Diplomová práce bude zaměřena na charakterizaci efektu hemu a inhibice jeho metabolismu na reversi latence HIV-1 na tkáňových kulturách. Bude využívat neinfekční model latentního HIV-1, klon A2 odvozený od T-lymfocytární linie Jurkat a obsahující reporterový gen EGFP pod kontrolou HIV-1 LTR. Budou sledovány efekty inhibitorů přeměny hemu na reversi latence HIV-1 a expresi endogenních genů, a to pomocí průtokové cytometrie, RT-qPCR a dalších vhodných přístupů.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The diploma work will be focused on characterization of effects of heme and inhibitors of its metabolism on HIV-1 latency reversal in tissue cultures. Non-infectious model of latent HIV-1, A2 clone derived from a T-cell line Jurkat, harboring a reporter gene EGFP under control of HIV-1 LTR, will be used. The effects of inhibitors of heme metabolism on HIV-1 latency reversal and on endogenous gene expression will be characterized using flow cytometry, RT-qPCR and other appropriate approaches.