Práce je zaměřena na mechanismy diferenciace exodermis v kořenech rostlin a charakterizaci rozdílů/podobností mezi endodermis a exodermis v procesu jejich vývoje. Jedním z cílů bude analýza zapojení genů rodiny CASP ve vývoji exodermální vrstvy. Proteiny AtCASP se u Arabidopsis účastní vzniku Casparyho proužku v endodermis a jsou nezbytné pro ustavení membránové domény, nad níž dochází k lokalizované depozici ligninu do buněčné stěny. V rámci práce budou analyzovány orthology CASP genů u rostlin, které tvoří exodermální vrstvu (především kukuřice a rýže). Ty byly doposud pouze částečně predikovány na základě sekvenční podobnosti, jejich zapojení ve vývoji exodermální vrstvy však dosud nebylo popsáno. Dále bude sledována reakce exodermis na podmínky prostředí - stresové faktory, ale i dostupnost živin v okolí kořene. V této souvislosti bude také analyzována regulační role fytohormonů v reakci exodermální vrstvy na dostupnost živin v prostředí.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
The work follows mechanisms of exodermis differentiation in plant roots. It will characterise differences/similarities between endodermis and exodermis in the process of their development. The analysis of the role of CASP genes in the development of exodermis will be one of the aims. AtCASP proteins are involved in endodermal Casparian strip formation in Arabidopsis. They are essential for establishment of membrane domain that determines the localization of cell wall lignification. The orthologs of CASP genes in plants forming exodermal layer (mainly maize and rice). These orthologs were only partially predicted based on sequence similarities but their involvement in exodermal differentiation was not experimentally proved. The response of exodermis to stress factors and nutrient availability in the rhizosphere will be followed. In this context, the regulatory role of phytohormones in the response of the exodermal layer to the availability of nutrients in the environment will also be analyzed.
- zadáno vedoucím/školitelem