Proteiny rodiny Alba jsou vysoce konzervovány napříč všemi říšemi organismů.UArchae a eukaryotních organismů se podílí na metabolismu RNA, zatímco u skupinyCrenarchae sepojís dynamikou chromatinu. U eukaryot byly proteinyrodiny Alba studovány především u živočichů, kdejsou součástí podjednotky RNázy P/MRP. Vpředkládané práci se zabývám charakterizací proteinů rodiny Alba u modelové rostliny huseníčku rolního(Arabidopsis thaliana).U huseníčku bylo podle homologie nalezeno šest genů kódujících tři proteiny podrodiny Rpp20 a tři zpodrodiny Rpp25. Byla sledována lokalizace fúzních proteinůs GFPve stabilních liniích ekotypu Columbia-0 obsahujících konstrukty připravené klonovací metodou Gateway®Technology. Proteiny ALBA byly lokalizoványpouze vdiferenciační zóně kořene a samčím gametofytu. Nabuněčné úrovni byly pozoroványv cytoplazmě a zatím neurčených částicích. Vzhledem k jejich množství a pravděpodobné funkční redundancinebyly ujednoduchých mutant T-DNA inzerčních linií pozoroványvýznamné fenotypové defektyvrůstu a vývoji sporofytu ani gametofytu přisrovnánís rostlinami Columbia-0. Výskyt a expresní profily proteinů rodiny Alba odpovídají možnéfunkci vdiferenciaci a odpovědi na dehydrataci pozorované u rýže. U tabáku byly nalezeny skladované vEPPčásticíchvpřítomnosti translačně reprimovaných transkriptů. Ze získaných údajů lze předpokládat roli proteinů ALBA především v cytoplazmatickém metabolismu RNA vyvíjejících se pletiv.
Předběžná náplň práce v anglickém jazyce
Alba family proteins are highly conserved in all domains of life. They are involved in RNA metabolism in Archae and Eucarya, while they are involved in the chromatin organisation in Crenarchaea. In animals, ALBA proteins were identified to associate with RNase P/MRP subunits. The objective of my thesis was the characterization of ALBA family proteins in a model plantArabidopsis thaliana. TheArabidopsisgenome contains six genes with close homology, three from Rpp20-like subfamily and three of Rpp25-like subfamily. Here I present the localization of GFP-fused proteins inArabidopsisstable lines harbouring constructs cloned by Gateway®Technology. ALBA proteins were localized in the cytoplasm and undefined particles in root differentiation zone and in mature pollen. The characterization of the respective T-DNA insertion lines did not reveal significant phenotype defects in growth and development of sporophyte and gametophyte in comparison to Columbia-0 plants, probably because of likely functional redundancy od the paralogs. Expression profiles and localization of ALBA proteins suggest their possible role in differentiation and dehydration stress response inOryza. They were also observed to associate with repressed mRNA transcripts in storage EPP particles. Collectively, I propose the likely role of ALBA proteins in cytoplasmic RNA metabolism duringArabidopsisdevelopment.
