Trávicí trakt obratlovců je osídlen bohatou komunitou komenzálních a mutualistických bakterií, které mají zásadní vliv na fenotyp svého hostitele, včetně širokého spektra fyziologických a imunitních znaků. Z toho důvodu je hostitel vybaven celou řadou mechanismů, které umožňují kontrolu bakteriálních společenstev obývajících jeho trávicí trakt. Současně je střevní mikrobiota regulována společenstvem virů infikujících bakterie, bakteriofágů. Poměrně překvapivě řada recentních studií ukazuje, že společenstvo bakteriofágů je, stejně jako střevní mikrobiota, do značné míry ovlivňované fyziologií a imunitním systémem hostitele a ne jenom abundancemi své potenciální kořisti. Na tento systém nelze tudíž aplikovat jednoduché populační modely predátor-kořist ale je nutné vzít do úvahy i komplexní interakce s hostitelem. Cílem této práce bude vypracovat přehled o současných vědomostech týkajících se (1) interakcí mezi hostitelem a společenstvem bakterifágů, (2) toho jak tyto interakce přímo ovlivňují složení střevní mikrobioty a (2) nepřímo pak fyziologii hostitele. Preferujeme studenty s hlubším zájmem o toto téma, kteří by byly ochotni se jím zabývat i v rámci své diplomové práce.