Bakterie tvoří dominantní složku střevní mikrobioty živočichů, která výrazně ovlivňuje fyziologii a kondici hostitele. V praxi lze její složení ovlivnit podáváním probiotik, která jsou využívána nejen v lidské medicíně, ale také v zemědělství a veterinární praxi. Disertační projekt bude zaměřen na výzkum střevní mikrobioty a probiotik využívaných k léčbě papoušků. Papoušci jsou nejběžnějšími ptáky chovanými v domácnostech lidí a nezřídka bývají pacienty veterinárních lékařů. Střevní mikrobiota papoušků doposud nebyla dobře popsána. Papoušci mají ve srovnání se savci nebo s kurem domácím výrazně jinak strukturovaný trávicí trakt, což by mohlo složení mikrobioty ovlivňovat. Přesto komerční probiotika určená papouškům obvykle obsahují stejné druhy bakterií jako probiotika pro fylogeneticky i anatomicky vzdálená hospodářská zvířata a člověka. V první části disertačního projektu bude studována stabilita a vnitrodruhová variabilita složení střevní mikrobioty. K tomu budou využity vzorky odebrané jedincům andulky vlnkované (Melopsittacus undulatus) z polopřirozené populace v Zoo Vyškov. Složení střevní mikrobioty bude analyzováno ze vzorků trusu pomocí metabarcodingu a qPCR. V druhé části disertačního projektu budou analyzovány vzorky a data získaná v experimentu zaměřeném na dlouhodobé vlivy prodělání mírného chronického systemického zánětu na složení střevní mikrobioty, chování a kondici u andulky vlnkované. Ve třetí části projektu bude studován efekt složení mikrobioty na kondici hostitele (zdravotní stav a tělesnou hmotnost) a chování (videozáznamy z experimentu). V poslední části projektu bude proveden experiment s aplikací probiotik, která budou vybrána na základě výsledků předchozích částí.
- zadáno vedoucím/školitelem