Homology široké rodiny Alba byly nalezeny u všech žijících organismů. Jsou schopné vazby RNA (Archae a Eucarya) i DNA (Crenarchae). V důsledku genomových duplikací se u rostlin nachází v zastoupení většího množství členů, u huseníčku šest proteinů sekvenčně rozdělených do podrodin Rpp20 a Rpp25. Na základě možných protein-proteinových interakcí, popsaných dříve u jednobuněčných (S. solfataricus) i mnohobuněčných organismů (Leishmania, Trypanosoma), budou testovány heterodimerní intermolekulové vazby mezi proteiny ALBA metodou BiFC v protoplastech huseníčku rolního. Dále budou charakterizovány kolokalizací s vybranými markery: DCP5 (p-bodies) a po teplotním šoku s RBP47B (stresové granule) a PABP3 (translatovaná mRNA). Pro přípravu všech experimentů bude použit klonovací systém GoldenBraid 3.0 tj. domestikace a klonování DCP5, RBP47B a PABP3 z genomové DNA a tvorbu destinačních vektorů se všemi heterodimerními kombinacemi proteinů ALBA původně z cDNA pylu. Výsledná práce ve formě obrazové dokumentace bude snímána na konfokálním mikroskopu Zeiss LSM 880 s detektorem Airyscan. Diplomová práce zahrnuje klonování GoldenBraid 3.0, práci s protoplasty a mikroskopy (fluorescenční a konfokální mikroskopie).
- zadáno vedoucím/školitelem