Kvantově mechanický popis základních procesů fotosyntetického reakčního centra
| Název práce v češtině: | Kvantově mechanický popis základních procesů fotosyntetického reakčního centra |
|---|---|
| Název v anglickém jazyce: | Quantum mechanical characterization of basic processes in the reaction center of the photosynthetic system |
| Akademický rok vypsání: | 2023/2024 |
| Typ práce: | bakalářská práce |
| Jazyk práce: | |
| Ústav: | Katedra chemické fyziky a optiky (32-KCHFO) |
| Vedoucí / školitel: | prof. RNDr. Ing. Jaroslav Burda, DrSc. |
| Řešitel: |
| Zásady pro vypracování |
| Zvolené komplexy budou nejprve podrobeny geometrické optimalizaci a pro finální struktury budou provedeny analýzy vlnových funkcí resp. elektronové hustoty pomocí různých výpočetních kvantově-mechanických programů.
Nejdůležitější úkol pak bude spočívat ve výpočtech elektronových přechodů studovaných systémů, porovnání s experimentálními daty a analýzy chyb. |
| Seznam odborné literatury |
| 1. R. Polák, R. Zahradník: Základy kvantové chemie, SNTL Praha, 1993
2. P. Čárský, M. Urban: Ab initio výpočty v chemii, SNTL Praha, 1988 3. J. Fišer: Úvod do kvantové chemie, Academia Praha, 1983 4. N. Ostlund, A. Szabo: Modern Quantum Chemistry, McGraw-Hill Inc. New York, 1989 5. W. Yang, J. A. Parr: Density Functional Theory, Wiley, NY, 1998 6. R.E. Blankenship: Molekulární mechanismy fotosyntézy, Blackwell Science, 2002 |
| Předběžná náplň práce |
| Práce bude založena na kvantově-chemických výpočtech modelových systémů agregátů fotosyntetických reakčních center a jejich biofyzikálních a biochemických interakcí. Pro tyto komplexy budou vypočteny základní elektronové vlastnosti. U navržených reakčních mechanismů budou stanoveny důležitá termodynamická data (entalpie a velné Gibbsovy energie) a odhadnuty kinetické parametry procesů, které hrají klíčovou úlohu v procesu fotosyntézy.
|