part of NK receptors (NKR-P1D and Clrb). Heterologous expression of these receptors in E. coli and optimalization of their refolding. Confirmation of the folding correctness using size-exclusion chromatography, analytical ultracentrifugation, mass spectrometry and NMR. Finally, studies on interactions between NKR-P1D and Clrb membrane receptors exploiting size-exclusion chromatography, analytical ultracentrifugation, surface plasmon resonace and mass spectrometry in combination with chemical cross-linking.