Utilization of protein radical foootprinting for stuctural biology

• Název práce v češtině: Využití radikálového značení bílkovin pro strukturní biologii
• Název v anglickém jazyce: Utilization of protein radical foootprinting for stuctural biology
• Klíčová slova: rychlá fotochemická oxidace proteinu, protein-DNA komplexy, FOXO4, transkripční faktory, kapilární průtokový reaktor, excimerový laser, bottom-up přistup, top down přistup
• Klíčová slova anglicky: Fast photochemical oxidation of proteins, protein-DNA complexes, FOXO4, transcription factor, quench flow system, protein footprinting, mass spectrometry, bottom-up, top-down
• Akademický rok vypsání: 2018/2019
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: angličtina
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: RNDr. Petr Novák, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 18.10.2018
• Datum zadání: 27.12.2018
• Datum odevzdání elektronické podoby: 15.06.2020
• Datum proběhlé obhajoby: 15.07.2020
• Oponenti: Ing. Petra Junková, Ph.D.
• Konzultanti: Mgr. Zdeněk Kukačka, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Rekombinatní příprava bílkovin, sds elektroforesa, gelová filtrace, disociace peroxidu vodíku excimerovým laserem, povrchové značení bílkovin v průtokovém reaktoru, hmotnostně-spektrometrická analýza modifikovaných bílkovin, bioinformatické vyhodnocení dat

Předběžná náplň práce v anglickém jazyce

Production of recombinant proteins, SDS electrophoresis, gel filtration, disociation of hydrogen peroxide by eximer laser, protein surface labeling in microluidic reactor, mass spectrometric analysis of modified proteins, bioinformatic interpretation of data