Lokalizace podjednotky exocystu EXO70E2 a forminu FH5 v kořenové čepičce Arabidopsis a jejich vztah k autofagii.

• Název práce v češtině: Lokalizace podjednotky exocystu EXO70E2 a forminu FH5 v kořenové čepičce Arabidopsis a jejich vztah k autofagii.
• Název v anglickém jazyce: Localization of exocyst complex subunit EXO70E2 and formin FH5 in Arabidopsis root cap and their relation to autophagy.
• Klíčová slova: kořenová čepička; autofagie; komplex exocyst; EXO70; fomin
• Klíčová slova anglicky: root cap; autophagy; exocyst complex; EXO70; formin
• Akademický rok vypsání: 2021/2022
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra experimentální biologie rostlin (31-130)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Viktor Žárský, CSc.
• Řešitel: skrytý - zadáno a potvrzeno stud. odd.
• Datum přihlášení: 05.10.2022
• Datum zadání: 05.10.2022
• Datum potvrzení stud. oddělením: 01.02.2023
• Konzultanti: Mgr. Eva Kollárová

Seznam odborné literatury

Acheampong AK et al. (2020). Proc Natl Acad Sci USA 17:27034-27043. doi: 10.1073/pnas.2013161117
Bodemann BO et al. (2011 Cell 144:253-67. doi: 10.1016/j.cell.2010.12.018
Cvrčková F et al. (2012) Front Plant Sci 3:159.doi: 10.3389/fpls.2012.00159
Heider MR et al. (2016) Nature Struct Mol Biol 23:59-66 doi: 10.1038/nsmb.3146
Hong D et al. (2016) New Phytol 209(2):624-35. doi: 10.1111/nph.13625
Hruz T et al. (2008) Adv Bioinformatics 2008:420747. doi: 10.1155/2008/420747
Ji C et al. (2020) Plant Physiol.184:777-791. doi: 10.1104/pp.20.00470
Jung H et al. (2020) J Exp Bot 71:73–89. doi: 10.1093/jxb/erz404
Kubátová Z et al. (2019) Int J Mol Sci 20: 3803.doi:10.3390/ijms20153803
Kulich I et al. (2013) Traffic 14(11):1155-65.doi: 10.1111/tra.12101
Kulich I et al. (2015) Plant Physio 168(1):120-31.doi: 10.1104/pp.15.00112
Li F, Vierstra RD (2012) Trends Plant Sci 17:526-37. doi: 10.1016/j.tplants.2012.05.006
Lin Y et al. (2015) Plant Physiol. 169:1917-32. doi: 10.1104/pp.15.00953
Lin Y et al. (2021) Mol Plant 29:S1674-2052(21)00096-4. doi: 10.1016/j.molp.2021.03.021
Sabol P et al. (2017) J Exp Bot 683253-3265.doi: 10.1093/jxb/erx007
Sekereš J et al. (2017) Plant Physiol 173:1659–1675.doi: 10.1104/pp.16.01709
Stegmann M et al. (2012) Plant Cell 24:4703-16.doi: 10.1105/tpc.112.104463
Teh OK et al. (2019) BiorXiv, doi: https://doi.org/10.1101/266171
Žárský V et al. (2009) New Phytol 183:255-72.doi: 10.1111/j.1469-8137.2009.02880.x.
Žárský V et al. (2013) Curr Opin Plant Biol 16: 726-733.doi:10.1016/j.pbi.2013.10.013
Žárský V et al. (2020) J Exp Bot 71:49-62. doi: 10.1093/jxb/erz423
Zhang X et al. (2015) Current Biology 25(16):2189-95. doi: 10.1016/j.cub.2015.06.075
Zhao Y et al. (2013) Developmental Cell 26(3):266-78. doi: 10.1016/j.devcel.2013.07.007
Zhou F et al. (2019) J Cell Biol 218:1908–1927. doi: 10.1083/jcb.201811173

Předběžná náplň práce

Kořenová čepička rostlin se vyznačuje řízenými procesy odlučování a degradace buněk, které m.j. chrání kořen prorůstající půdou, čímž významně přispívá k regulaci růstu kořene.Také funkce buněk kořenové čepičky je mezi mnoha jinými regulátory závislá také na souhře cytoskeletu s transportem endomembrán. Cílem této práce bude studovat tento aspek růstu a vývoje kořene analýzou dynamiku lokalizace podjednotky exocystu EXO70E2 a forminu FH5 v kořenové čepičce Arabidopsis a jejich srovnání s nadzemními pletivy. U obou bílkovin bude testován jejich možný vztah k autofagii.

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Plant root cap exhibits regulated processes of cell separation and degradation to protect among others also root invading soil, significantly contirbuting to the root growth regulation. Functioning of also root cap cells is dependent among many other regulators also on the interplay of cytoskeleton and endomembrane trafficking. The aim of this project is to address this aspect of root growth development by studying localization dynamics of exocyst complex subunit EXO70E2 and formin FH5 in Arabidopsis root cap as compared to the above ground shoot tissues. In both proteins their possible relation to autophagy will be tested.