Objasnění vlivu proteinkináz ERK1 a ERK2 na iniciaci translace nezávislé na čepičce

• Název práce v češtině: Objasnění vlivu proteinkináz ERK1 a ERK2 na iniciaci translace nezávislé na čepičce
• Název v anglickém jazyce: Elucidation of ERK1 and ERK2 protein kinases effect on cap-independent translation initiation
• Klíčová slova: ERK1, ERK2, iniciace translace nezávislá na čepičce, HCV, kináza
• Klíčová slova anglicky: ERK1, ERK2, cap-independent translation initiation, HCV, kinase
• Akademický rok vypsání: 2014/2015
• Typ práce: diplomová práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Vedoucí / školitel: Mgr. Václav Vopálenský, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 14.11.2014
• Datum zadání: 14.11.2014
• Datum odevzdání elektronické podoby: 14.08.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 13.09.2016
• Oponenti: Ing. Tomáš Vomastek, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Hlavním cílem práce je pokusit se charakterizovat možný vliv proteinkináz ERK1/2 na iniciaci translace nezávislou na čepičce. Jako model na čepičce nezávislé iniciace translace bude použito tzv. interní vazebné místo pro ribozom (IRES) z viru hepatitidy typu C (HCV), které je v naší laboratoři dobře etablováno. Řešitel této diplomové práce zavede v naší laboratoři metodu RNA interference, pomocí které bude selektivně umlčovat ERK1 nebo ERK2 proteinkinázu ve vybraných buněčných liniích. Dále bude připraven reportérový RNA konstrukt (reportérový gen pro kontrolou HCV-IRES), který bude paralelně transfekován společně s siRNA do tkáňových linií a bude monitorována případná změna aktivity reportérového proteinu. Pro úspěšné řešení této diplomové práce je nutno zvládnout metodiky RNA interference včetně designu vlastních siRNA, RNA transkripce, transfekce tkáňových kultur, western blot apod.