Témata prací (Výběr práce)Témata prací (Výběr práce)(verze: 368)
Detail práce
   Přihlásit přes CAS
Využití metod next-generation sekvenování pro rekonstrukci fylogeneze polyploidních rostlin
Název práce v češtině: Využití metod next-generation sekvenování pro rekonstrukci fylogeneze polyploidních rostlin
Název v anglickém jazyce: Application of next-generation sequencing for phylogenetic reconstruction of polyploid plants
Klíčová slova: 454 pyrosekvenování, Illumina, PacBio, RAD-Seq, Hyb-Seq, RNA-Seq, polyploidie, hybridizace
Klíčová slova anglicky: 454 pyrosequencing, Illumina, PacBio, RAD-Seq, Hyb-Seq, RNA-Seq, polyploidy, hybridization
Akademický rok vypsání: 2014/2015
Typ práce: bakalářská práce
Jazyk práce: čeština
Ústav: Katedra botaniky (31-120)
Vedoucí / školitel: Mgr. Tomáš Fér, Ph.D.
Řešitel: Mgr. Jana Skopalíková - zadáno vedoucím/školitelem
Datum přihlášení: 26.11.2014
Datum zadání: 26.11.2014
Datum odevzdání elektronické podoby:14.08.2015
Datum proběhlé obhajoby: 10.09.2015
Oponenti: RNDr. Gabriela Šrámková, Ph.D.
 
 
 
Předběžná náplň práce
Práce formou rešerše shrne aktuálně používané metody next-generation sekvenování (NGS). Práce se zaměří především na metody, které se používají při konstrukci fylogenetických hypotéz, shrne jejich výhody a nevýhody a uvede příklady jejich aplikací (např. formou tabulky). Dále budou shrnuty specifika studia fylogeneze polyploidních skupin rostlin, krátce zhodnoceny klasické molekulární techniky používané v minulosti a bude diskutováno, v čem je přínos (ale také úskalí) použití právě NGS metod.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Thesis is a bibliographic search about actually used next-generation sequencing methods (NGS). Thesis will especially focus on methods applied in phylogenetics and summarizes their advantages and disadvantages. Summary of applications will be included as a table. Moreover, specificity of phylogenetics of polyploid plant species will be summarised. One chapter will recapitulate traditional molecular techniques and especially their applications in phylogenetics of polyploids. Finally, contribution and pitfalls of NGS methods especially in polyploid research will be discussed.
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK