Mechanismus přenosu signálu hemovými senzorovými proteiny detekujícími kyslík

• Název práce v češtině: Mechanismus přenosu signálu hemovými senzorovými proteiny detekujícími kyslík
• Název v anglickém jazyce: Molecular mechanisms of signal transduction in model heme-containing oxygen sensor proteins
• Klíčová slova: hemové senzorové proteiny, senzorové enzymy pro plynné molekuly, přenos signálu, histidinkinasa s globinovou strukturou senzorové domény (AfGcHK), diguanylátcyklasa s globinovou strukturou senzorové domény (YddV), histidinkinasa, diguanylátcyklasa
• Klíčová slova anglicky: heme-containing sensor proteins, gas sensor enzymes, signal transduction, globin-coupled histidine kinase (AfGcHK), globin-coupled diguanylate cyclase (YddV)
• Akademický rok vypsání: 2012/2013
• Typ práce: disertační práce
• Jazyk práce: čeština
• Ústav: Katedra biochemie (31-250)
• Vedoucí / školitel: prof. RNDr. Markéta Martínková, Ph.D.
• Řešitel: skrytý - zadáno vedoucím/školitelem
• Datum přihlášení: 19.10.2012
• Datum zadání: 22.10.2012
• Datum a čas obhajoby: 19.09.2016 12:30
• Datum odevzdání elektronické podoby: 27.07.2016
• Datum proběhlé obhajoby: 19.09.2016
• Oponenti: prof. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.

Předběžná náplň práce

Senzorové proteiny obsahující hem jsou novou skupinou hemoproteinů s unikátními vlastnostmi. Tyto proteiny mají vždy minimálně dvě domény: senzorovou (hem detekující nebo plyn detekující prostřednictvím hemu) a funkční (často enzymově aktivní). Máme k dispozici dva modelové systémy - histidin kinasa spojená s globinovou strukturou (AfGcHK) a diguanylát cyklasa spojená s globinovou strukturou (YddV). Oba enzymy jsou kyslíkové senzory prostřednictvím hemu v senzorové doméně.
Cílem disertační práce bude přinést nové informace přispívající k objasnění způsobu interakce senzorové a funkční domény v modelových senzorových proteinech obsahujících hem - YddV a AfGcHK. Pro tento účel budou použity metody heterologní exprese, „site directed“ mutageneze, spektroskopické a enzymologické studie.