Příčiny neúplné penetrance na molekulární úrovni – na příkladu dědičných chorob u člověka

• Název práce v češtině: Příčiny neúplné penetrance na molekulární úrovni – na příkladu dědičných chorob u člověka
• Název v anglickém jazyce: The molecular basis of incomplete penetrance in human hereditary disorders
• Klíčová slova: dědičné choroby, neúplná penetrance, molekulární příčina
• Akademický rok vypsání: 2019/2020
• Typ práce: bakalářská práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Michaela Schierová, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 09.10.2019
• Datum zadání: 14.01.2020
• Datum odevzdání elektronické podoby: 03.06.2020
• Datum proběhlé obhajoby: 08.07.2020
• Oponenti: Mgr. Eliška Linhartová

Zásady pro vypracování

Genetika nebo Základy genetiky
Molekulární biologie
Genetika člověka

Seznam odborné literatury

Beckmann JS,Estivill X,Antonarakis SE.(2007): Copy number variants and genetic traits: closer to the resolution of phenotypic to genotypic variability.Nat Rev Genet.8(8):639-46.
Castel SE, Cervera A, Mohammadi P, Aguet F, Reverter F, Wolman A³, Guigo R, Iossifov I, Vasileva A, Lappalainen T (2018): Modified penetrance of coding variants by cis-regulatory variation contributes to disease risk.Nat Genet.; 50(9): 1327–1334.
CooperDN, KrawczakM., PolychronakosC.,Tyler-SmithC.,Kehrer-SawatzkiH. (2013):Where genotype is not predictive of phenotype: towards an understanding of the molecular basis of reduced penetrance in human inherited disease.Hum Genet 132:1077–1130
Lacaze,P. Winship I., McNeil J. (2017): Penetrance and the Healthy Elderly.Genet Test Mol Biomarkers. 21(11): 637–640.
Natarajan P,Gold NB,Bick AG,McLaughlin H,Kraft P,Rehm HL,Peloso GM,Wilson JG,Correa A,Seidman JG,Seidman CE,Kathiresan S,Green RC(2016): Aggregate penetrance of genomic variants for actionable disorders in European and African Americans.Sci Transl Med.2016 Nov 9;8(364):364ra151.
Wright CF,West B,Tuke M,Jones SE,Patel K,Laver TW,Beaumont RN,Tyrrell J,Wood AR,Frayling TM,Hattersley AT,Weedon MN(2019):Assessing the Pathogenicity, Penetrance, and Expressivity of Putative Disease-Causing Variants in a Population Setting.Am J Hum Genet.104(2):275-286

Předběžná náplň práce

Při studiu dědičných onemocnění analýzou rodokmenů kliničtí genetikové zjistili, že ne u všech potenciálně patogenních genotypů lze pozorovat typické klinické příznaky. Neúplná penetrance, jak byl jev pojmenován, se vyskytuje u dominantně i recesívně podmíněných chorob, ale i u nemocí s polygenním typem dědičnosti. Donedávna byla míra penetrance z metodických důvodů nadhodnocena. Sekvenováním genomu u velkého počtu klinicky zdravých jedinců bylo odhaleno, že se patogenní genotyp manifestuje u výrazně nižšího počtu jedinců, než se předpokládalo na základě rodokmenové analýzy.
Cílem bakalářské práce je na základě aktuálních přehledových článků vybrat choroby, u kterých je studována příčina neúplné penetrance, a s pomocí původních článků popsat metodické přístupy, kterými byla určena míra penetrance a analyzována příčina její redukce.